MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 1336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010424	CGGCA	2	10	1802	1811	20 %	0 %	40 %	40 %	169830221
2	NC_010424	CGTTC	2	10	2912	2921	0 %	40 %	20 %	40 %	169830222
3	NC_010424	GTATG	2	10	3312	3321	20 %	40 %	40 %	0 %	169830222
4	NC_010424	TCCCG	2	10	7927	7936	0 %	20 %	20 %	60 %	169830227
5	NC_010424	ACCGG	2	10	8149	8158	20 %	0 %	40 %	40 %	169830227
6	NC_010424	TGGAA	2	10	15907	15916	40 %	20 %	40 %	0 %	169830232
7	NC_010424	ACCCG	2	10	19901	19910	20 %	0 %	20 %	60 %	169830234
8	NC_010424	GCCCG	2	10	20706	20715	0 %	0 %	40 %	60 %	169830235
9	NC_010424	AACGA	2	10	21890	21899	60 %	0 %	20 %	20 %	169830236
10	NC_010424	AGTGC	2	10	23967	23976	20 %	20 %	40 %	20 %	169830238
11	NC_010424	ATCGG	2	10	24657	24666	20 %	20 %	40 %	20 %	169830239
12	NC_010424	TGCGG	2	10	26218	26227	0 %	20 %	60 %	20 %	169830240
13	NC_010424	ATCGG	2	10	26397	26406	20 %	20 %	40 %	20 %	169830241
14	NC_010424	CCTTC	2	10	29651	29660	0 %	40 %	0 %	60 %	169830243
15	NC_010424	GGGAA	2	10	30144	30153	40 %	0 %	60 %	0 %	169830243
16	NC_010424	ATTGC	2	10	30271	30280	20 %	40 %	20 %	20 %	169830243
17	NC_010424	CTTTT	2	10	31521	31530	0 %	80 %	0 %	20 %	169830245
18	NC_010424	CTTTA	2	10	31770	31779	20 %	60 %	0 %	20 %	169830245
19	NC_010424	ACCCC	2	10	32490	32499	20 %	0 %	0 %	80 %	169830245
20	NC_010424	GCCCG	2	10	34563	34572	0 %	0 %	40 %	60 %	169830247
21	NC_010424	CAGGT	2	10	36013	36022	20 %	20 %	40 %	20 %	169830248
22	NC_010424	TTTGA	2	10	41990	41999	20 %	60 %	20 %	0 %	169830254
23	NC_010424	CCGGG	2	10	42776	42785	0 %	0 %	60 %	40 %	169830254
24	NC_010424	CCGAC	2	10	42786	42795	20 %	0 %	20 %	60 %	169830254
25	NC_010424	GCCCG	2	10	44412	44421	0 %	0 %	40 %	60 %	169830256
26	NC_010424	GGGGA	2	10	45664	45673	20 %	0 %	80 %	0 %	169830257
27	NC_010424	GGGCC	2	10	49043	49052	0 %	0 %	60 %	40 %	169830261
28	NC_010424	CCGTT	2	10	50837	50846	0 %	40 %	20 %	40 %	169830263
29	NC_010424	GGGCC	2	10	51219	51228	0 %	0 %	60 %	40 %	169830263
30	NC_010424	CCAGT	2	10	53387	53396	20 %	20 %	20 %	40 %	169830266
31	NC_010424	CGGCG	2	10	60239	60248	0 %	0 %	60 %	40 %	169830272
32	NC_010424	GGTCA	2	10	60588	60597	20 %	20 %	40 %	20 %	169830272
33	NC_010424	ACCAG	2	10	62057	62066	40 %	0 %	20 %	40 %	169830275
34	NC_010424	CGGAA	2	10	64438	64447	40 %	0 %	40 %	20 %	169830277
35	NC_010424	GGAGT	2	10	65553	65562	20 %	20 %	60 %	0 %	169830279
36	NC_010424	CCAAC	2	10	65682	65691	40 %	0 %	0 %	60 %	169830279
37	NC_010424	TGCTG	2	10	69289	69298	0 %	40 %	40 %	20 %	169830284
38	NC_010424	GGCGT	2	10	69716	69725	0 %	20 %	60 %	20 %	169830284
39	NC_010424	AAAAC	2	10	72838	72847	80 %	0 %	0 %	20 %	169830288
40	NC_010424	CCGGG	2	10	74430	74439	0 %	0 %	60 %	40 %	169830290
41	NC_010424	ACCGG	2	10	75149	75158	20 %	0 %	40 %	40 %	169830290
42	NC_010424	AGGCG	2	10	77246	77255	20 %	0 %	60 %	20 %	169830290
43	NC_010424	CGCGG	2	10	78689	78698	0 %	0 %	60 %	40 %	169830292
