MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20

Total Repeats: 1338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010471	ACCAA	2	10	350	359	60 %	0 %	0 %	40 %	170016359
2	NC_010471	CATTA	2	10	2097	2106	40 %	40 %	0 %	20 %	170016360
3	NC_010471	GCAAG	2	10	3697	3706	40 %	0 %	40 %	20 %	170016362
4	NC_010471	TTATT	2	10	3936	3945	20 %	80 %	0 %	0 %	170016362
5	NC_010471	AAGCA	2	10	4710	4719	60 %	0 %	20 %	20 %	170016362
6	NC_010471	GCAAA	2	10	5957	5966	60 %	0 %	20 %	20 %	170016363
7	NC_010471	GTGAT	2	10	7066	7075	20 %	40 %	40 %	0 %	170016364
8	NC_010471	TATAT	2	10	12065	12074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010471	TATGT	2	10	12205	12214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010471	ATTTT	2	10	12987	12996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010471	AAATG	2	10	13352	13361	60 %	20 %	20 %	0 %	170016370
12	NC_010471	CAAAG	2	10	14277	14286	60 %	0 %	20 %	20 %	170016371
13	NC_010471	TACAA	2	10	14334	14343	60 %	20 %	0 %	20 %	170016371
14	NC_010471	CACAA	2	10	16199	16208	60 %	0 %	0 %	40 %	170016373
15	NC_010471	GCATA	2	10	16678	16687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010471	GATTA	2	10	17773	17782	40 %	40 %	20 %	0 %	170016374
17	NC_010471	TGTTT	2	10	17935	17944	0 %	80 %	20 %	0 %	170016374
18	NC_010471	CATGT	2	10	18427	18436	20 %	40 %	20 %	20 %	170016374
19	NC_010471	TTTGC	2	10	20767	20776	0 %	60 %	20 %	20 %	170016376
20	NC_010471	TGTTT	2	10	22273	22282	0 %	80 %	20 %	0 %	170016378
21	NC_010471	TATTT	2	10	22570	22579	20 %	80 %	0 %	0 %	170016378
22	NC_010471	CCAAA	2	10	24786	24795	60 %	0 %	0 %	40 %	170016381
23	NC_010471	ATAAA	2	10	26201	26210	80 %	20 %	0 %	0 %	170016382
24	NC_010471	ACAAA	2	10	26211	26220	80 %	0 %	0 %	20 %	170016382
25	NC_010471	TTTAA	2	10	28995	29004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010471	GCATT	2	10	30740	30749	20 %	40 %	20 %	20 %	170016386
27	NC_010471	TAAAT	2	10	30813	30822	60 %	40 %	0 %	0 %	170016386
28	NC_010471	TTAAC	2	10	30874	30883	40 %	40 %	0 %	20 %	170016386
29	NC_010471	TATAT	2	10	32667	32676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010471	TTGTT	2	10	32976	32985	0 %	80 %	20 %	0 %	170016388
31	NC_010471	TCAGT	2	10	33119	33128	20 %	40 %	20 %	20 %	170016388
32	NC_010471	ACTAT	2	10	33321	33330	40 %	40 %	0 %	20 %	170016388
33	NC_010471	AATGC	2	10	33749	33758	40 %	20 %	20 %	20 %	170016389
34	NC_010471	GGTTT	2	10	38407	38416	0 %	60 %	40 %	0 %	170016394
35	NC_010471	ATTTG	2	10	39510	39519	20 %	60 %	20 %	0 %	170016395
36	NC_010471	GATAA	2	10	39922	39931	60 %	20 %	20 %	0 %	170016396
37	NC_010471	TGAAT	2	10	40550	40559	40 %	40 %	20 %	0 %	170016397
38	NC_010471	GGTTG	2	10	40595	40604	0 %	40 %	60 %	0 %	170016397
39	NC_010471	TCATT	2	10	41228	41237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010471	GTTTT	2	10	41306	41315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010471	GTTAC	2	10	42831	42840	20 %	40 %	20 %	20 %	170016400
42	NC_010471	AAAAC	2	10	45287	45296	80 %	0 %	0 %	20 %	170016403
