MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK2

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010466	AATT	2	8	98	105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010466	ACAA	2	8	811	818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010466	TTTA	2	8	1127	1134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010466	TATT	2	8	1174	1181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010466	CAAT	2	8	1605	1612	50 %	25 %	0 %	25 %	170016239
6	NC_010466	TCTT	2	8	1748	1755	0 %	75 %	0 %	25 %	170016239
7	NC_010466	CTTT	2	8	1902	1909	0 %	75 %	0 %	25 %	170016239
8	NC_010466	GAAA	2	8	3486	3493	75 %	0 %	25 %	0 %	170016241
9	NC_010466	GATA	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010466	CAAA	2	8	3962	3969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010466	TTGG	2	8	4707	4714	0 %	50 %	50 %	0 %	170016243
12	NC_010466	AGCC	2	8	4797	4804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010466	TGGC	2	8	4821	4828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010466	TTGA	2	8	5222	5229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010466	CAAA	2	8	5295	5302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010466	TTGT	2	8	5543	5550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010466	ATGT	2	8	5785	5792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010466	ATTT	2	8	5838	5845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010466	TTAA	2	8	5849	5856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010466	TAAA	2	8	6008	6015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010466	ATAC	2	8	6714	6721	50 %	25 %	0 %	25 %	170016244
22	NC_010466	ATTA	2	8	6993	7000	50 %	50 %	0 %	0 %	170016244
23	NC_010466	AAGT	2	8	7489	7496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010466	TTTA	2	8	7595	7602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010466	GTCA	2	8	7785	7792	25 %	25 %	25 %	25 %	170016246
26	NC_010466	TTGG	2	8	7881	7888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010466	CTTA	2	8	8019	8026	25 %	50 %	0 %	25 %	170016247
28	NC_010466	TCGA	2	8	8128	8135	25 %	25 %	25 %	25 %	170016247
29	NC_010466	AATC	2	8	8154	8161	50 %	25 %	0 %	25 %	170016247
30	NC_010466	AGCA	2	8	8225	8232	50 %	0 %	25 %	25 %	170016247
31	NC_010466	CAAA	2	8	8322	8329	75 %	0 %	0 %	25 %	170016247
32	NC_010466	TTTG	2	8	8436	8443	0 %	75 %	25 %	0 %	170016247
33	NC_010466	ACAA	2	8	8471	8478	75 %	0 %	0 %	25 %	170016247
34	NC_010466	ATTG	2	8	8684	8691	25 %	50 %	25 %	0 %	170016247
35	NC_010466	TTTC	2	8	8906	8913	0 %	75 %	0 %	25 %	170016247
36	NC_010466	AACT	2	8	9191	9198	50 %	25 %	0 %	25 %	170016248
37	NC_010466	ATTT	2	8	10423	10430	25 %	75 %	0 %	0 %	170016248
38	NC_010466	CGAA	2	8	10924	10931	50 %	0 %	25 %	25 %	170016249
39	NC_010466	TAAC	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010466	ATCC	2	8	11804	11811	25 %	25 %	0 %	50 %	170016251
41	NC_010466	TGAG	2	8	12081	12088	25 %	25 %	50 %	0 %	170016252
42	NC_010466	GCAA	2	8	12609	12616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010466	TTGT	2	8	12882	12889	0 %	75 %	25 %	0 %	170016253
44	NC_010466	TAAT	2	8	13312	13319	50 %	50 %	0 %	0 %	170016254
45	NC_010466	CCAA	2	8	14032	14039	50 %	0 %	0 %	50 %	170016255
46	NC_010466	CCAA	2	8	14869	14876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010466	ATTG	2	8	14939	14946	25 %	50 %	25 %	0 %	170016257
