MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	TTA	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	TCG	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
3	NC_010470	AGC	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
4	NC_010470	AGT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
5	NC_010470	AGT	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
6	NC_010470	AGT	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
7	NC_010470	AGT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
8	NC_010470	AGT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
9	NC_010470	AGT	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
10	NC_010470	AGT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
11	NC_010470	AGT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
12	NC_010470	AGT	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
13	NC_010470	AGT	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
14	NC_010470	AGT	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
15	NC_010470	AGT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
16	NC_010470	AGT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
17	NC_010470	AGT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
18	NC_010470	AGT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
19	NC_010470	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
20	NC_010470	TGG	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
21	NC_010470	CTG	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
22	NC_010470	TAT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
23	NC_010470	ATG	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
24	NC_010470	ATA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
25	NC_010470	ACT	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
26	NC_010470	AAC	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
27	NC_010470	TTA	2	6	1449	1454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
28	NC_010470	TGC	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016309
29	NC_010470	ACG	2	6	1543	1548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
30	NC_010470	TGT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
31	NC_010470	ATG	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
32	NC_010470	AGT	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
33	NC_010470	GAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
34	NC_010470	ACA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
35	NC_010470	CAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
36	NC_010470	CTA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
37	NC_010470	GAT	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
38	NC_010470	CCA	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016309
39	NC_010470	CAG	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
40	NC_010470	AAG	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
41	NC_010470	TGA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
42	NC_010470	AAC	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
43	NC_010470	CAG	2	6	2279	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
44	NC_010470	AAT	2	6	2299	2304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
45	NC_010470	GTG	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
46	NC_010470	AAC	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
47	NC_010470	GTT	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
48	NC_010470	GTG	2	6	2641	2646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
49	NC_010470	CAG	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
50	NC_010470	AGT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
51	NC_010470	CAG	2	6	2954	2959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
52	NC_010470	AAG	2	6	2966	2971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
53	NC_010470	TGA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
54	NC_010470	AAC	2	6	3033	3038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
55	NC_010470	CAG	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
56	NC_010470	AAT	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
57	NC_010470	GTG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
58	NC_010470	AAC	2	6	3426	3431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
59	NC_010470	GTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
60	NC_010470	GTG	2	6	3484	3489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
61	NC_010470	CAG	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
62	NC_010470	AGT	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
63	NC_010470	CAG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
64	NC_010470	AAG	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
65	NC_010470	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
66	NC_010470	AAC	2	6	3876	3881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
67	NC_010470	CAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
68	NC_010470	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
69	NC_010470	GTG	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
70	NC_010470	AAC	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
71	NC_010470	GTT	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
72	NC_010470	GTG	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
73	NC_010470	CAG	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
74	NC_010470	AGT	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
75	NC_010470	CAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
76	NC_010470	AAG	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
77	NC_010470	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
78	NC_010470	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
79	NC_010470	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
80	NC_010470	AAT	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
81	NC_010470	GTG	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
82	NC_010470	AAC	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
83	NC_010470	GTT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016309
84	NC_010470	GTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016309
85	NC_010470	CAG	2	6	5234	5239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
86	NC_010470	AGT	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
87	NC_010470	CAG	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
88	NC_010470	AAG	2	6	5495	5500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016309
89	NC_010470	TGA	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
90	NC_010470	AAC	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
91	NC_010470	CAG	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
92	NC_010470	AAT	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016309
93	NC_010470	CAA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
94	NC_010470	AGC	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016309
95	NC_010470	CTA	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016309
96	NC_010470	CAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016309
97	NC_010470	TTA	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016309
98	NC_010470	AGT	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016309
99	NC_010470	GAT	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010470	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010470	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010470	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016310
103	NC_010470	GTT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016310
104	NC_010470	CAA	2	6	6432	6437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016310
105	NC_010470	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010470	AAT	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010470	GAA	2	6	6902	6907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016311
108	NC_010470	AAC	3	9	6946	6954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016311
109	NC_010470	ATT	2	6	7061	7066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016311
110	NC_010470	AAG	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016311
111	NC_010470	AGG	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016311
112	NC_010470	TGA	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016311
113	NC_010470	ACA	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016311
114	NC_010470	GAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016311
115	NC_010470	TTA	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010470	TCT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010470	TTG	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016312
118	NC_010470	GAA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016312
