MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	TTAA	2	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	GCAA	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	170016309
3	NC_010470	CAAA	2	8	1470	1477	75 %	0 %	0 %	25 %	170016309
4	NC_010470	TTAC	2	8	1670	1677	25 %	50 %	0 %	25 %	170016309
5	NC_010470	CAAT	2	8	2390	2397	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
6	NC_010470	CAAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
7	NC_010470	CAAT	2	8	4076	4083	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
8	NC_010470	CAAT	2	8	4919	4926	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
9	NC_010470	CAAT	2	8	5762	5769	50 %	25 %	0 %	25 %	170016309
10	NC_010470	GATT	2	8	6244	6251	25 %	50 %	25 %	0 %	170016310
11	NC_010470	AGTA	2	8	6467	6474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010470	TAAA	2	8	6489	6496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010470	TAGA	2	8	6711	6718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010470	TCGC	2	8	7805	7812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010470	ATGA	2	8	8037	8044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010470	ATAA	2	8	8637	8644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010470	ATTA	2	8	8703	8710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010470	TGAT	2	8	8823	8830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010470	TAGT	2	8	8878	8885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010470	TGAC	2	8	10347	10354	25 %	25 %	25 %	25 %	170016316
21	NC_010470	CTTT	2	8	10862	10869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010470	ATTC	2	8	10870	10877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010470	GTCA	2	8	11120	11127	25 %	25 %	25 %	25 %	170016319
24	NC_010470	GTAT	2	8	11604	11611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010470	AATT	2	8	11988	11995	50 %	50 %	0 %	0 %	170016322
26	NC_010470	CAAA	2	8	12116	12123	75 %	0 %	0 %	25 %	170016322
27	NC_010470	ATTA	2	8	12181	12188	50 %	50 %	0 %	0 %	170016322
28	NC_010470	TCAA	2	8	13095	13102	50 %	25 %	0 %	25 %	170016325
29	NC_010470	TTGA	2	8	13199	13206	25 %	50 %	25 %	0 %	170016325
30	NC_010470	CTTT	2	8	13285	13292	0 %	75 %	0 %	25 %	170016325
31	NC_010470	TTTA	2	8	13668	13675	25 %	75 %	0 %	0 %	170016326
32	NC_010470	CTTT	2	8	13816	13823	0 %	75 %	0 %	25 %	170016326
33	NC_010470	AAAT	2	8	13932	13939	75 %	25 %	0 %	0 %	170016326
34	NC_010470	TACA	2	8	14561	14568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010470	TTTG	2	8	14574	14581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010470	GACG	2	8	15024	15031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010470	GTTT	2	8	15051	15058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010470	TCAA	2	8	15125	15132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010470	TTGT	2	8	15144	15151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010470	ATAA	2	8	15471	15478	75 %	25 %	0 %	0 %	170016327
41	NC_010470	CTTT	2	8	15487	15494	0 %	75 %	0 %	25 %	170016327
42	NC_010470	GCCA	2	8	15538	15545	25 %	0 %	25 %	50 %	170016327
43	NC_010470	CATT	2	8	15689	15696	25 %	50 %	0 %	25 %	170016327
44	NC_010470	AATT	2	8	15892	15899	50 %	50 %	0 %	0 %	170016327
