MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	CAAC	2	8	626	633	50 %	0 %	0 %	50 %	170076472
2	NC_010474	ACCT	2	8	1193	1200	25 %	25 %	0 %	50 %	170076472
3	NC_010474	TTCT	2	8	1672	1679	0 %	75 %	0 %	25 %	170076474
4	NC_010474	TGCC	2	8	1751	1758	0 %	25 %	25 %	50 %	170076474
5	NC_010474	GCCA	2	8	2498	2505	25 %	0 %	25 %	50 %	170076473
6	NC_010474	CAAA	2	8	2913	2920	75 %	0 %	0 %	25 %	170076475
7	NC_010474	CTCC	2	8	3256	3263	0 %	25 %	0 %	75 %	170076475
8	NC_010474	TGAT	2	8	4228	4235	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
9	NC_010474	GGTT	2	8	4313	4320	0 %	50 %	50 %	0 %	170076476
10	NC_010474	CAAA	2	8	4413	4420	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
11	NC_010474	GATC	2	8	4536	4543	25 %	25 %	25 %	25 %	170076476
12	NC_010474	TTGA	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
13	NC_010474	AAAC	2	8	5815	5822	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
14	NC_010474	GGGC	2	8	6126	6133	0 %	0 %	75 %	25 %	170076476
15	NC_010474	AATT	2	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	170076477
16	NC_010474	GATC	2	8	6857	6864	25 %	25 %	25 %	25 %	170076477
17	NC_010474	GAAG	2	8	6917	6924	50 %	0 %	50 %	0 %	170076477
18	NC_010474	ATTG	2	8	7060	7067	25 %	50 %	25 %	0 %	170076477
19	NC_010474	AATT	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	170076478
20	NC_010474	GCTA	2	8	8042	8049	25 %	25 %	25 %	25 %	170076478
21	NC_010474	TGCC	2	8	8560	8567	0 %	25 %	25 %	50 %	170076478
22	NC_010474	GATC	2	8	8635	8642	25 %	25 %	25 %	25 %	170076478
23	NC_010474	GTTT	2	8	9589	9596	0 %	75 %	25 %	0 %	170076478
24	NC_010474	CAAG	2	8	10417	10424	50 %	0 %	25 %	25 %	170076478
25	NC_010474	AATT	2	8	11739	11746	50 %	50 %	0 %	0 %	170076480
26	NC_010474	TCCA	2	8	11874	11881	25 %	25 %	0 %	50 %	170076480
27	NC_010474	CAAA	2	8	12732	12739	75 %	0 %	0 %	25 %	170076481
28	NC_010474	AGCC	2	8	13092	13099	25 %	0 %	25 %	50 %	170076481
29	NC_010474	AATT	2	8	14148	14155	50 %	50 %	0 %	0 %	170076481
30	NC_010474	TCAC	2	8	15012	15019	25 %	25 %	0 %	50 %	170076482
31	NC_010474	CGTG	2	8	15403	15410	0 %	25 %	50 %	25 %	170076482
32	NC_010474	CCGC	2	8	16089	16096	0 %	0 %	25 %	75 %	170076482
33	NC_010474	CCGG	2	8	16618	16625	0 %	0 %	50 %	50 %	170076482
34	NC_010474	TCTG	2	8	16777	16784	0 %	50 %	25 %	25 %	170076482
35	NC_010474	GGTA	2	8	17590	17597	25 %	25 %	50 %	0 %	170076482
36	NC_010474	TCGG	2	8	18660	18667	0 %	25 %	50 %	25 %	170076484
37	NC_010474	TTGT	2	8	19147	19154	0 %	75 %	25 %	0 %	170076484
38	NC_010474	CAAC	2	8	21255	21262	50 %	0 %	0 %	50 %	170076486
39	NC_010474	ATTA	2	8	22321	22328	50 %	50 %	0 %	0 %	170076488
40	NC_010474	TAAT	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	170076488
41	NC_010474	AAAT	2	8	24324	24331	75 %	25 %	0 %	0 %	170076489
42	NC_010474	AACT	2	8	24625	24632	50 %	25 %	0 %	25 %	170076489
43	NC_010474	GGAT	2	8	25011	25018	25 %	25 %	50 %	0 %	170076489
44	NC_010474	TAGA	2	8	25027	25034	50 %	25 %	25 %	0 %	170076489
45	NC_010474	CCAA	2	8	25281	25288	50 %	0 %	0 %	50 %	170076489
