MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010424	GCGTGA	2	12	6978	6989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010424	ATCACC	2	12	20293	20304	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010424	GGGAAA	2	12	51368	51379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010424	GCCGTC	2	12	52833	52844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010424	CCGAAA	2	12	74044	74055	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010424	ACAATA	2	12	103718	103729	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010424	ATCTGA	2	12	162138	162149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010424	GCCCCG	2	12	175785	175796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010424	GTCCGC	2	12	177494	177505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010424	CCGCTC	2	12	177611	177622	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010424	TACACC	2	12	183223	183234	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010424	GCGCTT	2	12	224259	224270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010424	GTACTG	2	12	226195	226206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010424	TTAAAA	2	12	243621	243632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010424	GCAGGA	2	12	258357	258368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010424	TCCAAT	2	12	279109	279120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010424	TGGCGG	2	12	290003	290014	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010424	CGGCAA	2	12	290942	290953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010424	GGGGAG	2	12	302135	302146	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010424	GCCCTT	2	12	347442	347453	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010424	TGCCGC	2	12	370331	370342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010424	TTAGTT	2	12	381337	381348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010424	CAAACT	2	12	393557	393568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010424	ACGATT	2	12	398311	398322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010424	CGCTGC	2	12	401503	401514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010424	CTTGCC	2	12	404733	404744	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010424	CCGGAG	2	12	415452	415463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010424	TCGGGA	3	18	415512	415529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010424	GCGACA	2	12	435218	435229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010424	CGTTAT	2	12	443846	443857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010424	GAAGAC	2	12	444512	444523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010424	CAAGGG	2	12	447072	447083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010424	GGGCCA	2	12	479887	479898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010424	CGGTGC	2	12	500624	500635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010424	CGAGCC	2	12	501717	501728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010424	GATCCT	2	12	522890	522901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010424	GACCCA	2	12	540890	540901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010424	CGGGGG	2	12	556305	556316	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010424	ACCCGA	2	12	573451	573462	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010424	AACTGG	2	12	585085	585096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010424	GCCTGA	2	12	612572	612583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010424	GCGGTG	2	12	692152	692163	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010424	TAAGTT	2	12	692213	692224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010424	GGTTAT	2	12	705010	705021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010424	ATTTTC	2	12	733985	733996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010424	AGGTCG	2	12	734784	734795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010424	GAAATC	2	12	752341	752352	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010424	TTTGAT	2	12	767770	767781	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010424	AAGCAG	2	12	768317	768328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010424	GGAGTG	2	12	771525	771536	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010424	GAGTGC	2	12	791144	791155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010424	ACGCCC	2	12	802541	802552	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010424	GCCGTC	2	12	816677	816688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010424	TTGTAG	2	12	816815	816826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010424	GAACGT	2	12	835904	835915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010424	GGGCCT	2	12	849909	849920	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010424	CGGAAG	2	12	852990	853001	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010424	GCCCGT	2	12	855222	855233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010424	GTTTTT	2	12	865368	865379	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010424	GGGGGA	2	12	889702	889713	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010424	GGTTTT	2	12	911928	911939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010424	AGTGGA	2	12	950455	950466	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010424	TACAAA	2	12	958200	958211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010424	TATAAT	2	12	982859	982870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010424	AATTGG	2	12	1006469	1006480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010424	CAAGGG	2	12	1008157	1008168	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010424	CAAAAG	2	12	1040096	1040107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010424	ATCCTG	2	12	1068916	1068927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010424	CAAACC	2	12	1093628	1093639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010424	TTACAT	2	12	1114007	1114018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010424	TCCCGA	2	12	1168458	1168469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010424	GGGCCG	2	12	1197730	1197741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010424	CCTTGG	2	12	1252524	1252535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010424	ATGAGG	2	12	1302054	1302065	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010424	GACCCC	2	12	1331375	1331386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010424	CCTTCC	2	12	1354218	1354229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010424	CGACCA	2	12	1358533	1358544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010424	CCGGGG	2	12	1372059	1372070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010424	CAGCGG	2	12	1402630	1402641	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010424	CGGGCC	2	12	1408600	1408611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010424	CCACAA	2	12	1467746	1467757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010424	GATCCG	2	12	1496002	1496013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010424	GAGAAA	3	18	1530767	1530784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010424	CAACCC	2	12	1531378	1531389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010424	GGCTTT	2	12	1581792	1581803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010424	GCCCTT	2	12	1583456	1583467	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010424	ATTCAA	2	12	1584190	1584201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010424	AAGATA	2	12	1605367	1605378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010424	TATGCC	2	12	1612417	1612428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010424	GTTTTT	2	12	1729498	1729509	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010424	CTCCCC	2	12	1757429	1757440	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_010424	CCCCGT	2	12	1797963	1797974	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010424	CACAAA	2	12	1823723	1823734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010424	ACTTGA	2	12	1898880	1898891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010424	TATCAG	2	12	1900274	1900285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010424	GTTTCT	2	12	1907511	1907522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010424	GGTTTC	2	12	1907523	1907534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010424	GCCCTT	2	12	1960532	1960543	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010424	TATTTT	2	12	1967267	1967278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010424	CAAGGT	2	12	1981098	1981109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010424	TCCTTA	2	12	2010102	2010113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010424	TATATG	2	12	2016269	2016280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010424	TTCGGC	2	12	2021174	2021185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010424	CCGCCC	2	12	2052607	2052618	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_010424	CCGGTC	2	12	2055010	2055021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010424	ATTTTT	2	12	2093613	2093624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010424	GCCGAA	2	12	2174742	2174753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010424	CAGGCC	2	12	2212374	2212385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010424	AATGCA	2	12	2221336	2221347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010424	CGACAT	2	12	2235861	2235872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010424	CCGTGA	2	12	2295020	2295031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010424	CATGAT	2	12	2300948	2300959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010424	ACAAAC	2	12	2318145	2318156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010424	GGCCCT	2	12	2330964	2330975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.