MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK3

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010467	TAT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010467	ATA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010467	ATA	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016274
4	NC_010467	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016274
5	NC_010467	AAG	2	6	535	540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016274
6	NC_010467	TTA	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016274
7	NC_010467	AAT	2	6	711	716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016274
8	NC_010467	ACA	2	6	722	727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016274
9	NC_010467	TGA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
10	NC_010467	GAT	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
11	NC_010467	GAT	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016274
12	NC_010467	AAG	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016274
13	NC_010467	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016274
14	NC_010467	TGA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016275
15	NC_010467	GAC	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016275
16	NC_010467	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016275
17	NC_010467	AGA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016275
18	NC_010467	TAA	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016275
19	NC_010467	AGA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016275
20	NC_010467	ATC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016275
21	NC_010467	GTG	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016275
22	NC_010467	TGT	2	6	2074	2079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010467	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010467	TGA	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016276
25	NC_010467	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
26	NC_010467	AAT	2	6	2258	2263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016276
27	NC_010467	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016276
28	NC_010467	CTG	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016276
29	NC_010467	CTT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016276
30	NC_010467	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
31	NC_010467	TAT	2	6	2520	2525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
32	NC_010467	GAT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016276
33	NC_010467	TTC	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016276
34	NC_010467	ATT	2	6	2728	2733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
35	NC_010467	TTG	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016276
36	NC_010467	AGA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016276
37	NC_010467	TAT	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016276
38	NC_010467	TAA	2	6	3062	3067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010467	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010467	CGT	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010467	ATT	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010467	GAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010467	TAA	2	6	3653	3658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010467	AAT	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010467	TCA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010467	TGG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010467	TTG	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010467	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010467	AAT	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016277
50	NC_010467	GTT	2	6	4147	4152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
51	NC_010467	TAA	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016277
52	NC_010467	TGT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
53	NC_010467	TGG	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016277
54	NC_010467	TCA	2	6	4368	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016277
55	NC_010467	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016277
56	NC_010467	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010467	ACA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010467	ATA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010467	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010467	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010467	AAC	2	6	4892	4897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010467	GTC	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010467	AAT	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010467	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010467	AGA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010467	TTG	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010467	CTA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016278
68	NC_010467	AAC	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016278
69	NC_010467	TAT	2	6	5539	5544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016278
70	NC_010467	ATC	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016278
71	NC_010467	TGA	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016278
72	NC_010467	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016278
73	NC_010467	AGT	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016278
74	NC_010467	GTT	2	6	5800	5805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016278
75	NC_010467	TCC	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016278
76	NC_010467	ACA	2	6	5885	5890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016278
77	NC_010467	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016278
78	NC_010467	TAG	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010467	TTA	2	6	6047	6052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010467	AAC	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010467	AAT	2	6	6111	6116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010467	TAT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010467	ACT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016279
84	NC_010467	TCA	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016279
85	NC_010467	ATT	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016279
86	NC_010467	CTC	2	6	6274	6279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016279
87	NC_010467	GTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016279
88	NC_010467	TCC	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016279
89	NC_010467	TTG	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016279
90	NC_010467	CCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010467	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010467	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010467	AAT	2	6	7096	7101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010467	TTA	2	6	7213	7218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016280
95	NC_010467	GTG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016280
96	NC_010467	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016280
97	NC_010467	ATA	2	6	7474	7479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
98	NC_010467	AAT	2	6	7505	7510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
99	NC_010467	AAT	3	9	7553	7561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
100	NC_010467	GTC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016280
101	NC_010467	ATA	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
102	NC_010467	ATG	2	6	7678	7683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016280
103	NC_010467	AAT	2	6	7684	7689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016280
104	NC_010467	ATT	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010467	TAA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010467	AGT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010467	AAC	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010467	AAT	2	6	8011	8016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010467	ATT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010467	GTT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010467	CAC	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010467	TGA	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010467	ATA	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010467	ATT	2	6	8464	8469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010467	TAT	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016282
116	NC_010467	GAT	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016282
117	NC_010467	AAT	2	6	8687	8692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016282
118	NC_010467	CAA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016282
119	NC_010467	TAG	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016282
120	NC_010467	TTG	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016282
121	NC_010467	TAT	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016282
122	NC_010467	TAA	2	6	8830	8835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010467	CTG	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016283
124	NC_010467	TTA	2	6	9006	9011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016283
125	NC_010467	GAT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016283
126	NC_010467	GTA	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
127	NC_010467	ATG	2	6	9196	9201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
128	NC_010467	TGC	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016284
129	NC_010467	GAT	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
130	NC_010467	GTG	2	6	9286	9291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016284
131	NC_010467	AAT	2	6	9309	9314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
132	NC_010467	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
133	NC_010467	AAG	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016284
134	NC_010467	TGA	2	6	9443	9448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
135	NC_010467	TTA	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016284
136	NC_010467	TAA	2	6	9521	9526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
137	NC_010467	TGT	2	6	9626	9631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016284
138	NC_010467	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
139	NC_010467	TTC	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016284
140	NC_010467	ATA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016284
141	NC_010467	GAT	2	6	9807	9812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016284
142	NC_010467	TAC	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
143	NC_010467	TAC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016284
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146	NC_010467	GAA	2	6	10118	10123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_010467	TAA	2	6	17964	17969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.