MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	TTA	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	GAT	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010470	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010470	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010470	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010470	AAT	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010470	TTA	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010470	TCT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010470	TTA	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010470	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010470	ACA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010470	CCG	2	6	7975	7980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010470	TAA	2	6	8630	8635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010470	CTC	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010470	TCG	2	6	11444	11449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010470	TAT	2	6	11703	11708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010470	TTA	2	6	11744	11749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010470	GAA	2	6	11774	11779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010470	ATA	2	6	12447	12452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010470	TAA	3	9	12461	12469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010470	GTT	2	6	12473	12478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010470	GGT	3	9	12497	12505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010470	GTT	2	6	12691	12696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010470	TTG	2	6	12700	12705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010470	TTG	2	6	12808	12813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010470	TAT	2	6	12835	12840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010470	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010470	AGT	2	6	12900	12905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010470	TGT	2	6	14468	14473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010470	TAA	2	6	14510	14515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010470	CCA	2	6	14534	14539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010470	TAT	2	6	14595	14600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010470	ACA	2	6	14601	14606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010470	TGT	2	6	14616	14621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010470	ACT	2	6	14775	14780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010470	GTA	2	6	14826	14831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010470	CAA	2	6	15154	15159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010470	CTT	2	6	15160	15165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010470	ATA	3	9	15217	15225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010470	TGT	2	6	15244	15249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010470	TGG	2	6	15283	15288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010470	TTG	2	6	16382	16387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010470	ATA	2	6	16408	16413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010470	TCT	2	6	16492	16497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010470	AAT	2	6	16635	16640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010470	AGT	2	6	16682	16687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010470	TGA	2	6	16717	16722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010470	ACT	2	6	16751	16756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010470	GTT	2	6	16925	16930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010470	TTG	2	6	16992	16997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010470	AAG	2	6	18205	18210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010470	CTG	2	6	19872	19877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010470	CTG	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010470	TGG	2	6	19914	19919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010470	CTC	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010470	TAA	2	6	20118	20123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010470	TGA	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010470	GAG	2	6	22957	22962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010470	ATC	2	6	25617	25622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010470	GTG	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010470	GGT	2	6	28262	28267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010470	AGT	2	6	28505	28510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010470	TCT	2	6	34769	34774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010470	TTG	2	6	34845	34850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010470	GAA	2	6	34975	34980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010470	TTA	2	6	35129	35134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010470	CAA	2	6	35160	35165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010470	ACA	2	6	35209	35214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010470	CCG	2	6	35237	35242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010470	TTG	2	6	35957	35962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010470	ACC	2	6	36003	36008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010470	CAG	2	6	36196	36201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010470	GTA	2	6	36728	36733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010470	TAT	2	6	36738	36743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010470	AAG	2	6	37583	37588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010470	TTA	2	6	38512	38517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010470	AAT	3	9	38532	38540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010470	ATT	2	6	38560	38565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010470	AAG	2	6	38644	38649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010470	ATT	2	6	38668	38673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.