43	NC_010471	TAATC	2	10	46610	46619	40 %	40 %	0 %	20 %	170016404
44	NC_010471	TGAAA	2	10	46994	47003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010471	ACTAA	2	10	49865	49874	60 %	20 %	0 %	20 %	170016408
46	NC_010471	AAACA	2	10	50716	50725	80 %	0 %	0 %	20 %	170016409
47	NC_010471	TAGCT	2	10	51876	51885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010471	GTTGT	2	10	53947	53956	0 %	60 %	40 %	0 %	170016411
49	NC_010471	CTGTC	2	10	65704	65713	0 %	40 %	20 %	40 %	170016423
50	NC_010471	TAAGT	2	10	66506	66515	40 %	40 %	20 %	0 %	170016425
51	NC_010471	GTTAG	2	10	66624	66633	20 %	40 %	40 %	0 %	170016425
52	NC_010471	ATTGA	2	10	67933	67942	40 %	40 %	20 %	0 %	170016427
53	NC_010471	TACTG	2	10	68124	68133	20 %	40 %	20 %	20 %	170016427
54	NC_010471	GCTAA	2	10	69142	69151	40 %	20 %	20 %	20 %	170016427
55	NC_010471	CAAGT	2	10	70375	70384	40 %	20 %	20 %	20 %	170016428
56	NC_010471	TTGGC	2	10	70707	70716	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010471	ATTTG	2	10	72263	72272	20 %	60 %	20 %	0 %	170016430
58	NC_010471	ATCAG	2	10	73958	73967	40 %	20 %	20 %	20 %	170016432
59	NC_010471	GTTAT	2	10	74194	74203	20 %	60 %	20 %	0 %	170016432
60	NC_010471	TCAAA	2	10	75792	75801	60 %	20 %	0 %	20 %	170016433
61	NC_010471	CAACA	2	10	76001	76010	60 %	0 %	0 %	40 %	170016433
62	NC_010471	TCTAT	2	10	76341	76350	20 %	60 %	0 %	20 %	170016433
63	NC_010471	CAAAC	2	10	78308	78317	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010471	ATTTG	2	10	79178	79187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010471	AATTT	2	10	79877	79886	40 %	60 %	0 %	0 %	170016436
66	NC_010471	CATTA	2	10	81439	81448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010471	TGATT	2	10	83074	83083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010471	TAATT	2	10	87728	87737	40 %	60 %	0 %	0 %	170016447
69	NC_010471	CAACG	2	10	88155	88164	40 %	0 %	20 %	40 %	170016447
70	NC_010471	AAAGA	2	10	90002	90011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010471	ATGAA	2	10	90181	90190	60 %	20 %	20 %	0 %	170016450
72	NC_010471	TGCAT	2	10	91836	91845	20 %	40 %	20 %	20 %	170016452
73	NC_010471	AATAT	2	10	93177	93186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010471	TTGAT	2	10	94099	94108	20 %	60 %	20 %	0 %	170016455
75	NC_010471	TTGAT	2	10	94291	94300	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010471	TTGTG	2	10	94518	94527	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010471	AAAAT	2	10	94642	94651	80 %	20 %	0 %	0 %	170016456
78	NC_010471	AATTG	2	10	94754	94763	40 %	40 %	20 %	0 %	170016456
79	NC_010471	TCGTA	2	10	94910	94919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010471	AACCA	2	10	95614	95623	60 %	0 %	0 %	40 %	170016457
81	NC_010471	ATGTT	2	10	98376	98385	20 %	60 %	20 %	0 %	170016460
82	NC_010471	TTTTA	2	10	99271	99280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010471	CTTGT	2	10	100966	100975	0 %	60 %	20 %	20 %	170016463
84	NC_010471	AAAAG	2	10	101410	101419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010471	TGAGT	2	10	101519	101528	20 %	40 %	40 %	0 %	170016464