44	NC_010424	ACCAG	2	10	79850	79859	40 %	0 %	20 %	40 %	169830292
45	NC_010424	CGGGA	2	10	81117	81126	20 %	0 %	60 %	20 %	169830296
46	NC_010424	ACCGG	2	10	83255	83264	20 %	0 %	40 %	40 %	169830300
47	NC_010424	TGCAT	2	10	85590	85599	20 %	40 %	20 %	20 %	169830302
48	NC_010424	CTGGG	2	10	86404	86413	0 %	20 %	60 %	20 %	169830303
49	NC_010424	ACCGG	2	10	88723	88732	20 %	0 %	40 %	40 %	169830304
50	NC_010424	GCCGG	2	10	90980	90989	0 %	0 %	60 %	40 %	169830305
51	NC_010424	TCCGG	2	10	91843	91852	0 %	20 %	40 %	40 %	169830306
52	NC_010424	GGCGG	2	10	93360	93369	0 %	0 %	80 %	20 %	169830307
53	NC_010424	GCGGG	2	10	93410	93419	0 %	0 %	80 %	20 %	169830307
54	NC_010424	CTGGG	2	10	93552	93561	0 %	20 %	60 %	20 %	169830307
55	NC_010424	GGCGC	2	10	94277	94286	0 %	0 %	60 %	40 %	169830308
56	NC_010424	GACCG	2	10	94748	94757	20 %	0 %	40 %	40 %	169830309
57	NC_010424	ATCGG	2	10	95694	95703	20 %	20 %	40 %	20 %	169830310
58	NC_010424	AGTGA	2	10	98821	98830	40 %	20 %	40 %	0 %	169830311
59	NC_010424	CCCGG	2	10	101099	101108	0 %	0 %	40 %	60 %	169830313
60	NC_010424	GGCTG	2	10	104053	104062	0 %	20 %	60 %	20 %	169830317
61	NC_010424	ACGCC	2	10	108061	108070	20 %	0 %	20 %	60 %	169830321
62	NC_010424	TGCGG	2	10	108528	108537	0 %	20 %	60 %	20 %	169830322
63	NC_010424	GCCCT	2	10	110537	110546	0 %	20 %	20 %	60 %	169830322
64	NC_010424	GGCGC	2	10	111612	111621	0 %	0 %	60 %	40 %	169830323
65	NC_010424	GGCGC	2	10	112202	112211	0 %	0 %	60 %	40 %	169830323
66	NC_010424	ACGAA	2	10	112942	112951	60 %	0 %	20 %	20 %	169830323
67	NC_010424	TTTCA	2	10	115280	115289	20 %	60 %	0 %	20 %	169830326
68	NC_010424	CCCGG	2	10	115604	115613	0 %	0 %	40 %	60 %	169830327
69	NC_010424	CAGGC	2	10	116433	116442	20 %	0 %	40 %	40 %	169830327
70	NC_010424	GGACA	2	10	116457	116466	40 %	0 %	40 %	20 %	169830327
71	NC_010424	GTAGG	2	10	117061	117070	20 %	20 %	60 %	0 %	169830327
72	NC_010424	CTGTA	2	10	117279	117288	20 %	40 %	20 %	20 %	169830327
73	NC_010424	ACCGG	2	10	117480	117489	20 %	0 %	40 %	40 %	169830327
74	NC_010424	CCCTT	2	10	118254	118263	0 %	40 %	0 %	60 %	169830328
75	NC_010424	AGGGA	2	10	118489	118498	40 %	0 %	60 %	0 %	169830328
76	NC_010424	AGCCA	2	10	120267	120276	40 %	0 %	20 %	40 %	169830328
77	NC_010424	TGTGA	2	10	123656	123665	20 %	40 %	40 %	0 %	169830331
78	NC_010424	GCGAA	2	10	131712	131721	40 %	0 %	40 %	20 %	169830339
79	NC_010424	ACCCA	2	10	133408	133417	40 %	0 %	0 %	60 %	169830340
80	NC_010424	GAACA	2	10	134481	134490	60 %	0 %	20 %	20 %	169830341
81	NC_010424	ACCTG	2	10	135381	135390	20 %	20 %	20 %	40 %	169830343
82	NC_010424	CCGGA	2	10	135864	135873	20 %	0 %	40 %	40 %	169830343
83	NC_010424	CTGGT	2	10	135961	135970	0 %	40 %	40 %	20 %	169830343
84	NC_010424	CGGAC	2	10	137705	137714	20 %	0 %	40 %	40 %	169830345
85	NC_010424	AGAAA	2	10	140494	140503	80 %	0 %	20 %	0 %	169830348
86	NC_010424	GGGCC	2	10	140872	140881	0 %	0 %	60 %	40 %	169830348
87	NC_010424	TTGAT	2	10	141474	141483	20 %	60 %	20 %	0 %	169830349
