MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ATCC 8739 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010468	AGGGGG	2	12	107497	107508	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010468	CATTGC	2	12	111699	111710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010468	GAACCA	2	12	112129	112140	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010468	GATAAA	2	12	118174	118185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010468	GGCAAA	2	12	188579	188590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010468	TGAAAT	2	12	229996	230007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010468	CGGTAT	2	12	230876	230887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010468	GCATCT	2	12	240106	240117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010468	GTTTTT	2	12	293575	293586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010468	GAATGA	2	12	311118	311129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010468	TAAATT	2	12	348591	348602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010468	TGGTCT	2	12	566330	566341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010468	GTATCT	2	12	566358	566369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010468	TTATAT	2	12	601056	601067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010468	ATAAAA	2	12	611824	611835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010468	AATGCA	2	12	613721	613732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010468	CGGTTA	2	12	624486	624497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010468	AGGGAG	2	12	656310	656321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010468	ATCATT	2	12	679357	679368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010468	AAAAAG	2	12	680192	680203	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010468	TACAAC	2	12	684868	684879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010468	TGAGTT	2	12	771324	771335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010468	ACGAAA	2	12	773653	773664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010468	CTGCGT	2	12	780300	780311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010468	TTCCAT	2	12	799953	799964	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010468	AATCTG	2	12	800526	800537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010468	CTCAGT	2	12	830895	830906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010468	TATAAC	2	12	833267	833278	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010468	ACGCAG	2	12	841433	841444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010468	CCTCAC	2	12	863635	863646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010468	TCGCGA	2	12	871578	871589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010468	AAATAA	2	12	923656	923667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010468	AACAAA	2	12	973399	973410	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010468	TCTTGT	2	12	998335	998346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010468	AAAACC	2	12	1002666	1002677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010468	ATCATT	2	12	1016066	1016077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010468	CGTTGA	2	12	1016631	1016642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010468	TAAGAT	2	12	1067209	1067220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010468	AAACTG	2	12	1208767	1208778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010468	TGTCCA	2	12	1223354	1223365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010468	CAGCCC	2	12	1308196	1308207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010468	CCAGCA	2	12	1308635	1308646	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010468	ATTGAT	2	12	1349712	1349723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010468	TGCACT	2	12	1383915	1383926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010468	CATAAC	2	12	1398229	1398240	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010468	CATCAG	2	12	1416070	1416081	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010468	GAATAA	2	12	1445842	1445853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010468	TTTTCT	2	12	1470097	1470108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010468	GTGACA	2	12	1480377	1480388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010468	CATTTA	2	12	1494012	1494023	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010468	GGGTAA	2	12	1511886	1511897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010468	TAGTGG	2	12	1546883	1546894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010468	GGAAGA	2	12	1631326	1631337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010468	AACAGG	2	12	1679297	1679308	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010468	AGGGGG	2	12	1739764	1739775	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010468	ACAAAA	2	12	1770390	1770401	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010468	GCTGGG	2	12	1778999	1779010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010468	GAAAGG	2	12	1843791	1843802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010468	CCAGAT	2	12	1844923	1844934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010468	TGTCTG	2	12	1857560	1857571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010468	GTCAGG	2	12	1862097	1862108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010468	GAAAGG	2	12	1870377	1870388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010468	CCAGAT	2	12	1871462	1871473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010468	GGAGAT	2	12	1881825	1881836	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010468	TAAATA	2	12	1883184	1883195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010468	ATAAGA	2	12	1916219	1916230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010468	TGAATT	2	12	1930036	1930047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010468	GACAGT	2	12	1978376	1978387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010468	ACGTTG	2	12	2008358	2008369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010468	ATGTTT	2	12	2022807	2022818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010468	TATAAA	2	12	2022854	2022865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010468	AAAGAA	2	12	2026751	2026762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010468	GTAATA	2	12	2044766	2044777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010468	CTGTTC	2	12	2113215	2113226	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010468	CTTTTT	2	12	2152075	2152086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010468	AGTCTT	2	12	2160997	2161008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010468	AAAACA	2	12	2161257	2161268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010468	TTATTT	2	12	2161889	2161900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010468	TAAGTA	2	12	2175545	2175556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010468	GAACAG	2	12	2216280	2216291	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010468	CTTCGC	2	12	2222473	2222484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010468	GTTTTT	2	12	2277769	2277780	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010468	AAAAAT	2	12	2311211	2311222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010468	ATATTT	2	12	2312931	2312942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010468	CATAAC	2	12	2364398	2364409	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010468	TAACGG	2	12	2373229	2373240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010468	TATGAA	2	12	2376516	2376527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010468	ATTAAT	2	12	2387413	2387424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010468	GTTTTT	2	12	2388102	2388113	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010468	CTCATA	2	12	2413056	2413067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010468	GCTTAT	2	12	2413429	2413440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010468	TAGCGC	2	12	2477573	2477584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010468	CACCAT	2	12	2477993	2478004	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010468	ATTGAT	2	12	2480091	2480102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010468	GTGCCG	2	12	2483085	2483096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010468	GTGCCG	2	12	2483673	2483684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010468	GTGCCG	2	12	2484261	2484272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010468	GTGCCG	2	12	2484555	2484566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010468	AGTTAT	2	12	2569353	2569364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010468	GATCAG	2	12	2615618	2615629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010468	CCCCCG	2	12	2617877	2617888	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_010468	CTTTTG	2	12	2626096	2626107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010468	CGCAGC	2	12	2646216	2646227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010468	GGGTAT	2	12	2647882	2647893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010468	AGCCTG	2	12	2685318	2685329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010468	TCGAGT	2	12	2685450	2685461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010468	AAGCGT	2	12	2685470	2685481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010468	GCCTGT	2	12	2704502	2704513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010468	ATCGCT	2	12	2706454	2706465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010468	ACAAAA	2	12	2706855	2706866	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010468	TTTTTG	2	12	2788678	2788689	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010468	AAATAA	2	12	2790767	2790778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010468	TTAACA	2	12	2835637	2835648	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010468	CATTAT	2	12	2878891	2878902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010468	TCCTTA	2	12	2880305	2880316	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010468	TGGACA	2	12	2902573	2902584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010468	ATCTTT	2	12	2923204	2923215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010468	TTCCAG	2	12	2946171	2946182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010468	CGGTTA	2	12	2988348	2988359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010468	ATATCA	2	12	3046886	3046897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010468	ATACAT	2	12	3046932	3046943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010468	TTTCTG	2	12	3113399	3113410	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010468	CAGAAA	2	12	3139079	3139090	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010468	AACGCA	2	12	3152204	3152215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010468	AATTGA	2	12	3173701	3173712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010468	TATTTT	2	12	3252470	3252481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010468	GCCAGC	2	12	3298732	3298743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010468	CGATAA	2	12	3335009	3335020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010468	ATTTGC	2	12	3344571	3344582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010468	TCACCA	2	12	3349753	3349764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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138	NC_010468	GAAATA	2	12	3635886	3635897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_010468	CTGCAC	2	12	3662135	3662146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.