86	NC_010471	AGTCT	2	10	102948	102957	20 %	40 %	20 %	20 %	170016465
87	NC_010471	GTAAT	2	10	103920	103929	40 %	40 %	20 %	0 %	170016466
88	NC_010471	TTTCA	2	10	105649	105658	20 %	60 %	0 %	20 %	170016468
89	NC_010471	AGACT	2	10	106361	106370	40 %	20 %	20 %	20 %	170016468
90	NC_010471	ATGAC	2	10	107081	107090	40 %	20 %	20 %	20 %	170016469
91	NC_010471	TATCG	2	10	107146	107155	20 %	40 %	20 %	20 %	170016469
92	NC_010471	CGTCA	2	10	107685	107694	20 %	20 %	20 %	40 %	170016469
93	NC_010471	ATTGG	2	10	107969	107978	20 %	40 %	40 %	0 %	170016470
94	NC_010471	GCGTC	2	10	108395	108404	0 %	20 %	40 %	40 %	170016470
95	NC_010471	TGTAT	2	10	109252	109261	20 %	60 %	20 %	0 %	170016471
96	NC_010471	TCATT	2	10	109824	109833	20 %	60 %	0 %	20 %	170016471
97	NC_010471	GTTTT	2	10	112741	112750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010471	GTTAT	2	10	113080	113089	20 %	60 %	20 %	0 %	170016475
99	NC_010471	AGCAA	2	10	114303	114312	60 %	0 %	20 %	20 %	170016476
100	NC_010471	TAAAA	2	10	114498	114507	80 %	20 %	0 %	0 %	170016476
101	NC_010471	ACGGT	2	10	115859	115868	20 %	20 %	40 %	20 %	170016477
102	NC_010471	TGGTA	2	10	116658	116667	20 %	40 %	40 %	0 %	170016477
103	NC_010471	ATGCA	2	10	121376	121385	40 %	20 %	20 %	20 %	170016480
104	NC_010471	CACCT	2	10	121797	121806	20 %	20 %	0 %	60 %	170016480
105	NC_010471	GAAAT	2	10	123134	123143	60 %	20 %	20 %	0 %	170016481
106	NC_010471	GACAC	2	10	123820	123829	40 %	0 %	20 %	40 %	170016482
107	NC_010471	ATCAA	2	10	124366	124375	60 %	20 %	0 %	20 %	170016483
108	NC_010471	TGAAT	2	10	126319	126328	40 %	40 %	20 %	0 %	170016484
109	NC_010471	TATCG	2	10	126428	126437	20 %	40 %	20 %	20 %	170016484
110	NC_010471	TTGAG	2	10	126839	126848	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010471	AAACA	2	10	127218	127227	80 %	0 %	0 %	20 %	170016485
112	NC_010471	TGGTG	2	10	127951	127960	0 %	40 %	60 %	0 %	170016486
113	NC_010471	TTGGT	2	10	129127	129136	0 %	60 %	40 %	0 %	170016486
114	NC_010471	GTGTT	2	10	131494	131503	0 %	60 %	40 %	0 %	170016488
115	NC_010471	AACAA	2	10	132286	132295	80 %	0 %	0 %	20 %	170016489
116	NC_010471	TTTGT	2	10	134190	134199	0 %	80 %	20 %	0 %	170016491
117	NC_010471	ATAAA	2	10	137515	137524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010471	TATCA	2	10	140969	140978	40 %	40 %	0 %	20 %	170016494
119	NC_010471	ATTAT	2	10	141642	141651	40 %	60 %	0 %	0 %	170016496
120	NC_010471	CGATA	2	10	144153	144162	40 %	20 %	20 %	20 %	170016498
121	NC_010471	AATAA	2	10	144244	144253	80 %	20 %	0 %	0 %	170016498
122	NC_010471	TATCA	2	10	144359	144368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010471	TTTTA	2	10	144480	144489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010471	TTTAT	2	10	146784	146793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010471	TGTTC	2	10	146881	146890	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010471	GCAAG	2	10	151680	151689	40 %	0 %	40 %	20 %	170016506