88	NC_010424	TTTCC	2	10	148743	148752	0 %	60 %	0 %	40 %	169830350
89	NC_010424	TCGCG	2	10	149017	149026	0 %	20 %	40 %	40 %	169830351
90	NC_010424	GCCGG	2	10	150809	150818	0 %	0 %	60 %	40 %	169830353
91	NC_010424	GGCGG	2	10	150893	150902	0 %	0 %	80 %	20 %	169830353
92	NC_010424	AAAGG	2	10	152347	152356	60 %	0 %	40 %	0 %	169830354
93	NC_010424	GGTGA	2	10	154127	154136	20 %	20 %	60 %	0 %	169830356
94	NC_010424	GCGCC	2	10	156913	156922	0 %	0 %	40 %	60 %	169830356
95	NC_010424	GCCCG	2	10	158958	158967	0 %	0 %	40 %	60 %	169830357
96	NC_010424	AGAAA	2	10	159021	159030	80 %	0 %	20 %	0 %	169830357
97	NC_010424	GACCG	2	10	159462	159471	20 %	0 %	40 %	40 %	169830358
98	NC_010424	CCGGG	2	10	160529	160538	0 %	0 %	60 %	40 %	169830358
99	NC_010424	CGCCC	2	10	160634	160643	0 %	0 %	20 %	80 %	169830358
100	NC_010424	CGGCA	2	10	163012	163021	20 %	0 %	40 %	40 %	169830360
101	NC_010424	GCGGA	2	10	165892	165901	20 %	0 %	60 %	20 %	169830364
102	NC_010424	CCGGG	2	10	168016	168025	0 %	0 %	60 %	40 %	169830365
103	NC_010424	GGCCG	2	10	169778	169787	0 %	0 %	60 %	40 %	169830367
104	NC_010424	GGCCG	2	10	170064	170073	0 %	0 %	60 %	40 %	169830367
105	NC_010424	GCCGA	2	10	170308	170317	20 %	0 %	40 %	40 %	169830367
106	NC_010424	GCCGC	2	10	173846	173855	0 %	0 %	40 %	60 %	169830370
107	NC_010424	GCCGG	2	10	181449	181458	0 %	0 %	60 %	40 %	169830373
108	NC_010424	CTTCT	2	10	181972	181981	0 %	60 %	0 %	40 %	169830373
109	NC_010424	CGCTG	2	10	183356	183365	0 %	20 %	40 %	40 %	169830374
110	NC_010424	GTTTT	2	10	183385	183394	0 %	80 %	20 %	0 %	169830374
111	NC_010424	CGGCG	2	10	186372	186381	0 %	0 %	60 %	40 %	169830376
112	NC_010424	TACCG	2	10	187935	187944	20 %	20 %	20 %	40 %	169830377
113	NC_010424	CCGGA	2	10	188529	188538	20 %	0 %	40 %	40 %	169830378
114	NC_010424	GCGCG	2	10	192350	192359	0 %	0 %	60 %	40 %	169830382
115	NC_010424	GCCGG	2	10	193283	193292	0 %	0 %	60 %	40 %	169830382
116	NC_010424	TGGAC	2	10	193842	193851	20 %	20 %	40 %	20 %	169830383
117	NC_010424	GGGGT	2	10	194834	194843	0 %	20 %	80 %	0 %	169830384
118	NC_010424	GCATG	2	10	197666	197675	20 %	20 %	40 %	20 %	169830386
119	NC_010424	CCGGC	2	10	199024	199033	0 %	0 %	40 %	60 %	169830387
120	NC_010424	GCTGC	2	10	200935	200944	0 %	20 %	40 %	40 %	169830389
121	NC_010424	CGGCG	2	10	204236	204245	0 %	0 %	60 %	40 %	169830392
122	NC_010424	GGCCG	2	10	204517	204526	0 %	0 %	60 %	40 %	169830392
123	NC_010424	GAAGA	2	10	206216	206225	60 %	0 %	40 %	0 %	169830394
124	NC_010424	GAGAA	2	10	212077	212086	60 %	0 %	40 %	0 %	169830398
125	NC_010424	GAAGC	2	10	212775	212784	40 %	0 %	40 %	20 %	169830399
126	NC_010424	CGGTT	2	10	213625	213634	0 %	40 %	40 %	20 %	169830400
127	NC_010424	GCGCC	2	10	214411	214420	0 %	0 %	40 %	60 %	169830400
128	NC_010424	TGACC	2	10	216419	216428	20 %	20 %	20 %	40 %	169830402
129	NC_010424	GGCCG	2	10	217702	217711	0 %	0 %	60 %	40 %	169830403
