MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010471	TTTTGT	2	12	82768	82779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010471	TTAATT	2	12	93028	93039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010471	ATGTAC	2	12	101383	101394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010471	TAGTGT	2	12	137637	137648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010471	TAAACT	2	12	142040	142051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010471	TAAAAA	2	12	216355	216366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010471	AAAGCG	2	12	233343	233354	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010471	GAAGTG	2	12	238408	238419	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010471	TGCTTT	2	12	238704	238715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010471	TATATT	2	12	239452	239463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010471	TTTGAG	2	12	327998	328009	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010471	AAAGCG	2	12	432666	432677	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010471	GAAGTG	2	12	437731	437742	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010471	CATTAT	2	12	564718	564729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010471	TTAAAA	2	12	584525	584536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010471	GTTTTT	2	12	587247	587258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010471	GTTGTC	2	12	617223	617234	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010471	TTAAAT	2	12	628619	628630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010471	TTGTTT	2	12	695805	695816	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010471	AAGTTA	2	12	757614	757625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010471	GTGTAC	2	12	759344	759355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010471	ATTAAT	2	12	833330	833341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010471	AAATAT	2	12	834874	834885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010471	GTCGAT	2	12	883490	883501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010471	AAAAAG	2	12	906373	906384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010471	AAATAT	2	12	915374	915385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010471	ACCACG	2	12	924696	924707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010471	AGGGCG	2	12	924732	924743	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010471	TCCTAT	2	12	954668	954679	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010471	TAAGAA	2	12	1108261	1108272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010471	AAAAAT	2	12	1187679	1187690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010471	CATACT	2	12	1225445	1225456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010471	ACGCTT	2	12	1374734	1374745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010471	ATTCTA	2	12	1375369	1375380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010471	TAAAAA	2	12	1409005	1409016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010471	AGTATT	2	12	1424760	1424771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010471	AAATTA	2	12	1432804	1432815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010471	GACAAA	2	12	1458289	1458300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010471	TCATAT	2	12	1496842	1496853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010471	CCTAGT	2	12	1506775	1506786	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010471	GTTTAT	2	12	1518758	1518769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010471	ATGACA	2	12	1624922	1624933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010471	TAAAAG	2	12	1630007	1630018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010471	TTGATT	2	12	1630302	1630313	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010471	TGCTTA	2	12	1650762	1650773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010471	AAAGCA	2	12	1681399	1681410	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010471	CACTTC	2	12	1681695	1681706	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010471	TTTGTT	2	12	1686597	1686608	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010471	TCGCTT	2	12	1686759	1686770	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010471	TGAAAT	2	12	1713230	1713241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010471	TTTTTA	2	12	1753606	1753617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010471	GAGATT	2	12	1768416	1768427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010471	TGGTGA	2	12	1770580	1770591	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010471	AAAGCA	2	12	1772363	1772374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010471	CACTTC	2	12	1772659	1772670	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010471	TTTGTT	2	12	1777561	1777572	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010471	TCGCTT	2	12	1777723	1777734	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010471	ACAACC	2	12	1796232	1796243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.