MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 37425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010475	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076637
2	NC_010475	AAC	3	9	50	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076637
3	NC_010475	ATT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076637
4	NC_010475	GCA	2	6	213	218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
5	NC_010475	GCG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076637
6	NC_010475	TTG	2	6	569	574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076637
7	NC_010475	GAC	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
8	NC_010475	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076637
9	NC_010475	CAA	2	6	772	777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076637
10	NC_010475	TCC	2	6	851	856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076637
11	NC_010475	CGG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076637
12	NC_010475	CGA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076637
13	NC_010475	AGT	2	6	1398	1403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010475	GTG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076638
15	NC_010475	GCG	2	6	1593	1598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
16	NC_010475	AAG	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076638
17	NC_010475	ATC	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076638
18	NC_010475	CGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076638
19	NC_010475	CAG	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076638
20	NC_010475	ACA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076638
21	NC_010475	GGC	2	6	1942	1947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
22	NC_010475	GCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
23	NC_010475	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076638
24	NC_010475	CCT	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076638
25	NC_010475	TGG	3	9	2094	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076638
26	NC_010475	CAA	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010475	ACA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010475	ATT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010475	TCC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010475	CCG	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076639
31	NC_010475	TAT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076639
32	NC_010475	AAG	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076639
33	NC_010475	ACG	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076640
34	NC_010475	GCC	3	9	2953	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076640
35	NC_010475	TAA	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010475	CAA	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076642
37	NC_010475	GCA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076642
38	NC_010475	CCT	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076642
39	NC_010475	GTC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076642
40	NC_010475	GGC	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076642
41	NC_010475	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076642
42	NC_010475	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076642
43	NC_010475	CGC	2	6	4038	4043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076642
44	NC_010475	AAT	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076642
45	NC_010475	CGC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076643
46	NC_010475	CGC	2	6	4283	4288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076643
47	NC_010475	ATG	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076643
48	NC_010475	GGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076643
49	NC_010475	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076643
50	NC_010475	AAT	2	6	4916	4921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076644
51	NC_010475	ATC	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076644
52	NC_010475	AAT	2	6	5042	5047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076644
53	NC_010475	ACG	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076644
54	NC_010475	CTT	2	6	5179	5184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076644
55	NC_010475	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010475	CCA	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076645
57	NC_010475	ATC	2	6	5406	5411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076645
58	NC_010475	TGC	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076645
59	NC_010475	GTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076645
60	NC_010475	TAT	2	6	5662	5667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010475	GGC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010475	GAC	3	9	5744	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
63	NC_010475	CAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
64	NC_010475	GGC	2	6	6002	6007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076646
65	NC_010475	CGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
66	NC_010475	ATG	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076646
67	NC_010475	CTG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076646
68	NC_010475	CAA	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
69	NC_010475	CGA	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
70	NC_010475	CAA	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076646
71	NC_010475	GGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076646
72	NC_010475	AAT	2	6	6486	6491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076646
73	NC_010475	ACG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076646
74	NC_010475	CTC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076646
75	NC_010475	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076646
76	NC_010475	GTC	2	6	6831	6836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010475	AGG	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010475	AGG	2	6	6905	6910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010475	GAT	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010475	GAA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076647
81	NC_010475	GGA	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076647
82	NC_010475	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076647
83	NC_010475	ATC	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076647
84	NC_010475	CAG	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076647
85	NC_010475	CCA	2	6	7330	7335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076647
86	NC_010475	ATT	2	6	7447	7452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076647
87	NC_010475	AAT	2	6	7691	7696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010475	TAG	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076648
89	NC_010475	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076648
90	NC_010475	AAG	2	6	8034	8039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076648
91	NC_010475	TAT	2	6	8236	8241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076648
92	NC_010475	GCC	2	6	8273	8278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076648
93	NC_010475	ATA	2	6	8312	8317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
94	NC_010475	TTA	2	6	8435	8440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076649
95	NC_010475	ATA	2	6	8459	8464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
96	NC_010475	CTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076649
97	NC_010475	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
98	NC_010475	AGC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076649
99	NC_010475	ATA	2	6	8831	8836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
100	NC_010475	CTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076649
101	NC_010475	AGA	2	6	9015	9020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
102	NC_010475	TTC	2	6	9041	9046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076649
103	NC_010475	CTT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076649
104	NC_010475	GAA	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
105	NC_010475	ATT	2	6	9172	9177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076649
106	NC_010475	AAT	2	6	9226	9231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
107	NC_010475	AAT	2	6	9262	9267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076649
108	NC_010475	ATT	2	6	9303	9308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076649
109	NC_010475	GCA	2	6	9321	9326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076649
110	NC_010475	CAA	2	6	9346	9351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076649
111	NC_010475	GAA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076649
112	NC_010475	ATG	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076649
113	NC_010475	TCA	2	6	9519	9524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076649
114	NC_010475	GAT	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076649
115	NC_010475	ATA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010475	TTG	2	6	9709	9714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010475	GAA	2	6	9753	9758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076650
118	NC_010475	TCT	2	6	9919	9924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076650
119	NC_010475	CGG	2	6	9954	9959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076650
120	NC_010475	TGA	3	9	10031	10039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076650
121	NC_010475	CGG	2	6	10066	10071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076650
122	NC_010475	GGA	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076650
123	NC_010475	GCG	2	6	10176	10181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076650
124	NC_010475	CTA	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076650
125	NC_010475	GCT	2	6	10364	10369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076650
126	NC_010475	GGC	2	6	10373	10378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076650
127	NC_010475	AGC	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076650
128	NC_010475	GAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010475	GTG	2	6	10534	10539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010475	GTT	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076651
131	NC_010475	CAA	2	6	10654	10659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076651
132	NC_010475	ATG	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076651
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148	NC_010475	CTT	2	6	12284	12289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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