MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK4

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010469	AAT	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010469	TAT	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010469	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
4	NC_010469	CTG	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016295
5	NC_010469	TGA	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016295
6	NC_010469	TTG	2	6	350	355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016295
7	NC_010469	TTA	2	6	479	484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016295
8	NC_010469	ACA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
9	NC_010469	TAA	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016296
10	NC_010469	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016296
11	NC_010469	GAT	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016296
12	NC_010469	ATT	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016296
13	NC_010469	CAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
14	NC_010469	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
15	NC_010469	GAA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016296
16	NC_010469	TCA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016297
17	NC_010469	TGA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016297
18	NC_010469	ACA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016297
19	NC_010469	CTC	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010469	TCC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010469	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010469	TTA	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010469	CCG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010469	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010469	GAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010469	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
27	NC_010469	ACC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016298
28	NC_010469	GTT	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016298
29	NC_010469	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016298
30	NC_010469	AAG	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
31	NC_010469	TGC	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
32	NC_010469	ACA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016298
33	NC_010469	GAA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
34	NC_010469	AAG	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
35	NC_010469	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016298
36	NC_010469	CTG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
37	NC_010469	GAA	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
38	NC_010469	TAA	2	6	3920	3925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010469	CAT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010469	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010469	TAT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010469	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010469	ATA	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010469	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010469	GTC	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016299
46	NC_010469	ATA	2	6	4407	4412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
47	NC_010469	CAA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016299
48	NC_010469	AAT	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
49	NC_010469	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016299
50	NC_010469	GAC	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
51	NC_010469	GAA	2	6	4889	4894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
52	NC_010469	GCA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
53	NC_010469	GAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
54	NC_010469	GAT	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
55	NC_010469	AAG	2	6	5175	5180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
56	NC_010469	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016299
57	NC_010469	GAG	2	6	5514	5519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016300
58	NC_010469	GTT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016300
59	NC_010469	TGA	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
60	NC_010469	CAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016300
61	NC_010469	GAA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
62	NC_010469	ATG	3	9	5938	5946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
63	NC_010469	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
64	NC_010469	GTG	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016300
65	NC_010469	AGA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010469	TCT	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010469	TTG	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016301
68	NC_010469	GAA	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016301
69	NC_010469	AAT	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010469	AGG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010469	AGG	2	6	6572	6577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010469	TAG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
73	NC_010469	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
74	NC_010469	TAC	2	6	6798	6803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
75	NC_010469	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
76	NC_010469	GAT	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
77	NC_010469	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016302
78	NC_010469	AGA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016302
79	NC_010469	CAT	3	9	7024	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
80	NC_010469	TGC	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016303
81	NC_010469	AGG	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010469	TCA	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016304
83	NC_010469	GGA	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016304
84	NC_010469	ATG	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
85	NC_010469	TCT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
86	NC_010469	ATG	3	9	7792	7800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
87	NC_010469	TGG	2	6	8187	8192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016304
88	NC_010469	TGC	2	6	8346	8351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016304
89	NC_010469	TCT	2	6	8366	8371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
90	NC_010469	CTT	3	9	8413	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016304
91	NC_010469	TTG	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016304
92	NC_010469	TTA	2	6	8518	8523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
93	NC_010469	TTA	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
94	NC_010469	TGA	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
95	NC_010469	GCA	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016304
96	NC_010469	GCT	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016304
97	NC_010469	ATG	2	6	8849	8854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016304
98	NC_010469	AAC	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016304
99	NC_010469	TTA	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
100	NC_010469	TTA	2	6	8986	8991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016304
101	NC_010469	ATA	2	6	9026	9031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016304
102	NC_010469	GTC	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016304
103	NC_010469	CAT	2	6	9354	9359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016304
104	NC_010469	GCA	2	6	9373	9378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016304
105	NC_010469	GCA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016304
106	NC_010469	AGA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016304
107	NC_010469	AAT	2	6	9750	9755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016305
108	NC_010469	TTC	2	6	9929	9934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016305
109	NC_010469	TTC	2	6	9937	9942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016305
110	NC_010469	TTC	2	6	10012	10017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016305
111	NC_010469	CTT	2	6	10022	10027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016305
112	NC_010469	GCT	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010469	ATC	2	6	10252	10257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010469	TAG	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010469	GTT	2	6	10416	10421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010469	ATA	2	6	10437	10442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010469	AAT	2	6	10495	10500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010469	CTC	2	6	10525	10530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010469	ATT	2	6	10617	10622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010469	TGT	2	6	10649	10654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010469	ATG	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016306
122	NC_010469	GGT	2	6	10806	10811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016306
123	NC_010469	TTA	2	6	10824	10829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016306
124	NC_010469	CGG	2	6	10917	10922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170016306
125	NC_010469	CAA	2	6	10941	10946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016306
126	NC_010469	AAT	2	6	11043	11048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016306
127	NC_010469	GGT	2	6	11097	11102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016306
128	NC_010469	GCT	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016306
129	NC_010469	GTT	2	6	11153	11158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016306
130	NC_010469	ATA	2	6	11191	11196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016306
131	NC_010469	TGC	2	6	11282	11287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016306
132	NC_010469	TAA	2	6	11350	11355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016307
133	NC_010469	GGC	2	6	11371	11376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170016307
134	NC_010469	TCG	2	6	11388	11393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016307
135	NC_010469	TGT	2	6	11461	11466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016307
136	NC_010469	CAA	2	6	11512	11517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016307
137	NC_010469	GAT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016307
138	NC_010469	TTA	2	6	11618	11623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016307
139	NC_010469	GAT	2	6	11929	11934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016307
140	NC_010469	ATG	2	6	12126	12131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.