MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B chromosome

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010473	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010473	GATGC	2	10	25713	25722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010473	ATTTA	2	10	29229	29238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010473	GGCAT	2	10	116099	116108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010473	GTAAG	2	10	116863	116872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010473	TCCTC	2	10	118583	118592	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010473	AAATT	2	10	131159	131168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010473	TTATC	2	10	141521	141530	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010473	TACGT	2	10	156519	156528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010473	TGGCC	2	10	158244	158253	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010473	AAATA	2	10	166850	166859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010473	GTCTG	2	10	166935	166944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010473	CGGTT	2	10	197625	197634	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010473	TTTAA	2	10	212816	212825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010473	CCTTT	2	10	221699	221708	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010473	AGGGC	2	10	223233	223242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010473	AGGGA	2	10	223796	223805	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010473	CGATG	2	10	224611	224620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010473	AATGG	2	10	227568	227577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010473	AACAA	2	10	246341	246350	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010473	TCATT	2	10	247324	247333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010473	AGCGC	2	10	251013	251022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010473	CTTCC	2	10	255499	255508	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_010473	AGAGG	2	10	262889	262898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010473	CTGAT	2	10	267842	267851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010473	TATAA	2	10	271919	271928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010473	TGTTA	2	10	287560	287569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010473	TTGAT	2	10	288449	288458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010473	CAAAA	2	10	294903	294912	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010473	ATTAG	2	10	294936	294945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010473	TTCCC	2	10	299406	299415	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010473	GGGCA	2	10	313214	313223	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010473	CTTCT	2	10	337909	337918	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010473	GTTTC	2	10	370680	370689	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010473	CTTTT	2	10	374156	374165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010473	GGAGT	2	10	376853	376862	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010473	GTTTT	2	10	393414	393423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010473	GAAGA	2	10	399994	400003	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010473	TAAAA	2	10	406893	406902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010473	TCAGG	2	10	407405	407414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010473	TGAGT	2	10	413754	413763	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010473	CAGGT	2	10	415041	415050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010473	TCAGG	2	10	443448	443457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010473	ATTTT	2	10	461754	461763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010473	AAGCG	2	10	481719	481728	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010473	GATGC	2	10	489981	489990	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010473	GTTTC	2	10	496370	496379	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010473	TGAGT	2	10	506810	506819	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010473	TTGGG	2	10	509334	509343	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010473	AAATA	2	10	509409	509418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010473	TCATT	2	10	513187	513196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010473	TGTAT	2	10	517680	517689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010473	GTTCT	2	10	518979	518988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010473	TTTTA	2	10	521939	521948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010473	GTCAG	2	10	547926	547935	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010473	GCAGT	2	10	551151	551160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010473	GTTAA	2	10	568329	568338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010473	AAACG	2	10	581985	581994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010473	TGCTA	2	10	595065	595074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010473	ATTTG	2	10	596506	596515	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010473	TCAAT	2	10	598810	598819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010473	GGAAC	2	10	599999	600008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010473	CGTAA	2	10	601207	601216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010473	GCATA	2	10	613401	613410	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010473	AGCAA	2	10	613508	613517	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010473	ATATT	2	10	615130	615139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010473	TCATT	2	10	626447	626456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010473	TGTAT	2	10	630940	630949	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010473	GTTCT	2	10	632239	632248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010473	TTTTA	2	10	635199	635208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010473	GTCAG	2	10	661186	661195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010473	GCAGT	2	10	664411	664420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010473	GTTAA	2	10	681589	681598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010473	AAACG	2	10	695245	695254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010473	TGCTA	2	10	708325	708334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010473	ATTTG	2	10	709766	709775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010473	TCAAT	2	10	712070	712079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010473	GGAAC	2	10	713259	713268	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010473	CGTAA	2	10	714467	714476	