MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	AGGT	2	8	1361	1368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010474	ACCT	2	8	1373	1380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010474	AAAC	2	8	7435	7442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010474	ACGG	2	8	7581	7588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010474	TGAT	2	8	7625	7632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010474	AGTT	2	8	12503	12510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010474	GATG	2	8	14733	14740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010474	TGTT	2	8	14777	14784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010474	AATT	2	8	14809	14816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010474	TACC	2	8	21514	21521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010474	GCTT	2	8	22000	22007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010474	ATTT	2	8	23300	23307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010474	AATT	2	8	23373	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010474	TTAA	2	8	25864	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010474	TGAT	2	8	32317	32324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010474	TTTA	2	8	33985	33992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010474	AGTT	2	8	34055	34062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010474	TTAA	2	8	35069	35076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010474	TTGA	2	8	39698	39705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010474	CGAC	2	8	39790	39797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010474	TTTC	2	8	42799	42806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010474	CTTT	2	8	43410	43417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010474	TAAA	2	8	44223	44230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010474	AAAT	2	8	46435	46442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010474	ACCA	2	8	46825	46832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010474	TTGT	2	8	48463	48470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010474	AAGA	2	8	48544	48551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010474	GCGG	2	8	48857	48864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010474	ATTC	2	8	49490	49497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010474	TGCT	2	8	54158	54165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010474	AGTT	2	8	54188	54195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010474	AAAG	2	8	55967	55974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010474	CTAA	2	8	61112	61119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010474	AAAT	2	8	61371	61378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010474	ATAA	2	8	61385	61392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010474	GGAA	2	8	64936	64943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010474	ATTG	2	8	65046	65053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010474	TAAC	2	8	65540	65547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010474	TTTG	2	8	67575	67582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010474	TTTA	2	8	67700	67707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010474	AGGG	2	8	67720	67727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010474	AGGC	2	8	67998	68005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010474	CTTT	2	8	68099	68106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010474	ATTT	2	8	77990	77997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010474	TTGA	2	8	81098	81105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010474	GATT	2	8	81276	81283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010474	ACTG	2	8	84713	84720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010474	CCGT	2	8	84834	84841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010474	TGTC	2	8	84853	84860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010474	CCGA	2	8	88947	88954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010474	TTAT	2	8	89029	89036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010474	GCTT	2	8	89075	89082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010474	TAGC	2	8	89152	89159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010474	AATT	2	8	89248	89255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010474	ATTT	2	8	91394	91401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010474	CTTT	2	8	94549	94556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010474	ATTT	2	8	102229	102236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010474	ATTG	2	8	111086	111093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010474	ATGT	2	8	111182	111189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010474	ACTC	2	8	118222	118229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010474	ACTT	2	8	118243	118250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010474	TCCA	2	8	118421	118428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010474	TTGT	2	8	119472	119479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010474	CAAG	2	8	119645	119652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010474	AATC	2	8	125962	125969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010474	TCCA	2	8	126545	126552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010474	TTTA	2	8	128676	128683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010474	GTTG	2	8	130796	130803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010474	TCAT	2	8	138624	138631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010474	TATT	2	8	144577	144584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010474	GAAG	2	8	145108	145115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010474	TATT	2	8	146188	146195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010474	CTTT	2	8	146218	146225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010474	ATTT	2	8	146296	146303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010474	TAAT	2	8	146459	146466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010474	GGAA	2	8	146507	146514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010474	CAGT	2	8	147888	147895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010474	CAAC	2	8	147946	147953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010474	TTAA	2	8	149926	149933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010474	TTTA	2	8	150570	150577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010474	TGAA	2	8	151866	151873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010474	TTTC	2	8	152101	152108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010474	ACCT	2	8	153554	153561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010474	ATGG	2	8	156726	156733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010474	ATTG	2	8	157682	157689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010474	ATAA	2	8	163373	163380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010474	CGGA	2	8	164408	164415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010474	TCTT	2	8	164543	164550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010474	GGAT	2	8	167980	167987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010474	ATTA	2	8	175515	175522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010474	GATT	2	8	175578	175585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010474	AATT	2	8	179782	179789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010474	TAAA	2	8	180035	180042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010474	GTGG	2	8	180802	180809	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010474	TAAT	2	8	183255	183262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010474	ACAG	2	8	185984	185991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.