MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	AAATA	2	10	61	70	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	GCAGT	2	10	803	812	20 %	20 %	40 %	20 %	170016309
3	NC_010470	GCAGT	2	10	920	929	20 %	20 %	40 %	20 %	170016309
4	NC_010470	TAATT	2	10	6257	6266	40 %	60 %	0 %	0 %	170016310
5	NC_010470	TGAAG	2	10	6543	6552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010470	GTTTG	2	10	8020	8029	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010470	TAAAT	2	10	9016	9025	60 %	40 %	0 %	0 %	170016315
8	NC_010470	GTAAA	2	10	10942	10951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010470	TTATA	2	10	12774	12783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010470	TTTGT	2	10	13128	13137	0 %	80 %	20 %	0 %	170016325
11	NC_010470	TTGAT	2	10	14347	14356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010470	TATAT	2	10	14491	14500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010470	AAAAG	2	10	14524	14533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010470	TATGT	2	10	16728	16737	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010470	TAAGT	2	10	16950	16959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010470	TGATT	2	10	17933	17942	20 %	60 %	20 %	0 %	170016331
17	NC_010470	GGGGT	2	10	19555	19564	0 %	20 %	80 %	0 %	170016333
18	NC_010470	AAGCA	2	10	19824	19833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010470	AGTTG	2	10	21255	21264	20 %	40 %	40 %	0 %	170016335
20	NC_010470	ATTAA	2	10	22947	22956	60 %	40 %	0 %	0 %	170016337
21	NC_010470	GTTTT	2	10	26014	26023	0 %	80 %	20 %	0 %	170016343
22	NC_010470	AGTTA	2	10	28223	28232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010470	AGGAA	2	10	28301	28310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010470	CAAAT	2	10	28579	28588	60 %	20 %	0 %	20 %	170016345
25	NC_010470	ATCAA	2	10	28961	28970	60 %	20 %	0 %	20 %	170016345
26	NC_010470	GTAAA	2	10	29048	29057	60 %	20 %	20 %	0 %	170016345
27	NC_010470	AATCA	2	10	29236	29245	60 %	20 %	0 %	20 %	170016345
28	NC_010470	ATCTA	2	10	29958	29967	40 %	40 %	0 %	20 %	170016345
29	NC_010470	GTTTG	2	10	35282	35291	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.