46	NC_010474	TTGC	2	8	25303	25310	0 %	50 %	25 %	25 %	170076489
47	NC_010474	TTTG	2	8	25443	25450	0 %	75 %	25 %	0 %	170076489
48	NC_010474	CATA	2	8	25746	25753	50 %	25 %	0 %	25 %	170076489
49	NC_010474	TAAA	2	8	26126	26133	75 %	25 %	0 %	0 %	170076490
50	NC_010474	AAGA	2	8	26163	26170	75 %	0 %	25 %	0 %	170076490
51	NC_010474	TCTT	2	8	26724	26731	0 %	75 %	0 %	25 %	170076490
52	NC_010474	CAAA	2	8	27067	27074	75 %	0 %	0 %	25 %	170076490
53	NC_010474	AATT	2	8	27580	27587	50 %	50 %	0 %	0 %	170076491
54	NC_010474	TTCG	2	8	28302	28309	0 %	50 %	25 %	25 %	170076491
55	NC_010474	CTTT	2	8	28836	28843	0 %	75 %	0 %	25 %	170076492
56	NC_010474	AAAG	2	8	28958	28965	75 %	0 %	25 %	0 %	170076492
57	NC_010474	CAAT	2	8	29589	29596	50 %	25 %	0 %	25 %	170076493
58	NC_010474	GAGG	2	8	30706	30713	25 %	0 %	75 %	0 %	170076493
59	NC_010474	TCAA	2	8	31157	31164	50 %	25 %	0 %	25 %	170076494
60	NC_010474	GCTG	2	8	33168	33175	0 %	25 %	50 %	25 %	170076495
61	NC_010474	ATCT	2	8	34340	34347	25 %	50 %	0 %	25 %	170076496
62	NC_010474	AGTT	2	8	34711	34718	25 %	50 %	25 %	0 %	170076496
63	NC_010474	TAAA	2	8	35454	35461	75 %	25 %	0 %	0 %	170076497
64	NC_010474	TGTT	2	8	35506	35513	0 %	75 %	25 %	0 %	170076497
65	NC_010474	ACCA	2	8	35520	35527	50 %	0 %	0 %	50 %	170076497
66	NC_010474	TTTG	2	8	35718	35725	0 %	75 %	25 %	0 %	170076497
67	NC_010474	GGTG	2	8	35828	35835	0 %	25 %	75 %	0 %	170076497
68	NC_010474	ATCC	2	8	36247	36254	25 %	25 %	0 %	50 %	170076498
69	NC_010474	TGGT	2	8	36454	36461	0 %	50 %	50 %	0 %	170076498
70	NC_010474	GGCG	2	8	37298	37305	0 %	0 %	75 %	25 %	170076500
71	NC_010474	TGCA	2	8	38366	38373	25 %	25 %	25 %	25 %	170076501
72	NC_010474	CTTC	2	8	38391	38398	0 %	50 %	0 %	50 %	170076501
73	NC_010474	TTAG	2	8	38571	38578	25 %	50 %	25 %	0 %	170076501
74	NC_010474	AAAC	2	8	38690	38697	75 %	0 %	0 %	25 %	170076502
75	NC_010474	ATCA	2	8	40435	40442	50 %	25 %	0 %	25 %	170076503
76	NC_010474	CTTG	2	8	40576	40583	0 %	50 %	25 %	25 %	170076504
77	NC_010474	CCGA	2	8	40858	40865	25 %	0 %	25 %	50 %	170076505
78	NC_010474	CAGG	2	8	41259	41266	25 %	0 %	50 %	25 %	170076505
79	NC_010474	GTTT	2	8	41618	41625	0 %	75 %	25 %	0 %	170076505
80	NC_010474	CGAA	2	8	41747	41754	50 %	0 %	25 %	25 %	170076505
81	NC_010474	AATT	2	8	42133	42140	50 %	50 %	0 %	0 %	170076506
82	NC_010474	ATCT	2	8	43454	43461	25 %	50 %	0 %	25 %	170076508
83	NC_010474	CTTC	2	8	43621	43628	0 %	50 %	0 %	50 %	170076509
84	NC_010474	GATA	2	8	43636	43643	50 %	25 %	25 %	0 %	170076509
85	NC_010474	CCAT	2	8	43788	43795	25 %	25 %	0 %	50 %	170076509
86	NC_010474	GAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	50 %	25 %	170076509
87	NC_010474	CATC	2	8	44491	44498	25 %	25 %	0 %	50 %	170076510
88	NC_010474	GTCA	2	8	45120	45127	25 %	25 %	25 %	25 %	170076511
89	NC_010474	TATG	2	8	45494	45501	25 %	50 %	25 %	0 %	170076511
90	NC_010474	TCAA	2	8	46174	46181	50 %	25 %	0 %	25 %	170076511
91	NC_010474	TGGG	2	8	46636	46643	0 %	25 %	75 %	0 %	170076512
92	NC_010474	AGAA	2	8	47597	47604	75 %	0 %	25 %	0 %	170076513
