MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010471	TATAT	2	10	12065	12074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010471	TATGT	2	10	12205	12214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010471	ATTTT	2	10	12987	12996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010471	GCATA	2	10	16678	16687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010471	TTTAA	2	10	28995	29004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010471	TATAT	2	10	32667	32676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010471	TCATT	2	10	41228	41237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010471	GTTTT	2	10	41306	41315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010471	TGAAA	2	10	46994	47003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010471	TAGCT	2	10	51876	51885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010471	TTGGC	2	10	70707	70716	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010471	CAAAC	2	10	78308	78317	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010471	ATTTG	2	10	79178	79187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010471	CATTA	2	10	81439	81448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010471	TGATT	2	10	83074	83083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010471	AAAGA	2	10	90002	90011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010471	AATAT	2	10	93177	93186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010471	TTGAT	2	10	94291	94300	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010471	TTGTG	2	10	94518	94527	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010471	TCGTA	2	10	94910	94919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010471	TTTTA	2	10	99271	99280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010471	AAAAG	2	10	101410	101419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010471	GTTTT	2	10	112741	112750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010471	TTGAG	2	10	126839	126848	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010471	ATAAA	2	10	137515	137524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010471	TATCA	2	10	144359	144368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010471	TTTTA	2	10	144480	144489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010471	TTTAT	2	10	146784	146793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010471	TGTTC	2	10	146881	146890	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010471	AACAG	2	10	169898	169907	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010471	TATTG	2	10	181789	181798	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010471	TAAAG	2	10	195425	195434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010471	AAATA	2	10	197729	197738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010471	ATAGT	2	10	199177	199186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010471	TGGTA	2	10	202236	202245	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010471	GATAA	2	10	233408	233417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010471	TACCA	2	10	234120	234129	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010471	TCGTG	2	10	234706	234715	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010471	CGCAA	2	10	235539	235548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010471	GTTAA	2	10	235558	235567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010471	GAGAT	2	10	238345	238354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010471	AAACT	2	10	247632	247641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010471	AGAGA	2	10	261541	261550	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010471	TTGTT	2	10	261681	261690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010471	TCCAG	2	10	265364	265373	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010471	GTTTC	2	10	314966	314975	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010471	ATATT	2	10	332123	332132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010471	TAAAA	2	10	335861	335870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010471	TTATA	2	10	335904	335913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010471	AAACG	2	10	335970	335979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010471	TTGTT	2	10	364849	364858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010471	GATTA	2	10	368021	368030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010471	ATGAT	2	10	372975	372984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010471	GTTAT	2	10	394493	394502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010471	TAAAA	2	10	405435	405444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010471	TTTTA	2	10	405473	405482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010471	GAAAG	2	10	425426	425435	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010471	TCATT	2	10	427012	427021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010471	GATAA	2	10	432731	432740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010471	TACCA	2	10	433443	433452	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010471	TCGTG	2	10	434029	434038	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010471	CGCAA	2	10	434862	434871	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010471	GTTAA	2	10	434881	434890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010471	GAGAT	2	10	437668	437677	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010471	ATTAA	2	10	448988	448997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010471	ATAGA	2	10	466961	466970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010471	AAGAA	2	10	481273	481282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010471	GTAAC	2	10	523914	523923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010471	GTTAG	2	10	545885	545894	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010471	TGAAT	2	10	553898	553907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010471	AAAAT	2	10	564603	564612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010471	CATTG	2	10	574070	574079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010471	TAAAA	2	10	581459	581468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010471	ATTTT	2	10	581550	581559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010471	AAACA	2	10	585892	585901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010471	TTCCT	2	10	593711	593720	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010471	GCATC	2	10	598179	598188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010471	AAGTA	2	10	600489	600498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010471	TAATA	2	10	617069	617078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010471	TTTAA	2	10	622458	622467	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010471	GATAA	2	10	643625	643634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010471	AATTG	2	10	645005	645014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010471	TATGA	2	10	650056	650065	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010471	CAAAA	2	10	651981	651990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010471	TAAAA	2	10	652020	652029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010471	TAATT	2	10	652040	652049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010471	ATCAC	2	10	688667	688676	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010471	TGATA	2	10	691843	691852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010471	GAGAA	2	10	704313	704322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010471	TTTTA	2	10	726926	726935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010471	ATATA	2	10	728289	728298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010471	CATTT	2	10	734321	734330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010471	TAATT	2	10	782147	782156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010471	TGCTA	3	15	788323	788337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010471	ATCAT	2	10	791387	791396	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010471	CTTGT	2	10	798428	798437	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010471	CTTTT	2	10	799560	799569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010471	ATGTC	2	10	800078	800087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010471	TTATA	2	10	822160	822169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010471	ATTAT	2	10	822251	822260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010471	TACCA	2	10	838000	838009	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010471	ATATA	2	10	847152	847161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010471	AAAAT	2	10	856359	856368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010471	TTAAT	2	10	864584	864593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010471	GATAT	2	10	881796	881805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010471	ACAAA	2	10	882578	882587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010471	AAATA	2	10	883113	883122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010471	ATATA	2	10	883128	883137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010471	TTATT	2	10	883427	883436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010471	CGATG	2	10	883751	883760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010471	TTAAC	2	10	883964	883973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010471	ATGAA	2	10	888505	888514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010471	TTTTA	2	10	895341	895350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010471	TCTTT	2	10	903339	903348	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010471	TAGCG	2	10	906821	906830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010471	GAAAG	2	10	907066	907075	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010471	TTTTA	2	10	912939	912948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010471	ACGCT	2	10	924722	924731	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010471	TTTCC	2	10	925262	925271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010471	CAAGC	2	10	926377	926386	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010471	TAATA	2	10	943983	943992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010471	TTAAT	2	10	949884	949893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010471	AGGAA	2	10	951289	951298	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010471	TAAAA	2	10	951844	951853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010471	AAATA	2	10	953555	953564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010471	CAACA	2	10	954179	954188	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010471	GAATA	2	10	972410	972419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010471	AATTG	2	10	972456	972465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010471	TTTAT	2	10	972558	972567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010471	ACATT	2	10	1005942	1005951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010471	TAAAT	2	10	1013321	1013330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010471	TTTTA	2	10	1034786	1034795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010471	AATTA	2	10	1067357	1067366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010471	TAAAC	2	10	1077055	1077064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010471	TAGTC	2	10	1080398	1080407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010471	TAAAA	2	10	1101261	1101270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010471	GGTAT	2	10	1105487	1105496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010471	TGAGC	2	10	1105780	1105789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010471	CATAA	2	10	1107552	1107561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010471	TATGA	2	10	1111439	1111448	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010471	TTATC	2	10	1124382	1124391	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010471	ATAAA	2	10	1126128	1126137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010471	TATAT	2	10	1127918	1127927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010471	AGCCA	2	10	1143685	1143694	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010471	TTTAT	2	10	1147539	1147548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010471	ATTTT	2	10	1152298	1152307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010471	TTGTT	2	10	1167882	1167891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_010471	GTTGT	2	10	1689886	1689895	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_010471	CTTTT	2	10	1730779	1730788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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216	NC_010471	CACGA	2	10	1776363	1776372	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
217	NC_010471	TGGTA	2	10	1776949	1776958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
218	NC_010471	TAAAA	2	10	1780052	1780061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.