MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK2

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010466	TTA	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010466	TCA	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010466	TTA	2	6	489	494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010466	ATA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010466	GAG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010466	CAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010466	CCA	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010466	CAG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010466	TTC	2	6	878	883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010466	TAT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010466	TGT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010466	CTA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010466	AGG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010466	GTA	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010466	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010466	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010466	CCG	2	6	2375	2380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010466	ATA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010466	GAG	2	6	2568	2573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010466	TAA	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010466	CAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010466	TTA	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010466	TAT	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010466	AAG	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010466	AGA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010466	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010466	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010466	TGA	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010466	CAT	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010466	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010466	CCA	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010466	TTA	3	9	5128	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010466	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010466	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010466	GTC	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010466	CTA	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010466	AGT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010466	ACA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010466	TGT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010466	ATA	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010466	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010466	AAT	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010466	GTA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010466	GTA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010466	TAT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010466	TAC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010466	GTA	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010466	TAT	2	6	6071	6076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010466	TAG	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010466	GAG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010466	AGC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010466	TAG	2	6	11405	11410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010466	CTT	2	6	12439	12444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010466	TTC	2	6	12456	12461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010466	AAG	2	6	12487	12492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010466	CTA	2	6	12586	12591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010466	AAG	2	6	12695	12700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010466	CTC	2	6	14510	14515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010466	TTA	2	6	14534	14539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010466	TCC	2	6	14693	14698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010466	TCT	2	6	14726	14731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010466	TTC	2	6	14738	14743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010466	ATA	2	6	14758	14763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010466	AAT	2	6	14774	14779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010466	TTC	2	6	14857	14862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010466	TTG	2	6	15901	15906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010466	AGC	2	6	15913	15918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010466	TCT	2	6	16065	16070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010466	ATA	2	6	16081	16086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010466	TTG	2	6	16141	16146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010466	GAA	2	6	16314	16319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010466	ACG	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010466	TTG	2	6	17302	17307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010466	ACC	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010466	ATA	2	6	17746	17751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010466	ACA	2	6	17840	17845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010466	AGA	2	6	17938	17943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010466	ACA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010466	ATT	2	6	17964	17969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010466	ACA	2	6	17990	17995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010466	AAT	2	6	18057	18062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010466	TAT	2	6	18120	18125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010466	TTG	2	6	18213	18218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010466	TTG	2	6	18274	18279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010466	ATT	2	6	18297	18302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010466	CAG	2	6	18350	18355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010466	TCA	2	6	18511	18516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010466	AAT	2	6	18569	18574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010466	GGA	2	6	18579	18584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010466	GTC	2	6	19978	19983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010466	TGT	2	6	24056	24061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010466	GAT	2	6	24239	24244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010466	AGA	2	6	24311	24316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010466	TTA	2	6	24416	24421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010466	ATA	2	6	24479	24484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010466	AAG	2	6	24493	24498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010466	TCA	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010466	ATT	2	6	24556	24561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010466	AAT	2	6	25198	25203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010466	GCT	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010466	TCC	2	6	26050	26055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010466	ATG	2	6	28981	28986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010466	CAG	2	6	29057	29062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010466	CAC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010466	TTG	2	6	29108	29113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010466	TCC	2	6	29122	29127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010466	TAC	2	6	29163	29168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010466	GAT	2	6	30800	30805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010466	CCT	2	6	31444	31449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.