45	NC_010470	AGTT	2	8	16423	16430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010470	GTAG	2	8	17064	17071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010470	TTGA	2	8	17580	17587	25 %	50 %	25 %	0 %	170016331
48	NC_010470	AGAA	2	8	17743	17750	75 %	0 %	25 %	0 %	170016331
49	NC_010470	TATG	2	8	17858	17865	25 %	50 %	25 %	0 %	170016331
50	NC_010470	GTGA	2	8	17958	17965	25 %	25 %	50 %	0 %	170016331
51	NC_010470	TTGG	2	8	18413	18420	0 %	50 %	50 %	0 %	170016332
52	NC_010470	TTTA	2	8	18448	18455	25 %	75 %	0 %	0 %	170016332
53	NC_010470	GGTT	2	8	18715	18722	0 %	50 %	50 %	0 %	170016333
54	NC_010470	GGAC	2	8	18742	18749	25 %	0 %	50 %	25 %	170016333
55	NC_010470	TAGT	2	8	19748	19755	25 %	50 %	25 %	0 %	170016333
56	NC_010470	ATTT	2	8	21139	21146	25 %	75 %	0 %	0 %	170016335
57	NC_010470	AACA	2	8	21884	21891	75 %	0 %	0 %	25 %	170016336
58	NC_010470	TCAA	2	8	22003	22010	50 %	25 %	0 %	25 %	170016337
59	NC_010470	AAGC	2	8	23896	23903	50 %	0 %	25 %	25 %	170016340
60	NC_010470	CAAT	2	8	24019	24026	50 %	25 %	0 %	25 %	170016340
61	NC_010470	ATCA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	0 %	25 %	170016340
62	NC_010470	ACAA	2	8	24780	24787	75 %	0 %	0 %	25 %	170016340
63	NC_010470	TGGT	2	8	26108	26115	0 %	50 %	50 %	0 %	170016343
64	NC_010470	TGAT	2	8	26329	26336	25 %	50 %	25 %	0 %	170016343
65	NC_010470	AGTG	2	8	26345	26352	25 %	25 %	50 %	0 %	170016343
66	NC_010470	TGAT	2	8	27331	27338	25 %	50 %	25 %	0 %	170016343
67	NC_010470	TTAA	2	8	28452	28459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010470	GTTT	2	8	28623	28630	0 %	75 %	25 %	0 %	170016345
69	NC_010470	GTTA	2	8	28686	28693	25 %	50 %	25 %	0 %	170016345
70	NC_010470	AAAG	2	8	29409	29416	75 %	0 %	25 %	0 %	170016345
71	NC_010470	GTTT	2	8	29658	29665	0 %	75 %	25 %	0 %	170016345
72	NC_010470	TTGG	2	8	29770	29777	0 %	50 %	50 %	0 %	170016345
73	NC_010470	GTTA	2	8	29911	29918	25 %	50 %	25 %	0 %	170016345
74	NC_010470	AAAC	2	8	30075	30082	75 %	0 %	0 %	25 %	170016345
75	NC_010470	AAAC	2	8	30298	30305	75 %	0 %	0 %	25 %	170016345
76	NC_010470	ATTG	2	8	31048	31055	25 %	50 %	25 %	0 %	170016348
77	NC_010470	ATCA	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	170016348
78	NC_010470	AGTT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	25 %	0 %	170016349
79	NC_010470	AGCC	2	8	32267	32274	25 %	0 %	25 %	50 %	170016350
80	NC_010470	TGTC	2	8	32902	32909	0 %	50 %	25 %	25 %	170016351
81	NC_010470	TTGG	2	8	33069	33076	0 %	50 %	50 %	0 %	170016351
82	NC_010470	AAAG	2	8	34041	34048	75 %	0 %	25 %	0 %	170016351
83	NC_010470	GAAA	2	8	34121	34128	75 %	0 %	25 %	0 %	170016352
84	NC_010470	GATT	2	8	34640	34647	25 %	50 %	25 %	0 %	170016352
85	NC_010470	TCGC	2	8	35067	35074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010470	ATGA	2	8	35299	35306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010470	TGAT	2	8	36496	36503	25 %	50 %	25 %	0 %	170016354
88	NC_010470	ATAA	2	8	36712	36719	75 %	25 %	0 %	0 %	170016354
89	NC_010470	TAAA	2	8	36772	36779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010470	TTTG	2	8	36857	36864	0 %	75 %	25 %	0 %	170016355
91	NC_010470	AGTG	2	8	36893	36900	25 %	25 %	50 %	0 %	170016355
92	NC_010470	AAAG	2	8	37071	37078	75 %	0 %	25 %	0 %	170016355
93	NC_010470	AGTT	2	8	37720	37727	25 %	50 %	25 %	0 %	170016357
94	NC_010470	TAAA	2	8	37770	37777	75 %	25 %	0 %	0 %	170016357
95	NC_010470	TATT	2	8	38524	38531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.