119	NC_010470	TTA	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010470	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010470	ACA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010470	CCG	2	6	7975	7980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010470	AAG	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016313
124	NC_010470	CGA	3	9	8089	8097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016313
125	NC_010470	GAA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016313
126	NC_010470	TGA	2	6	8185	8190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016313
127	NC_010470	TGT	2	6	8291	8296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016313
128	NC_010470	GAT	2	6	8330	8335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016313
129	NC_010470	CAG	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016314
130	NC_010470	TAA	2	6	8630	8635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010470	ACC	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016315
132	NC_010470	CCA	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016315
133	NC_010470	GTT	2	6	9036	9041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016315
134	NC_010470	GTG	2	6	9042	9047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016315
135	NC_010470	TGA	2	6	9087	9092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016315
136	NC_010470	TTG	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016315
137	NC_010470	TAA	2	6	9123	9128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016315
138	NC_010470	TAA	2	6	9232	9237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016315
139	NC_010470	TGT	2	6	9314	9319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016315
140	NC_010470	CAA	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016315
141	NC_010470	CAA	2	6	9513	9518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016315
142	NC_010470	CAA	2	6	9658	9663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016315
143	NC_010470	TAT	2	6	9669	9674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016315
144	NC_010470	CAA	2	6	9787	9792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016315
145	NC_010470	TAA	2	6	9840	9845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016315
146	NC_010470	ACT	2	6	9881	9886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016315
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149	NC_010470	TCA	2	6	10207	10212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016316
150	NC_010470	TGA	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016316
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152	NC_010470	CTC	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_010470	TTG	2	6	10610	10615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016317
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156	NC_010470	TAT	3	9	10778	10786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016317
157	NC_010470	ACT	2	6	10807	10812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016317
158	NC_010470	AAG	2	6	11021	11026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016318
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165	NC_010470	TTA	2	6	11744	11749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010470	TAA	3	9	12461	12469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_010470	GTT	2	6	12691	12696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_010470	TAT	2	6	12835	12840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010470	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010470	AGT	2	6	12900	12905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_010470	TAT	2	6	14595	14600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_010470	ATA	2	6	16408	16413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_010470	TCT	2	6	16492	16497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_010470	AAT	2	6	16635	16640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_010470	AGT	2	6	16682	16687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_010470	AAC	2	6	18164	18169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016331
258	NC_010470	AAG	2	6	18205	18210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010470	TGG	2	6	18469	18474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016332
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261	NC_010470	TGA	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016332
262	NC_010470	GGT	2	6	18651	18656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016332
263	NC_010470	TGT	2	6	18804	18809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016333
264	NC_010470	GGT	2	6	18940	18945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016333
265	NC_010470	GTG	2	6	19044	19049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016333
266	NC_010470	TTG	2	6	19053	19058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016333
267	NC_010470	AGA	2	6	19225	19230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016333
268	NC_010470	TGA	2	6	19282	19287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
269	NC_010470	CAA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016333
270	NC_010470	GTC	2	6	19368	19373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016333
271	NC_010470	ATG	2	6	19496	19501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
272	NC_010470	TGA	2	6	19507	19512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
273	NC_010470	TGA	2	6	19645	19650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016333
274	NC_010470	CTG	2	6	19872	19877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_010470	CTG	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_010470	TGG	2	6	19914	19919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_010470	CTC	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_010470	TAA	2	6	20118	20123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010470	TGA	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_010470	TGA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016334
281	NC_010470	TTG	2	6	20344	20349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016334
282	NC_010470	AGG	2	6	20368	20373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016334
283	NC_010470	ATA	2	6	20410	20415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016334
284	NC_010470	ATG	2	6	20575	20580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
285	NC_010470	TGA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
286	NC_010470	ATT	2	6	20705	20710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016335
287	NC_010470	TGG	2	6	20832	20837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016335
288	NC_010470	TGT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016335
289	NC_010470	TGG	2	6	20982	20987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016335
290	NC_010470	TGG	2	6	21126	21131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016335
291	NC_010470	TCA	2	6	21157	21162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016335
292	NC_010470	TTG	2	6	21215	21220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016335
293	NC_010470	GTT	2	6	21327	21332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016335
294	NC_010470	ATT	2	6	21347	21352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016335
295	NC_010470	GTT	2	6	21373	21378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016335
296	NC_010470	GTA	2	6	21427	21432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
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298	NC_010470	TGA	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
299	NC_010470	TGA	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016335
300	NC_010470	GGA	2	6	21667	21672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016336
301	NC_010470	TGC	2	6	21781	21786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016336
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303	NC_010470	TCA	2	6	21924	21929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016336
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311	NC_010470	ATT	2	6	22507	22512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016337
312	NC_010470	GAT	2	6	22624	22629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016337
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320	NC_010470	ATA	2	6	23128	23133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016338
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383	NC_010470	GTA	2	6	26920	26925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
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498	NC_010470	GAT	2	6	35401	35406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016353
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500	NC_010470	TGT	2	6	35553	35558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016353

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