MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK3

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010467	TAT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010467	ATA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010467	TGT	2	6	2074	2079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010467	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010467	TAA	2	6	3062	3067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010467	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010467	CGT	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010467	ATT	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010467	GAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010467	TAA	2	6	3653	3658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010467	AAT	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010467	TCA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010467	TGG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010467	TTG	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010467	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010467	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010467	ACA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010467	ATA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010467	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010467	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010467	AAC	2	6	4892	4897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010467	GTC	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010467	AAT	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010467	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010467	AGA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010467	TTG	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010467	TAG	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010467	TTA	2	6	6047	6052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010467	AAC	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010467	AAT	2	6	6111	6116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010467	TAT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010467	CCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010467	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010467	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010467	AAT	2	6	7096	7101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010467	ATT	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010467	TAA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010467	AGT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010467	AAC	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010467	AAT	2	6	8011	8016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010467	ATT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010467	GTT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010467	CAC	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010467	TGA	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010467	ATA	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010467	ATT	2	6	8464	8469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010467	TAA	2	6	8830	8835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010467	GAA	2	6	10118	10123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010467	TAT	2	6	10878	10883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010467	AGA	3	9	10908	10916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010467	AGG	2	6	10948	10953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010467	ATA	2	6	12357	12362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010467	AGA	2	6	12423	12428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010467	AGT	2	6	12432	12437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010467	TGA	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010467	AGT	2	6	13765	13770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010467	ATA	2	6	13803	13808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010467	AGA	2	6	13843	13848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010467	AAT	2	6	13912	13917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010467	TGA	2	6	14592	14597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010467	CTA	2	6	15881	15886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010467	TAT	2	6	16173	16178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010467	ATT	2	6	16195	16200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010467	CCG	2	6	16310	16315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010467	ATA	2	6	16333	16338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010467	AGG	2	6	16367	16372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010467	GAG	2	6	16498	16503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010467	TAA	2	6	17796	17801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010467	CAA	2	6	17807	17812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010467	ATT	2	6	17863	17868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010467	ATC	2	6	17891	17896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010467	TGT	2	6	17927	17932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010467	TAA	2	6	17964	17969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.