Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK4
Total Repeats: 31
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_010469 | GTGA | 2 | 8 | 218 | 225 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 170016295 |
2 | NC_010469 | GTAA | 2 | 8 | 1647 | 1654 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 170016297 |
3 | NC_010469 | AGAT | 2 | 8 | 1736 | 1743 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 170016297 |
4 | NC_010469 | ATTA | 2 | 8 | 3773 | 3780 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 170016298 |
5 | NC_010469 | TAAT | 2 | 8 | 4746 | 4753 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 170016299 |
6 | NC_010469 | AGTA | 2 | 8 | 4805 | 4812 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 170016299 |
7 | NC_010469 | ACAA | 2 | 8 | 5565 | 5572 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016300 |
8 | NC_010469 | CAAA | 2 | 8 | 5580 | 5587 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016300 |
9 | NC_010469 | ACAA | 2 | 8 | 5655 | 5662 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016300 |
10 | NC_010469 | ACAA | 2 | 8 | 5689 | 5696 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016300 |
11 | NC_010469 | ACAA | 2 | 8 | 5968 | 5975 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016300 |
12 | NC_010469 | GAAA | 2 | 8 | 6693 | 6700 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 170016302 |
13 | NC_010469 | ATTT | 2 | 8 | 6789 | 6796 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 170016302 |
14 | NC_010469 | AGAA | 2 | 8 | 6815 | 6822 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 170016302 |
15 | NC_010469 | ACTA | 2 | 8 | 7180 | 7187 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 170016303 |
16 | NC_010469 | AACA | 2 | 8 | 7354 | 7361 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 170016304 |
17 | NC_010469 | AGCC | 2 | 8 | 7784 | 7791 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 170016304 |
18 | NC_010469 | GAAA | 2 | 8 | 8070 | 8077 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 170016304 |
19 | NC_010469 | CGTT | 2 | 8 | 8117 | 8124 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 170016304 |
20 | NC_010469 | TCAA | 2 | 8 | 8198 | 8205 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 170016304 |
21 | NC_010469 | AACC | 2 | 8 | 8206 | 8213 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 170016304 |
22 | NC_010469 | TCAA | 2 | 8 | 8255 | 8262 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 170016304 |
23 | NC_010469 | GAAG | 2 | 8 | 8674 | 8681 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 170016304 |
24 | NC_010469 | TCAA | 2 | 8 | 8700 | 8707 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 170016304 |
25 | NC_010469 | AAAG | 2 | 8 | 9129 | 9136 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 170016304 |
26 | NC_010469 | TTTC | 2 | 8 | 9908 | 9915 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 170016305 |
27 | NC_010469 | CGAA | 2 | 8 | 11060 | 11067 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 170016306 |
28 | NC_010469 | GGCT | 2 | 8 | 11748 | 11755 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 170016307 |
29 | NC_010469 | CGTG | 2 | 8 | 11851 | 11858 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 170016307 |
30 | NC_010469 | ACCA | 2 | 8 | 11881 | 11888 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 170016307 |
31 | NC_010469 | AGTC | 2 | 8 | 11914 | 11921 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 170016307 |