MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010418	TTTA	2	8	117	124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010418	ATTA	2	8	125	132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010418	TTAT	2	8	2595	2602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010418	TTGT	2	8	4677	4684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010418	TATT	2	8	12534	12541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010418	AAAG	2	8	13149	13156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010418	TTAC	2	8	18262	18269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010418	GTCA	2	8	21149	21156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010418	ATTA	2	8	24014	24021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010418	TAAT	2	8	24860	24867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010418	ATTA	2	8	25019	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010418	TAAT	2	8	27222	27229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010418	TTAC	2	8	27382	27389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010418	TTTA	2	8	27410	27417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010418	TAAT	2	8	27986	27993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010418	TTTA	2	8	28023	28030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010418	ATTC	2	8	29058	29065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010418	TCCC	2	8	29402	29409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_010418	ATTA	3	12	32684	32695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010418	TAAT	2	8	34149	34156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010418	ATTT	2	8	35782	35789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010418	ATTA	2	8	37151	37158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010418	TAAT	2	8	39306	39313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010418	ATTT	2	8	40253	40260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010418	TTAC	2	8	40265	40272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010418	CTTC	2	8	41646	41653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010418	ATTA	2	8	41692	41699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010418	TTAT	2	8	41988	41995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010418	TCTA	2	8	44888	44895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010418	AATA	2	8	45020	45027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010418	TAAT	2	8	47518	47525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010418	ATCT	2	8	47649	47656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010418	TAAT	2	8	48975	48982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010418	AAAT	2	8	49191	49198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010418	GATT	2	8	49260	49267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010418	TAAA	2	8	49420	49427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010418	AGTT	2	8	50763	50770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010418	AAAG	2	8	50842	50849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010418	ATTA	2	8	56171	56178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010418	TTAA	2	8	56325	56332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010418	TCTT	2	8	56678	56685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010418	ATTG	2	8	56923	56930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010418	TAAT	2	8	62559	62566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010418	TCTT	2	8	66911	66918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010418	TTTG	2	8	66953	66960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010418	TTAT	2	8	68467	68474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010418	TAAT	2	8	68905	68912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010418	CTTA	2	8	70984	70991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010418	TATT	2	8	72490	72497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010418	AAAT	2	8	72597	72604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010418	CATT	2	8	72632	72639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010418	ATTA	2	8	74205	74212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010418	TATC	2	8	74261	74268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010418	AATG	2	8	74324	74331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010418	CATT	2	8	74354	74361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010418	CTTT	2	8	75737	75744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010418	TAAT	2	8	76339	76346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010418	TACA	2	8	76494	76501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010418	CTTC	2	8	80397	80404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010418	TTAT	2	8	82399	82406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010418	CAAA	2	8	82600	82607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010418	TCAT	2	8	83191	83198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010418	ATTT	2	8	83393	83400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010418	TACC	2	8	86055	86062	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010418	ATTT	2	8	86560	86567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010418	AGTT	2	8	88453	88460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010418	ATTT	2	8	88509	88516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010418	ATCC	2	8	89070	89077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010418	TATT	2	8	90043	90050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010418	AATA	3	12	90113	90124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010418	TTAG	2	8	92163	92170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010418	TTCT	2	8	92271	92278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010418	ATTA	2	8	92367	92374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010418	TTAC	2	8	99756	99763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010418	TAAT	2	8	103699	103706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010418	AATT	2	8	103720	103727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010418	TAAT	2	8	103761	103768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010418	TTAA	2	8	104931	104938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010418	ATTT	2	8	104954	104961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010418	TATT	2	8	104988	104995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010418	ATTT	2	8	105093	105100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010418	TAAA	2	8	105112	105119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010418	TAAT	2	8	108051	108058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010418	TACA	2	8	108107	108114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010418	TTTA	2	8	108271	108278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010418	ATTA	2	8	111223	111230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010418	TCTA	2	8	112107	112114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010418	AAAT	2	8	115155	115162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010418	ATTA	2	8	115270	115277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010418	AATT	2	8	115754	115761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010418	TTTA	2	8	115910	115917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010418	GGAT	2	8	115973	115980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010418	TAAA	2	8	116007	116014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010418	TACA	2	8	116034	116041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010418	TAGT	2	8	118176	118183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010418	TAAA	2	8	118249	118256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010418	TAAT	2	8	118336	118343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010418	TATT	2	8	120033	120040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010418	AATT	2	8	122337	122344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010418	TAAT	2	8	122468	122475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010418	AAAG	2	8	122488	122495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010418	ATAA	2	8	122585	122592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010418	ATTC	2	8	122633	122640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010418	TGTT	2	8	122652	122659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010418	CATA	2	8	124062	124069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010418	GGTT	2	8	129650	129657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010418	TAAT	2	8	129916	129923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010418	TTTA	2	8	130164	130171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010418	AATT	2	8	130642	130649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010418	TAAA	2	8	132288	132295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010418	TAAT	2	8	132659	132666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010418	ATGT	2	8	132881	132888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010418	TTTA	2	8	134474	134481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010418	TAAA	2	8	134490	134497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010418	CTAT	2	8	136099	136106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010418	AATT	2	8	140210	140217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010418	CTTT	2	8	140228	140235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010418	ACTT	2	8	141956	141963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010418	TAAT	2	8	142194	142201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010418	TAAT	2	8	142385	142392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010418	TAAT	2	8	144397	144404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010418	GGTA	2	8	144438	144445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010418	TTAA	2	8	144918	144925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010418	TTAT	2	8	144979	144986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010418	ATTT	2	8	146047	146054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010418	TTAA	2	8	146778	146785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010418	TCAT	2	8	148058	148065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010418	TAGT	2	8	148303	148310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010418	TATT	2	8	148314	148321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010418	TATT	2	8	148800	148807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010418	ATTA	2	8	149220	149227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010418	AAGA	2	8	149355	149362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010418	CTTT	2	8	149385	149392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010418	TAAT	2	8	150681	150688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010418	TCCA	2	8	150805	150812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010418	TAAA	2	8	155225	155232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010418	ATTA	2	8	155411	155418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010418	ATTT	2	8	155465	155472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010418	ATTT	2	8	157037	157044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010418	ATTA	2	8	157349	157356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010418	TAAT	2	8	158628	158635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010418	ATTC	2	8	160196	160203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010418	TCAT	2	8	161082	161089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010418	CCTT	2	8	161520	161527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010418	CAAA	2	8	161571	161578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010418	ATTT	2	8	161646	161653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010418	CCTT	2	8	161681	161688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010418	CTTT	2	8	162941	162948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010418	CTTC	2	8	163401	163408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010418	ATTT	2	8	163444	163451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010418	CTTT	2	8	163843	163850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010418	TAAT	2	8	163947	163954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010418	ATTT	2	8	164136	164143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010418	TTTA	2	8	164216	164223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.