MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	TG	3	6	286	291	0 %	50 %	50 %	0 %	170076471
2	NC_010474	CG	3	6	2309	2314	0 %	0 %	50 %	50 %	170076473
3	NC_010474	AG	3	6	3175	3180	50 %	0 %	50 %	0 %	170076475
4	NC_010474	TC	3	6	3571	3576	0 %	50 %	0 %	50 %	170076475
5	NC_010474	TC	3	6	3900	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
6	NC_010474	TC	3	6	5374	5379	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
7	NC_010474	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	170076476
8	NC_010474	CT	3	6	6739	6744	0 %	50 %	0 %	50 %	170076477
9	NC_010474	TC	3	6	8069	8074	0 %	50 %	0 %	50 %	170076478
10	NC_010474	GC	3	6	9269	9274	0 %	0 %	50 %	50 %	170076478
11	NC_010474	GA	3	6	9825	9830	50 %	0 %	50 %	0 %	170076478
12	NC_010474	CG	3	6	10089	10094	0 %	0 %	50 %	50 %	170076478
13	NC_010474	GA	3	6	11729	11734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010474	CT	3	6	11962	11967	0 %	50 %	0 %	50 %	170076480
15	NC_010474	AT	3	6	12409	12414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010474	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	170076481
17	NC_010474	AT	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010474	GA	3	6	14469	14474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010474	CT	3	6	15281	15286	0 %	50 %	0 %	50 %	170076482
20	NC_010474	AC	3	6	16161	16166	50 %	0 %	0 %	50 %	170076482
21	NC_010474	GC	3	6	16555	16560	0 %	0 %	50 %	50 %	170076482
22	NC_010474	GC	3	6	17056	17061	0 %	0 %	50 %	50 %	170076482
23	NC_010474	CT	3	6	19614	19619	0 %	50 %	0 %	50 %	170076485
24	NC_010474	CA	3	6	19863	19868	50 %	0 %	0 %	50 %	170076485
25	NC_010474	CA	3	6	20800	20805	50 %	0 %	0 %	50 %	170076486
26	NC_010474	CA	3	6	21941	21946	50 %	0 %	0 %	50 %	170076487
27	NC_010474	AT	3	6	23345	23350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010474	GT	3	6	23459	23464	0 %	50 %	50 %	0 %	170076489
29	NC_010474	TC	3	6	23668	23673	0 %	50 %	0 %	50 %	170076489
30	NC_010474	AT	3	6	26591	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	170076490
31	NC_010474	TG	3	6	26682	26687	0 %	50 %	50 %	0 %	170076490
32	NC_010474	AG	3	6	27506	27511	50 %	0 %	50 %	0 %	170076491
33	NC_010474	CT	4	8	28716	28723	0 %	50 %	0 %	50 %	170076492
34	NC_010474	GA	3	6	29565	29570	50 %	0 %	50 %	0 %	170076493
35	NC_010474	GC	3	6	32719	32724	0 %	0 %	50 %	50 %	170076495
36	NC_010474	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010474	TC	3	6	33954	33959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010474	TA	3	6	35041	35046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010474	CT	3	6	35180	35185	0 %	50 %	0 %	50 %	170076497
40	NC_010474	AT	3	6	37159	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	170076499
41	NC_010474	CG	3	6	40092	40097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010474	CG	3	6	40895	40900	0 %	0 %	50 %	50 %	170076505
43	NC_010474	GC	3	6	41078	41083	0 %	0 %	50 %	50 %	170076505
44	NC_010474	GA	3	6	42735	42740	50 %	0 %	50 %	0 %	170076506
45	NC_010474	CG	3	6	44139	44144	0 %	0 %	50 %	50 %	170076509
46	NC_010474	CT	3	6	44541	44546	0 %	50 %	0 %	50 %	170076510
47	NC_010474	AG	3	6	45929	45934	50 %	0 %	50 %	0 %	170076511