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010473	GCATA	2	10	726661	726670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010473	AGCAA	2	10	726768	726777	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010473	ATATT	2	10	728390	728399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010473	TCATT	2	10	739707	739716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010473	CAGGG	2	10	754607	754616	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010473	ATAAA	2	10	759835	759844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010473	TCGCG	2	10	760022	760031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_010473	GGCCG	2	10	768583	768592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010473	ATTTA	2	10	772634	772643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010473	ATTTT	2	10	804904	804913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010473	AGCGC	2	10	810323	810332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010473	ATACA	2	10	817755	817764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010473	TATAA	2	10	822667	822676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010473	GTCGT	2	10	832238	832247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010473	TTGAG	2	10	833536	833545	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010473	CCACT	2	10	841962	841971	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_010473	CAGTG	2	10	842068	842077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010473	GATGC	2	10	858957	858966	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010473	GATGC	2	10	859050	859059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010473	ACATA	2	10	889476	889485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010473	GATGC	2	10	894742	894751	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010473	CAAAA	2	10	901485	901494	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010473	TATAT	2	10	906218	906227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010473	TGATG	2	10	912300	912309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010473	CAGGG	2	10	931216	931225	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010473	AGTAA	2	10	943077	943086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010473	GCAAC	2	10	1010779	1010788	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010473	AGCGA	2	10	1059046	1059055	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010473	TAGGG	2	10	1059082	1059091	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010473	ATGAC	2	10	1060786	1060795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010473	TATTT	2	10	1060849	1060858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010473	TTTTC	2	10	1068824	1068833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010473	TTATT	2	10	1069634	1069643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010473	TTCTT	2	10	1071567	1071576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010473	GTACA	2	10	1074103	1074112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010473	TTATG	2	10	1074260	1074269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010473	CTTAT	2	10	1084763	1084772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010473	GCATC	2	10	1093714	1093723	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010473	AATGT	2	10	1098972	1098981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010473	TAAAA	2	10	1104408	1104417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010473	AAGGG	2	10	1134887	1134896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010473	GCACT	2	10	1147517	1147526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_010473	AGTGG	2	10	1147624	1147633	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010473	TCGCT	2	10	1151529	1151538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_010473	TCGCT	2	10	1151710	1151719	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010473	TCGCT	2	10	1151891	1151900	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010473	TCGCT	2	10	1152072	1152081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010473	GATCG	2	10	1163938	1163947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010473	GTCAT	2	10	1175356	1175365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010473	TGCAG	2	10	1184056	1184065	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010473	GTCGC	2	10	1199121	1199130	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010473	GGGGA	2	10	1245194	1245203	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010473	CATGA	2	10	1251807	1251816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010473	ACGTA	2	10	1253666	1253675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010473	AGTCG	2	10	1259485	1259494	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010473	CTGGT	2	10	1262969	1262978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010473	GGGGT	2	10	1263295	1263304	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010473	TTTTG	2	10	1263571	1263580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010473	TATAA	2	10	1266972	1266981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010473	TTCTA	2	10	1270026	1270035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010473	CTTAC	2	10	1274190	1274199	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010473	GATTA	2	10	1276986	1276995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010473	TTCAA	2	10	1279692	1279701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010473	GAAAA	2	10	1290394	1290403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010473	TGAAA	2	10	1296093	1296102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010473	CTTCA	2	10	1308947	1308956	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010473	CTTCA	2	10	1309482	1309491	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010473	CTTCA	2	10	1310016	1310025	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_010473	TTATC	2	10	1317334	1317343	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010473	TCGCT	2	10	1326849	1326858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_010473	TGACC	2	10	1383962	1383971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_010473	CGTTG	2	10	1403465	1403474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_010473	AATTT	2	10	2277193	2277202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010473	TGAAA	2	10	2286125	2286134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_010473	GTTGG	2	10	2288184	2288193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_010473	CGGTG	2	10	3181573	3181582	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_010473	TCATT	2	10	3747845	3747854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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