MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK2

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010466	TGA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016237
2	NC_010466	GCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016237
3	NC_010466	CAC	2	6	213	218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016237
4	NC_010466	CTT	2	6	236	241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016237
5	NC_010466	TCA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016237
6	NC_010466	TTA	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010466	TCA	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010466	TTA	2	6	489	494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010466	ATA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010466	GAG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010466	CAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010466	CCA	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010466	CAG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010466	TTC	2	6	878	883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010466	TAT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010466	TGT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010466	CTA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010466	AGG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010466	TTC	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016238
20	NC_010466	TGT	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016238
21	NC_010466	TGA	2	6	1067	1072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016238
22	NC_010466	GTA	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010466	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016239
24	NC_010466	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016239
25	NC_010466	CTA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
26	NC_010466	TCA	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
27	NC_010466	TCA	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
28	NC_010466	AGT	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016239
29	NC_010466	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016239
30	NC_010466	ATC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016239
31	NC_010466	TCT	2	6	1688	1693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
32	NC_010466	GAT	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016239
33	NC_010466	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
34	NC_010466	CTT	2	6	1771	1776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
35	NC_010466	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
36	NC_010466	TCT	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016239
37	NC_010466	AGC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016239
38	NC_010466	TTA	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016239
39	NC_010466	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010466	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010466	CCG	2	6	2375	2380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010466	ATA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010466	GAG	2	6	2568	2573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010466	CAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016240
45	NC_010466	GAA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016240
46	NC_010466	CTC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170016241
47	NC_010466	GTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016241
48	NC_010466	TGA	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
49	NC_010466	AAG	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
50	NC_010466	TGC	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016241
51	NC_010466	GAA	2	6	3202	3207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
52	NC_010466	TGA	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
53	NC_010466	GAA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
54	NC_010466	AGA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
55	NC_010466	GAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016241
56	NC_010466	GAC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016241
57	NC_010466	TAG	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016241
58	NC_010466	TAA	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010466	CAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010466	TTA	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010466	TAT	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010466	AAG	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010466	AGA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010466	AAC	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016242
65	NC_010466	GGA	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016242
66	NC_010466	TAT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016243
67	NC_010466	AGC	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016243
68	NC_010466	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010466	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010466	TGA	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010466	CAT	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010466	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010466	CCA	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010466	TTA	3	9	5128	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010466	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010466	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010466	GTC	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010466	CTA	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010466	AGT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010466	ACA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010466	TGT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010466	ATA	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010466	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010466	AAT	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010466	GTA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010466	GTA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010466	TAT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010466	TAC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010466	GTA	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010466	TAT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010466	TAG	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010466	GAG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010466	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016244
94	NC_010466	ATG	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016244
95	NC_010466	AAT	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016244
96	NC_010466	ACC	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016244
97	NC_010466	TCA	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016244
98	NC_010466	ACA	2	6	6655	6660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016244
99	NC_010466	GAA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016244
100	NC_010466	TCA	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016244
101	NC_010466	AAC	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016244
102	NC_010466	ACA	2	6	7135	7140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016245
103	NC_010466	GAT	2	6	7258	7263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016245
104	NC_010466	ATC	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016245
105	NC_010466	TCA	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016246
106	NC_010466	AGA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016246
107	NC_010466	GAA	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016246
108	NC_010466	AGC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010466	AAT	2	6	8041	8046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
110	NC_010466	GTT	2	6	8055	8060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016247
111	NC_010466	TCA	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
112	NC_010466	ATA	2	6	8282	8287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
113	NC_010466	AAC	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016247
114	NC_010466	TGG	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016247
115	NC_010466	CCA	3	9	8780	8788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016247
116	NC_010466	AAT	2	6	8797	8802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
117	NC_010466	ATC	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
118	NC_010466	ACA	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016247
119	NC_010466	TCA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016247
120	NC_010466	AAT	2	6	8860	8865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016247
121	NC_010466	GTT	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016248
122	NC_010466	TGA	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016248
123	NC_010466	AAC	2	6	9345	9350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016248
124	NC_010466	ATA	2	6	9408	9413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
125	NC_010466	AAC	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016248
126	NC_010466	AAT	2	6	9455	9460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
127	NC_010466	GAT	3	9	9469	9477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016248
128	NC_010466	CGA	2	6	9783	9788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016248
129	NC_010466	AAT	2	6	9872	9877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016248
130	NC_010466	TTG	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016248
131	NC_010466	CTT	2	6	10017	10022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016248
132	NC_010466	GCA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016248
133	NC_010466	TTC	2	6	10498	10503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016249
134	NC_010466	GAG	2	6	10623	10628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016249
135	NC_010466	AAT	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016249
136	NC_010466	TAG	2	6	10800	10805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016249
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265	NC_010466	ATG	2	6	20349	20354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016263
266	NC_010466	CAG	3	9	20451	20459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016263
267	NC_010466	CTG	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016263
268	NC_010466	TGT	2	6	20548	20553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016263
269	NC_010466	ATG	2	6	20571	20576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016263
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277	NC_010466	GGT	2	6	21077	21082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016263
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388	NC_010466	ATG	2	6	30393	30398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
389	NC_010466	GCT	2	6	30532	30537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016271
390	NC_010466	GGC	2	6	30599	30604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170016271
391	NC_010466	ATG	2	6	30605	30610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
392	NC_010466	ATG	2	6	30680	30685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016271
393	NC_010466	GAT	2	6	30800	30805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
394	NC_010466	GCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016272
395	NC_010466	TCT	2	6	31234	31239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016272
396	NC_010466	TAA	2	6	31339	31344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016272
397	NC_010466	CCT	2	6	31444	31449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.