130	NC_010424	AACTG	2	10	217743	217752	40 %	20 %	20 %	20 %	169830403
131	NC_010424	TGGAA	2	10	219742	219751	40 %	20 %	40 %	0 %	169830406
132	NC_010424	AAATG	2	10	225634	225643	60 %	20 %	20 %	0 %	169830409
133	NC_010424	CGACC	2	10	229171	229180	20 %	0 %	20 %	60 %	169830411
134	NC_010424	GTACC	2	10	229834	229843	20 %	20 %	20 %	40 %	169830411
135	NC_010424	GGCCG	2	10	239174	239183	0 %	0 %	60 %	40 %	169830421
136	NC_010424	GCGCG	2	10	240009	240018	0 %	0 %	60 %	40 %	169830423
137	NC_010424	CCGGC	2	10	243043	243052	0 %	0 %	40 %	60 %	169830426
138	NC_010424	GGGCC	2	10	244748	244757	0 %	0 %	60 %	40 %	169830427
139	NC_010424	GACCA	2	10	244977	244986	40 %	0 %	20 %	40 %	169830427
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142	NC_010424	CGGAA	2	10	249243	249252	40 %	0 %	40 %	20 %	169830428
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148	NC_010424	GGCCG	2	10	257897	257906	0 %	0 %	60 %	40 %	169830436
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156	NC_010424	ACGGC	2	10	267036	267045	20 %	0 %	40 %	40 %	169830456
157	NC_010424	CGGTG	2	10	268280	268289	0 %	20 %	60 %	20 %	169830457
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159	NC_010424	CCGGG	2	10	268818	268827	0 %	0 %	60 %	40 %	169830458
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166	NC_010424	CTGCC	2	10	280772	280781	0 %	20 %	20 %	60 %	169830472
167	NC_010424	CGCGG	2	10	281425	281434	0 %	0 %	60 %	40 %	169830473
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234	NC_010424	GGGAG	2	10	387458	387467	20 %	0 %	80 %	0 %	169830567
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246	NC_010424	CGTGG	2	10	414730	414739	0 %	20 %	60 %	20 %	169830587
247	NC_010424	CGGTG	2	10	414760	414769	0 %	20 %	60 %	20 %	169830587
248	NC_010424	CCGGG	2	10	416544	416553	0 %	0 %	60 %	40 %	169830588
249	NC_010424	TCCGT	2	10	420021	420030	0 %	40 %	20 %	40 %	169830592
250	NC_010424	CGGGC	2	10	420175	420184	0 %	0 %	60 %	40 %	169830592
251	NC_010424	CCGTT	2	10	422569	422578	0 %	40 %	20 %	40 %	169830595
252	NC_010424	CGACC	2	10	423291	423300	20 %	0 %	20 %	60 %	169830595
253	NC_010424	AAAAG	2	10	423519	423528	80 %	0 %	20 %	0 %	169830595
254	NC_010424	GCAGG	2	10	429345	429354	20 %	0 %	60 %	20 %	169830597
255	NC_010424	CCGGC	2	10	442775	442784	0 %	0 %	40 %	60 %	169830600
256	NC_010424	CGCAG	2	10	445466	445475	20 %	0 %	40 %	40 %	169830601
257	NC_010424	GAACC	2	10	446143	446152	40 %	0 %	20 %	40 %	169830602
258	NC_010424	AACGC	2	10	449202	449211	40 %	0 %	20 %	40 %	169830604
259	NC_010424	TTTTG	2	10	450189	450198	0 %	80 %	20 %	0 %	169830606
260	NC_010424	CCTGG	2	10	451026	451035	0 %	20 %	40 %	40 %	169830607
261	NC_010424	GGGCG	2	10	451449	451458	0 %	0 %	80 %	20 %	169830607
262	NC_010424	GTCTA	2	10	452465	452474	20 %	40 %	20 %	20 %	169830608
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264	NC_010424	GGGGC	2	10	459077	459086	0 %	0 %	80 %	20 %	169830615
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