48	NC_010474	CA	3	6	48723	48728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010474	GA	3	6	50306	50311	50 %	0 %	50 %	0 %	170076518
50	NC_010474	CA	3	6	50324	50329	50 %	0 %	0 %	50 %	170076518
51	NC_010474	AG	3	6	51462	51467	50 %	0 %	50 %	0 %	170076520
52	NC_010474	AT	3	6	51476	51481	50 %	50 %	0 %	0 %	170076520
53	NC_010474	AT	3	6	52019	52024	50 %	50 %	0 %	0 %	170076521
54	NC_010474	GA	3	6	52080	52085	50 %	0 %	50 %	0 %	170076521
55	NC_010474	AC	3	6	52470	52475	50 %	0 %	0 %	50 %	170076521
56	NC_010474	AG	3	6	53414	53419	50 %	0 %	50 %	0 %	170076523
57	NC_010474	GC	3	6	56476	56481	0 %	0 %	50 %	50 %	170076528
58	NC_010474	GT	3	6	59267	59272	0 %	50 %	50 %	0 %	170076529
59	NC_010474	AT	3	6	60001	60006	50 %	50 %	0 %	0 %	170076530
60	NC_010474	CA	3	6	60067	60072	50 %	0 %	0 %	50 %	170076530
61	NC_010474	GA	3	6	73764	73769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010474	AC	3	6	73908	73913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010474	AG	3	6	74155	74160	50 %	0 %	50 %	0 %	170076538
64	NC_010474	CT	3	6	75491	75496	0 %	50 %	0 %	50 %	170076539
65	NC_010474	TG	3	6	77880	77885	0 %	50 %	50 %	0 %	170076539
66	NC_010474	TC	4	8	78393	78400	0 %	50 %	0 %	50 %	170076540
67	NC_010474	AG	3	6	79960	79965	50 %	0 %	50 %	0 %	170076541
68	NC_010474	TC	3	6	80620	80625	0 %	50 %	0 %	50 %	170076542
69	NC_010474	CT	4	8	81129	81136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010474	AG	3	6	83374	83379	50 %	0 %	50 %	0 %	170076543
71	NC_010474	GA	3	6	83525	83530	50 %	0 %	50 %	0 %	170076543
72	NC_010474	CA	3	6	84160	84165	50 %	0 %	0 %	50 %	170076543
73	NC_010474	GA	3	6	84903	84908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010474	AC	3	6	84943	84948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010474	AC	3	6	86744	86749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010474	AT	3	6	87389	87394	50 %	50 %	0 %	0 %	170076547
77	NC_010474	TG	3	6	88204	88209	0 %	50 %	50 %	0 %	170076547
78	NC_010474	CT	3	6	90317	90322	0 %	50 %	0 %	50 %	170076549
79	NC_010474	CT	5	10	91318	91327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010474	TG	3	6	91440	91445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010474	CT	3	6	92247	92252	0 %	50 %	0 %	50 %	170076551
82	NC_010474	CT	3	6	93132	93137	0 %	50 %	0 %	50 %	170076551
83	NC_010474	GC	3	6	97851	97856	0 %	0 %	50 %	50 %	170076557
84	NC_010474	CA	3	6	98969	98974	50 %	0 %	0 %	50 %	170076558
85	NC_010474	AG	3	6	100508	100513	50 %	0 %	50 %	0 %	170076559
86	NC_010474	GC	3	6	101021	101026	0 %	0 %	50 %	50 %	170076560
87	NC_010474	AG	3	6	102497	102502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010474	TC	3	6	104034	104039	0 %	50 %	0 %	50 %	170076563
89	NC_010474	GA	3	6	104121	104126	50 %	0 %	50 %	0 %	170076563
90	NC_010474	CT	3	6	105089	105094	0 %	50 %	0 %	50 %	170076564
91	NC_010474	GA	3	6	105548	105553	50 %	0 %	50 %	0 %	170076565
92	NC_010474	CA	3	6	106107	106112	50 %	0 %	0 %	50 %	170076565
93	NC_010474	GA	3	6	106823	106828	50 %	0 %	50 %	0 %	170076566
94	NC_010474	TA	3	6	107303	107308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010474	CA	3	6	108416	108421	50 %	0 %	0 %	50 %	170076567