93	NC_010474	CAAC	2	8	47721	47728	50 %	0 %	0 %	50 %	170076513
94	NC_010474	CAAC	2	8	48084	48091	50 %	0 %	0 %	50 %	170076514
95	NC_010474	ATGA	2	8	48240	48247	50 %	25 %	25 %	0 %	170076514
96	NC_010474	GCCT	2	8	49386	49393	0 %	25 %	25 %	50 %	170076515
97	NC_010474	GCAA	2	8	49585	49592	50 %	0 %	25 %	25 %	170076516
98	NC_010474	CCTG	2	8	50096	50103	0 %	25 %	25 %	50 %	170076517
99	NC_010474	GTTT	2	8	50415	50422	0 %	75 %	25 %	0 %	170076518
100	NC_010474	ATCA	2	8	50827	50834	50 %	25 %	0 %	25 %	170076519
101	NC_010474	ATCA	2	8	50944	50951	50 %	25 %	0 %	25 %	170076519
102	NC_010474	TCAC	2	8	51482	51489	25 %	25 %	0 %	50 %	170076520
103	NC_010474	CCTA	2	8	52859	52866	25 %	25 %	0 %	50 %	170076522
104	NC_010474	TACC	2	8	52959	52966	25 %	25 %	0 %	50 %	170076522
105	NC_010474	CTTG	2	8	53334	53341	0 %	50 %	25 %	25 %	170076523
106	NC_010474	ACAA	2	8	54484	54491	75 %	0 %	0 %	25 %	170076524
107	NC_010474	ATAC	2	8	54562	54569	50 %	25 %	0 %	25 %	170076524
108	NC_010474	TCCT	2	8	54738	54745	0 %	50 %	0 %	50 %	170076524
109	NC_010474	TCGG	2	8	54813	54820	0 %	25 %	50 %	25 %	170076524
110	NC_010474	TAGT	2	8	55273	55280	25 %	50 %	25 %	0 %	170076524
111	NC_010474	AGTA	2	8	55885	55892	50 %	25 %	25 %	0 %	170076525
112	NC_010474	AAAG	2	8	55896	55903	75 %	0 %	25 %	0 %	170076525
113	NC_010474	ATTC	2	8	56072	56079	25 %	50 %	0 %	25 %	170076526
114	NC_010474	ATGA	2	8	56814	56821	50 %	25 %	25 %	0 %	170076528
115	NC_010474	CAGA	2	8	57432	57439	50 %	0 %	25 %	25 %	170076529
116	NC_010474	CAGC	2	8	58263	58270	25 %	0 %	25 %	50 %	170076529
117	NC_010474	CCCA	2	8	59156	59163	25 %	0 %	0 %	75 %	170076529
118	NC_010474	TGCC	2	8	59770	59777	0 %	25 %	25 %	50 %	170076530
119	NC_010474	TAGG	2	8	59954	59961	25 %	25 %	50 %	0 %	170076530
120	NC_010474	CAGC	2	8	60254	60261	25 %	0 %	25 %	50 %	170076530
121	NC_010474	TGAT	2	8	60577	60584	25 %	50 %	25 %	0 %	170076530
122	NC_010474	CATT	2	8	61499	61506	25 %	50 %	0 %	25 %	170076531
123	NC_010474	GATG	2	8	62024	62031	25 %	25 %	50 %	0 %	170076531
124	NC_010474	ACTC	2	8	62084	62091	25 %	25 %	0 %	50 %	170076531
125	NC_010474	TTTG	2	8	62366	62373	0 %	75 %	25 %	0 %	170076531
126	NC_010474	CAAG	2	8	62707	62714	50 %	0 %	25 %	25 %	170076532
127	NC_010474	TTAA	2	8	63215	63222	50 %	50 %	0 %	0 %	170076532
128	NC_010474	CGAT	2	8	63249	63256	25 %	25 %	25 %	25 %	170076532
129	NC_010474	TCTG	2	8	64247	64254	0 %	50 %	25 %	25 %	170076534
130	NC_010474	GGTC	2	8	65200	65207	0 %	25 %	50 %	25 %	170076535
131	NC_010474	CCAG	2	8	66446	66453	25 %	0 %	25 %	50 %	170076536
132	NC_010474	TGCC	2	8	66922	66929	0 %	25 %	25 %	50 %	170076536
133	NC_010474	TTTA	2	8	68800	68807	25 %	75 %	0 %	0 %	170076537
134	NC_010474	CTAC	2	8	68875	68882	25 %	25 %	0 %	50 %	170076537
135	NC_010474	CTGC	2	8	69031	69038	0 %	25 %	25 %	50 %	170076537
136	NC_010474	CCGA	2	8	69919	69926	25 %	0 %	25 %	50 %	170076537
137	NC_010474	TTCT	2	8	70334	70341	0 %	75 %	0 %	25 %	170076537
138	NC_010474	TTCC	2	8	70714	70721	0 %	50 %	0 %	50 %	170076537
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.