MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 2290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	TGG	2	6	71	76	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
2	NC_010474	CGC	2	6	136	141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
3	NC_010474	GAT	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076471
4	NC_010474	CCG	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
5	NC_010474	GTG	3	9	289	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
6	NC_010474	CTA	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076471
7	NC_010474	AGC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076471
8	NC_010474	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076471
9	NC_010474	CCG	2	6	652	657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076472
10	NC_010474	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076472
11	NC_010474	GTG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076472
12	NC_010474	CGG	3	9	949	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
13	NC_010474	GAA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076472
14	NC_010474	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
15	NC_010474	CTG	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076472
16	NC_010474	AAC	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076472
17	NC_010474	CTC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076472
18	NC_010474	ACC	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076472
19	NC_010474	TAT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
20	NC_010474	TGG	2	6	1547	1552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
21	NC_010474	ATT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
22	NC_010474	TGG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
23	NC_010474	GGT	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
24	NC_010474	CGA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076474
25	NC_010474	CAT	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076474
26	NC_010474	GGC	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
27	NC_010474	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076473
28	NC_010474	GTT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076473
29	NC_010474	GCG	2	6	2447	2452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
30	NC_010474	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
31	NC_010474	ACT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
32	NC_010474	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
33	NC_010474	ATC	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
34	NC_010474	CAC	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076475
35	NC_010474	CTT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076475
36	NC_010474	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
37	NC_010474	GAC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076475
38	NC_010474	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
39	NC_010474	CCA	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
40	NC_010474	TCT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
41	NC_010474	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
42	NC_010474	CCT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
43	NC_010474	GAA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
44	NC_010474	CCA	2	6	4563	4568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
45	NC_010474	GTT	2	6	4650	4655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
46	NC_010474	GGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076476
47	NC_010474	ATA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
48	NC_010474	CCT	3	9	4982	4990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
49	NC_010474	TGT	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
50	NC_010474	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
51	NC_010474	ACT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
52	NC_010474	AAT	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
53	NC_010474	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
54	NC_010474	AGC	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076476
55	NC_010474	TAA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
56	NC_010474	TAA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
57	NC_010474	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
58	NC_010474	ACC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
59	NC_010474	AAT	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
60	NC_010474	CGT	3	9	6046	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076476
61	NC_010474	AAT	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
62	NC_010474	CAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
63	NC_010474	TTG	2	6	6193	6198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
64	NC_010474	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010474	GTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
66	NC_010474	TGT	2	6	6413	6418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
67	NC_010474	TAG	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
68	NC_010474	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076477
69	NC_010474	AAT	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
70	NC_010474	GCG	2	6	6875	6880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076477
71	NC_010474	AAT	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
72	NC_010474	TCA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076477
73	NC_010474	GAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
74	NC_010474	TCG	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076477
75	NC_010474	TAG	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010474	ATT	2	6	7374	7379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010474	CAT	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010474	CAA	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010474	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010474	TTG	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010474	GTT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010474	GAC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
83	NC_010474	AAT	2	6	7940	7945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076478
84	NC_010474	ACT	2	6	7967	7972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
85	NC_010474	GAT	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076478
86	NC_010474	GAT	2	6	8227	8232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076478
87	NC_010474	GGC	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076478
88	NC_010474	ACG	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
89	NC_010474	CAG	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
90	NC_010474	CAC	2	6	8525	8530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076478
91	NC_010474	CAA	2	6	8689	8694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076478
92	NC_010474	ACC	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076478
93	NC_010474	TTC	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076478
94	NC_010474	CGC	2	6	8848	8853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076478
95	NC_010474	TCG	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076478
96	NC_010474	ATG	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076478
97	NC_010474	GTT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076478
98	NC_010474	CAT	2	6	9391	9396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
99	NC_010474	ACG	2	6	9480	9485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
100	NC_010474	TCA	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
101	NC_010474	GCT	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076478
102	NC_010474	AAT	2	6	9679	9684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076478
103	NC_010474	ATC	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
104	NC_010474	CCG	2	6	9949	9954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076478
105	NC_010474	ATT	2	6	10055	10060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076478
106	NC_010474	CTT	2	6	10064	10069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076478
107	NC_010474	TGT	2	6	10113	10118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076478
108	NC_010474	GTG	2	6	10191	10196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076478
109	NC_010474	CAC	2	6	10319	10324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076478
110	NC_010474	CAT	2	6	10402	10407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
111	NC_010474	CGC	2	6	10576	10581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076479
112	NC_010474	TTC	2	6	10658	10663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076479
113	NC_010474	ATA	2	6	10769	10774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076479
114	NC_010474	CCA	2	6	10810	10815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076479
115	NC_010474	ATT	2	6	10873	10878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010474	CTG	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010474	ATT	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010474	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010474	TAA	2	6	11125	11130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010474	TAT	2	6	11145	11150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010474	GGA	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010474	GAC	2	6	11249	11254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010474	TAT	2	6	11514	11519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010474	AGG	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010474	AAT	2	6	11904	11909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076480
126	NC_010474	TCT	2	6	11917	11922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076480
127	NC_010474	AAT	2	6	11937	11942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076480
128	NC_010474	AAC	2	6	11969	11974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076480
129	NC_010474	GTA	2	6	11975	11980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076480
130	NC_010474	TGC	2	6	12076	12081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076480
131	NC_010474	CAT	2	6	12125	12130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076480
132	NC_010474	CAA	2	6	12144	12149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076480
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134	NC_010474	TAA	2	6	12270	12275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076480
135	NC_010474	CGC	2	6	12345	12350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076480
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137	NC_010474	CAA	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010474	CTA	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_010474	CCG	2	6	22768	22773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076488
260	NC_010474	CCA	2	6	22797	22802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076488
261	NC_010474	GCT	2	6	22836	22841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076488
262	NC_010474	CAT	2	6	22873	22878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076488
263	NC_010474	ACC	2	6	23003	23008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076488
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267	NC_010474	ATC	2	6	23474	23479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076489
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270	NC_010474	CTG	2	6	23736	23741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076489
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299	NC_010474	CAT	2	6	25898	25903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076490
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500	NC_010474	TGG	3	9	41419	41427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076505

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