96	NC_010474	AG	3	6	109168	109173	50 %	0 %	50 %	0 %	170076568
97	NC_010474	AG	4	8	111566	111573	50 %	0 %	50 %	0 %	170076569
98	NC_010474	AT	3	6	111640	111645	50 %	50 %	0 %	0 %	170076569
99	NC_010474	TA	3	6	111713	111718	50 %	50 %	0 %	0 %	170076569
100	NC_010474	AG	3	6	113102	113107	50 %	0 %	50 %	0 %	170076570
101	NC_010474	AG	3	6	114356	114361	50 %	0 %	50 %	0 %	170076571
102	NC_010474	CA	3	6	115583	115588	50 %	0 %	0 %	50 %	170076572
103	NC_010474	GC	3	6	115860	115865	0 %	0 %	50 %	50 %	170076573
104	NC_010474	TA	3	6	116653	116658	50 %	50 %	0 %	0 %	170076573
105	NC_010474	GT	3	6	116680	116685	0 %	50 %	50 %	0 %	170076573
106	NC_010474	AT	3	6	122802	122807	50 %	50 %	0 %	0 %	170076576
107	NC_010474	CG	3	6	125206	125211	0 %	0 %	50 %	50 %	170076578
108	NC_010474	AG	3	6	125318	125323	50 %	0 %	50 %	0 %	170076578
109	NC_010474	CA	3	6	128312	128317	50 %	0 %	0 %	50 %	170076581
110	NC_010474	CA	3	6	129830	129835	50 %	0 %	0 %	50 %	170076582
111	NC_010474	TC	3	6	134328	134333	0 %	50 %	0 %	50 %	170076586
112	NC_010474	TG	3	6	138820	138825	0 %	50 %	50 %	0 %	170076589
113	NC_010474	CG	3	6	139478	139483	0 %	0 %	50 %	50 %	170076590
114	NC_010474	TA	3	6	139951	139956	50 %	50 %	0 %	0 %	170076590
115	NC_010474	GA	3	6	143261	143266	50 %	0 %	50 %	0 %	170076593
116	NC_010474	AG	3	6	143622	143627	50 %	0 %	50 %	0 %	170076593
117	NC_010474	AC	3	6	145318	145323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010474	CT	3	6	146401	146406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010474	AT	3	6	146889	146894	50 %	50 %	0 %	0 %	170076597
120	NC_010474	CT	3	6	148345	148350	0 %	50 %	0 %	50 %	170076598
121	NC_010474	AT	3	6	149392	149397	50 %	50 %	0 %	0 %	170076600
122	NC_010474	GT	3	6	149659	149664	0 %	50 %	50 %	0 %	170076600
123	NC_010474	AG	3	6	150995	151000	50 %	0 %	50 %	0 %	170076602
124	NC_010474	TC	3	6	151212	151217	0 %	50 %	0 %	50 %	170076602
125	NC_010474	CA	3	6	153337	153342	50 %	0 %	0 %	50 %	170076603
126	NC_010474	TC	3	6	154927	154932	0 %	50 %	0 %	50 %	170076604
127	NC_010474	CT	3	6	156055	156060	0 %	50 %	0 %	50 %	170076605
128	NC_010474	TC	3	6	158301	158306	0 %	50 %	0 %	50 %	170076608
129	NC_010474	CT	3	6	158607	158612	0 %	50 %	0 %	50 %	170076608
130	NC_010474	AG	3	6	163978	163983	50 %	0 %	50 %	0 %	170076611
131	NC_010474	TG	3	6	166650	166655	0 %	50 %	50 %	0 %	170076614
132	NC_010474	GC	3	6	168314	168319	0 %	0 %	50 %	50 %	170076615
133	NC_010474	TC	3	6	170878	170883	0 %	50 %	0 %	50 %	170076621
134	NC_010474	TC	3	6	171927	171932	0 %	50 %	0 %	50 %	170076621
135	NC_010474	TG	3	6	172679	172684	0 %	50 %	50 %	0 %	170076622
136	NC_010474	CA	3	6	173349	173354	50 %	0 %	0 %	50 %	170076623
137	NC_010474	GT	3	6	173957	173962	0 %	50 %	50 %	0 %	170076623
138	NC_010474	TC	3	6	174071	174076	0 %	50 %	0 %	50 %	170076623
139	NC_010474	AG	3	6	174615	174620	50 %	0 %	50 %	0 %	170076623
140	NC_010474	AG	3	6	174696	174701	50 %	0 %	50 %	0 %	170076623
141	NC_010474	GA	3	6	174864	174869	50 %	0 %	50 %	0 %	170076623
142	NC_010474	AT	3	6	177651	177656	50 %	50 %	0 %	0 %	170076625
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144	NC_010474	GT	3	6	178708	178713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.