48	NC_010466	ACCA	2	8	15360	15367	50 %	0 %	0 %	50 %	170016258
49	NC_010466	TGAA	2	8	15433	15440	50 %	25 %	25 %	0 %	170016258
50	NC_010466	TGAA	2	8	15556	15563	50 %	25 %	25 %	0 %	170016258
51	NC_010466	TCTG	2	8	15731	15738	0 %	50 %	25 %	25 %	170016258
52	NC_010466	TCGC	2	8	16406	16413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010466	ATGA	2	8	16646	16653	50 %	25 %	25 %	0 %	170016259
54	NC_010466	TAAT	2	8	17794	17801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010466	CAAC	2	8	17902	17909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010466	GCGA	2	8	18194	18201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010466	TTAT	2	8	18855	18862	25 %	75 %	0 %	0 %	170016262
58	NC_010466	ATTC	2	8	19633	19640	25 %	50 %	0 %	25 %	170016262
59	NC_010466	CATT	2	8	19706	19713	25 %	50 %	0 %	25 %	170016262
60	NC_010466	TTGC	2	8	19779	19786	0 %	50 %	25 %	25 %	170016262
61	NC_010466	AGTT	2	8	20779	20786	25 %	50 %	25 %	0 %	170016263
62	NC_010466	AATT	2	8	22737	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	170016264
63	NC_010466	TCAG	2	8	22916	22923	25 %	25 %	25 %	25 %	170016264
64	NC_010466	GGGA	2	8	23090	23097	25 %	0 %	75 %	0 %	170016264
65	NC_010466	ATAA	2	8	23330	23337	75 %	25 %	0 %	0 %	170016264
66	NC_010466	TTCA	2	8	23652	23659	25 %	50 %	0 %	25 %	170016265
67	NC_010466	TTCG	2	8	23808	23815	0 %	50 %	25 %	25 %	170016265
68	NC_010466	TCAA	2	8	23886	23893	50 %	25 %	0 %	25 %	170016265
69	NC_010466	TTAA	2	8	24063	24070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010466	CATC	2	8	24166	24173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010466	ATAA	2	8	24524	24531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010466	TTTA	3	12	24544	24555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010466	GTGA	2	8	24723	24730	25 %	25 %	50 %	0 %	170016266
74	NC_010466	GCAC	2	8	25006	25013	25 %	0 %	25 %	50 %	170016266
75	NC_010466	GTTT	2	8	25603	25610	0 %	75 %	25 %	0 %	170016267
76	NC_010466	CCTT	2	8	26619	26626	0 %	50 %	0 %	50 %	170016269
77	NC_010466	TAAA	2	8	26863	26870	75 %	25 %	0 %	0 %	170016269
78	NC_010466	ATCA	2	8	26907	26914	50 %	25 %	0 %	25 %	170016269
79	NC_010466	TACC	2	8	27193	27200	25 %	25 %	0 %	50 %	170016270
80	NC_010466	TGCT	2	8	27287	27294	0 %	50 %	25 %	25 %	170016270
81	NC_010466	TTCT	2	8	27517	27524	0 %	75 %	0 %	25 %	170016270
82	NC_010466	ATTT	2	8	27688	27695	25 %	75 %	0 %	0 %	170016270
83	NC_010466	TAAA	2	8	27883	27890	75 %	25 %	0 %	0 %	170016270
84	NC_010466	TCTT	2	8	28221	28228	0 %	75 %	0 %	25 %	170016270
85	NC_010466	TACT	2	8	28567	28574	25 %	50 %	0 %	25 %	170016270
86	NC_010466	AGAA	2	8	28926	28933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010466	ATTT	2	8	28952	28959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010466	AGCC	2	8	29085	29092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010466	CGAC	2	8	29382	29389	25 %	0 %	25 %	50 %	170016271
90	NC_010466	CCTG	2	8	29536	29543	0 %	25 %	25 %	50 %	170016271
91	NC_010466	AGCC	2	8	29761	29768	25 %	0 %	25 %	50 %	170016271
92	NC_010466	CAAT	2	8	29910	29917	50 %	25 %	0 %	25 %	170016271
93	NC_010466	ACCA	2	8	30931	30938	50 %	0 %	0 %	50 %	170016272
94	NC_010466	TGAA	2	8	31004	31011	50 %	25 %	25 %	0 %	170016272
95	NC_010466	TGAA	2	8	31127	31134	50 %	25 %	25 %	0 %	170016272
96	NC_010466	TCTG	2	8	31302	31309	0 %	50 %	25 %	25 %	170016272

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.