127	NC_010471	CCAGC	2	10	153358	153367	20 %	0 %	20 %	60 %	170016507
128	NC_010471	TGGGA	2	10	154025	154034	20 %	20 %	60 %	0 %	170016508
129	NC_010471	TTTTG	2	10	156727	156736	0 %	80 %	20 %	0 %	170016510
130	NC_010471	ACGCT	2	10	158098	158107	20 %	20 %	20 %	40 %	170016511
131	NC_010471	TTTTC	2	10	160216	160225	0 %	80 %	0 %	20 %	170016513
132	NC_010471	GTCAT	2	10	166929	166938	20 %	40 %	20 %	20 %	170016519
133	NC_010471	AACAG	2	10	169898	169907	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010471	TTAGT	2	10	171804	171813	20 %	60 %	20 %	0 %	170016523
135	NC_010471	TATGA	2	10	173463	173472	40 %	40 %	20 %	0 %	170016525
136	NC_010471	TATTG	2	10	181789	181798	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010471	TCATG	2	10	186493	186502	20 %	40 %	20 %	20 %	170016538
138	NC_010471	AATTT	2	10	186530	186539	40 %	60 %	0 %	0 %	170016538
139	NC_010471	ACACA	2	10	188354	188363	60 %	0 %	0 %	40 %	170016540
140	NC_010471	TTTAA	2	10	190658	190667	40 %	60 %	0 %	0 %	170016543
141	NC_010471	TTGCC	2	10	191563	191572	0 %	40 %	20 %	40 %	170016544
142	NC_010471	TTAAT	2	10	194171	194180	40 %	60 %	0 %	0 %	170016545
143	NC_010471	TAAAG	2	10	195425	195434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010471	ATTAA	2	10	197248	197257	60 %	40 %	0 %	0 %	170016548
145	NC_010471	AAATA	2	10	197729	197738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010471	GTAAA	2	10	198520	198529	60 %	20 %	20 %	0 %	170016549
147	NC_010471	ATAGT	2	10	199177	199186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010471	CAACA	2	10	200444	200453	60 %	0 %	0 %	40 %	170016550
149	NC_010471	GTTTT	2	10	201090	201099	0 %	80 %	20 %	0 %	170016551
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151	NC_010471	TTATC	2	10	204660	204669	20 %	60 %	0 %	20 %	170016555
152	NC_010471	CAAAG	2	10	205596	205605	60 %	0 %	20 %	20 %	170016555
153	NC_010471	GAAAA	2	10	205675	205684	80 %	0 %	20 %	0 %	170016555
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159	NC_010471	TGATA	2	10	218524	218533	40 %	40 %	20 %	0 %	170016568
160	NC_010471	CAGTT	2	10	219005	219014	20 %	40 %	20 %	20 %	170016569
161	NC_010471	GTGAT	2	10	219191	219200	20 %	40 %	40 %	0 %	170016569
162	NC_010471	GTGAA	2	10	229019	229028	40 %	20 %	40 %	0 %	170016578
163	NC_010471	CAAAG	2	10	229793	229802	60 %	0 %	20 %	20 %	170016579
164	NC_010471	GCTGG	2	10	231383	231392	0 %	20 %	60 %	20 %	170016580
165	NC_010471	GACTG	2	10	232388	232397	20 %	20 %	40 %	20 %	170016581
166	NC_010471	GATAA	2	10	233408	233417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010471	TACCA	2	10	234120	234129	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_010471	TCGTG	2	10	234706	234715	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_010471	CGCAA	2	10	235539	235548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_010471	GTTAA	2	10	235558	235567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010471	GAGAT	2	10	238345	238354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010471	GTATT	2	10	240210	240219	20 %	60 %	20 %	0 %	170016583
