MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B chromosome

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010473	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010473	TAAAAA	2	12	58376	58387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010473	GGTGAT	2	12	60978	60989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010473	TCGCTG	2	12	62083	62094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010473	TCTCCC	2	12	138647	138658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010473	TCACCC	2	12	138698	138709	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010473	GTAGTG	2	12	174482	174493	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010473	TCCGCC	2	12	223559	223570	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010473	TGCGCC	2	12	224024	224035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010473	TGGAGA	2	12	224439	224450	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010473	AGCAAC	2	12	228186	228197	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010473	TCTCCC	2	12	264015	264026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010473	GCAGAA	2	12	265231	265242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010473	GTGCAG	2	12	272137	272148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010473	TAAGGG	2	12	286486	286497	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010473	TGTGGA	2	12	287633	287644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010473	TTTTCT	2	12	294879	294890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010473	CTATTT	2	12	295915	295926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010473	TATTGA	2	12	323547	323558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010473	GTGATG	2	12	329252	329263	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010473	TACGGT	2	12	331754	331765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010473	CTGGCG	2	12	331905	331916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010473	AACAAT	2	12	345820	345831	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010473	TATTGA	2	12	348666	348677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010473	TTTTCA	2	12	411031	411042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010473	CAGGCG	2	12	429874	429885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010473	TTATAT	2	12	507238	507249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010473	GATTTT	2	12	510833	510844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010473	AATAAA	2	12	515555	515566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010473	CTGTCA	2	12	518697	518708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010473	GCAGAA	2	12	520417	520428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010473	ATGGAA	2	12	521003	521014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010473	TGCAAA	2	12	551206	551217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010473	GCTGGC	2	12	597044	597055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010473	AATAAA	2	12	628815	628826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010473	CTGTCA	2	12	631957	631968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010473	GCAGAA	2	12	633677	633688	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010473	ATGGAA	2	12	634263	634274	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010473	TGCAAA	2	12	664466	664477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010473	GCTGGC	2	12	710304	710315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010473	ATTTTT	2	12	760085	760096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010473	TTTTCT	2	12	848099	848110	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010473	AATATT	2	12	873908	873919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010473	CAGAAA	2	12	886139	886150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010473	TAACCG	2	12	976034	976045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010473	AAATAA	2	12	1007761	1007772	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010473	CTGGAA	2	12	1017325	1017336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010473	AAAGAT	2	12	1040292	1040303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010473	TGTCCA	2	12	1060925	1060936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010473	TAAGGA	2	12	1083193	1083204	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010473	ATAATG	2	12	1084607	1084618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010473	ATCAGC	2	12	1148269	1148280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010473	TTTTGT	2	12	1258968	1258979	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010473	AGCGAT	2	12	1259369	1259380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010473	CACAGG	2	12	1261320	1261331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010473	ACGCTT	2	12	1279588	1279599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010473	ACTCGA	2	12	1279608	1279619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010473	CAGGCT	2	12	1279740	1279751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010473	CTTATT	2	12	1331887	1331898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010473	CAAAAG	2	12	1338783	1338794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010473	GGGGGT	2	12	1347780	1347791	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010473	TCTCGC	2	12	1358013	1358024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010473	TGATGG	2	12	1365898	1365909	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010473	TCGCCG	2	12	1377607	1377618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010473	TGATGC	2	12	1378156	1378167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010473	GATGGC	2	12	1382138	1382149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010473	CTGATC	2	12	1398416	1398427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010473	CTATAA	2	12	1444683	1444694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010473	ATTTAA	2	12	1505922	1505933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010473	TGCCTT	2	12	1513576	1513587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010473	GGCACC	2	12	1554942	1554953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010473	TATCAA	2	12	1559858	1559869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010473	GATGGT	2	12	1561956	1561967	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010473	AGCGCT	2	12	1562376	1562387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010473	GCAGGC	2	12	1562445	1562456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010473	TGTCGC	2	12	1617411	1617422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010473	AAAAAC	2	12	1644378	1644389	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010473	TTCATA	2	12	1655969	1655980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010473	ACCGTT	2	12	1659242	1659253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010473	TGGTTA	2	12	1668072	1668083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010473	CAAAAA	2	12	1716772	1716783	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010473	TAAATA	2	12	1718571	1718582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010473	TTTTTC	2	12	1720293	1720304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010473	GGTTCC	2	12	1731836	1731847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010473	AAAAAC	2	12	1732671	1732682	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010473	CTGTAA	2	12	1740877	1740888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010473	ATACTT	2	12	1829727	1829738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010473	AAAATA	2	12	1843383	1843394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010473	TGTTTT	2	12	1844016	1844027	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010473	AAGACT	2	12	1844276	1844287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010473	GAACAG	2	12	1892056	1892067	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010473	TATTAC	2	12	1960504	1960515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010473	TTTCTT	2	12	1978519	1978530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010473	ATAAAC	2	12	1982462	1982473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010473	ACTGTC	2	12	2026120	2026131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010473	TTAATG	2	12	2068548	2068559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010473	AATTCA	2	12	2075673	2075684	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010473	TCTTAT	2	12	2089491	2089502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010473	GATAGT	2	12	2092163	2092174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010473	ATATTT	2	12	2122885	2122896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010473	CGACTT	2	12	2123707	2123718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010473	ATTTTT	2	12	2147003	2147014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010473	CTGATA	2	12	2157292	2157303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010473	GCACAG	2	12	2159885	2159896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010473	TCCCCC	2	12	2242359	2242370	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_010473	CGGAAC	2	12	2264825	2264836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010473	GAAAAA	2	12	2287046	2287057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010473	ATACCG	2	12	2287423	2287434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010473	TCTTCC	2	12	2352845	2352856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010473	CGCAGG	2	12	2419430	2419441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010473	CCATGC	2	12	2420000	2420011	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010473	CAGCGT	2	12	2420492	2420503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010473	GCAGTT	2	12	2421997	2422008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010473	CCACTA	2	12	2438634	2438645	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010473	AAGCCA	2	12	2471334	2471345	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010473	TAAATG	2	12	2496686	2496697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010473	CAGCAC	2	12	2500574	2500585	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010473	TGTCAC	2	12	2510320	2510331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010473	AGAAAA	2	12	2520600	2520611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010473	CTGATG	2	12	2584790	2584801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010473	GTTATG	2	12	2602630	2602641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010473	CAAGTG	2	12	2621092	2621103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010473	TCCTTC	2	12	2729073	2729084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010473	TGGACA	2	12	2779343	2779354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010473	TAGCCG	2	12	2790511	2790522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010473	CAGTTT	2	12	2793930	2793941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010473	TGACGG	2	12	2846021	2846032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010473	GGTTTT	2	12	2855156	2855167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010473	GATTTC	2	12	2868244	2868255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010473	GTTAGT	2	12	2871633	2871644	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010473	TTTTAC	2	12	2872879	2872890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010473	ATTAAC	2	12	2877817	2877828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010473	GCGCTG	2	12	2881622	2881633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010473	TCAGCC	2	12	2899936	2899947	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010473	CAGCGT	2	12	2914098	2914109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010473	ATCTTA	2	12	2947404	2947415	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_010473	ATCGCG	2	12	3133044	3133055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_010473	GTAACC	2	12	3361827	3361838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_010473	TTTTAT	2	12	3374595	3374606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_010473	AATTTA	2	12	3642108	3642119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.