173	NC_010471	CCTAT	2	10	240933	240942	20 %	40 %	0 %	40 %	170016583
174	NC_010471	GACAG	2	10	241603	241612	40 %	0 %	40 %	20 %	170016585
175	NC_010471	TAAAT	2	10	245810	245819	60 %	40 %	0 %	0 %	170016587
176	NC_010471	TCGAT	2	10	246221	246230	20 %	40 %	20 %	20 %	170016587
177	NC_010471	AAACT	2	10	247632	247641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_010471	ATACA	2	10	248185	248194	60 %	20 %	0 %	20 %	170016589
179	NC_010471	GTATC	2	10	249704	249713	20 %	40 %	20 %	20 %	170016591
180	NC_010471	TGAAT	2	10	251241	251250	40 %	40 %	20 %	0 %	170016592
181	NC_010471	TTTTA	2	10	251700	251709	20 %	80 %	0 %	0 %	170016592
182	NC_010471	TGAAA	2	10	253787	253796	60 %	20 %	20 %	0 %	170016594
183	NC_010471	CAAGA	2	10	255167	255176	60 %	0 %	20 %	20 %	170016595
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186	NC_010471	AATTT	2	10	258330	258339	40 %	60 %	0 %	0 %	170016599
187	NC_010471	GCTTG	2	10	258438	258447	0 %	40 %	40 %	20 %	170016599
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189	NC_010471	TTGTT	2	10	261681	261690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010471	GTATT	2	10	262649	262658	20 %	60 %	20 %	0 %	170016603
191	NC_010471	ATTTA	2	10	262720	262729	40 %	60 %	0 %	0 %	170016603
192	NC_010471	GTTTT	2	10	264467	264476	0 %	80 %	20 %	0 %	170016605
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194	NC_010471	TTTAT	2	10	266594	266603	20 %	80 %	0 %	0 %	170016606
195	NC_010471	TTTAC	2	10	266622	266631	20 %	60 %	0 %	20 %	170016606
196	NC_010471	ATTAA	2	10	269434	269443	60 %	40 %	0 %	0 %	170016610
197	NC_010471	ATTTT	2	10	270800	270809	20 %	80 %	0 %	0 %	170016612
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224	NC_010471	CTTCA	2	10	314910	314919	20 %	40 %	0 %	40 %	170016655
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240	NC_010471	ATCAT	2	10	333447	333456	40 %	40 %	0 %	20 %	170016679
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243	NC_010471	TAAAA	2	10	335861	335870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_010471	TTATA	2	10	335904	335913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_010471	AAACG	2	10	335970	335979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_010471	GATTA	2	10	360388	360397	40 %	40 %	20 %	0 %	170016708
260	NC_010471	ATCAA	2	10	360495	360504	60 %	20 %	0 %	20 %	170016709
261	NC_010471	TTTAT	2	10	360753	360762	20 %	80 %	0 %	0 %	170016709
262	NC_010471	TTGTT	2	10	364849	364858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010471	GCGAT	2	10	365058	365067	20 %	20 %	40 %	20 %	170016714
264	NC_010471	TTTGC	2	10	365735	365744	0 %	60 %	20 %	20 %	170016714
265	NC_010471	ACAAA	2	10	366409	366418	80 %	0 %	0 %	20 %	170016714
266	NC_010471	AAGAA	2	10	366420	366429	80 %	0 %	20 %	0 %	170016714
267	NC_010471	GATTA	2	10	368021	368030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_010471	TTAAT	2	10	372927	372936	40 %	60 %	0 %	0 %	170016719
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