MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 4449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010418	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010418	CTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010418	ATC	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
4	NC_010418	TCT	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
5	NC_010418	ATA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
6	NC_010418	TAC	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
7	NC_010418	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
8	NC_010418	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
9	NC_010418	TAT	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
10	NC_010418	TAA	2	6	600	605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
11	NC_010418	AGA	2	6	618	623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834813
12	NC_010418	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
13	NC_010418	AGC	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834813
14	NC_010418	ATT	2	6	783	788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
15	NC_010418	TAA	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
16	NC_010418	TTA	2	6	952	957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
17	NC_010418	ATA	2	6	985	990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
18	NC_010418	AAT	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
19	NC_010418	TAG	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834813
20	NC_010418	TCA	4	12	1075	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
21	NC_010418	CTA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
22	NC_010418	TTC	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
23	NC_010418	TTA	2	6	1280	1285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
24	NC_010418	TAC	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
25	NC_010418	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
26	NC_010418	TAT	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
27	NC_010418	CAT	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
28	NC_010418	TAT	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
29	NC_010418	AAT	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
30	NC_010418	ACC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834813
31	NC_010418	ATA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
32	NC_010418	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
33	NC_010418	CTT	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
34	NC_010418	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
35	NC_010418	CAC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834813
36	NC_010418	TAT	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
37	NC_010418	AGT	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834813
38	NC_010418	TCA	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
39	NC_010418	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
40	NC_010418	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
41	NC_010418	TAT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
42	NC_010418	CTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010418	TAT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
44	NC_010418	ATT	2	6	2763	2768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
45	NC_010418	TTC	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
46	NC_010418	TTA	2	6	2845	2850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
47	NC_010418	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834949
48	NC_010418	CAT	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
49	NC_010418	CTT	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
50	NC_010418	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
51	NC_010418	TAG	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834949
52	NC_010418	ATT	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
53	NC_010418	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
54	NC_010418	TTC	2	6	3114	3119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
55	NC_010418	TTA	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
56	NC_010418	TAT	2	6	3383	3388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
57	NC_010418	CTT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
58	NC_010418	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
59	NC_010418	AGA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834949
60	NC_010418	TTC	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
61	NC_010418	TTA	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
62	NC_010418	CAG	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834949
63	NC_010418	AAG	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834949
64	NC_010418	CTT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
65	NC_010418	CTA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
66	NC_010418	TCT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
67	NC_010418	TAT	2	6	4044	4049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
68	NC_010418	TTA	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
69	NC_010418	TAA	2	6	4274	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834949
70	NC_010418	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
71	NC_010418	GTC	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834949
72	NC_010418	GTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834949
73	NC_010418	TTG	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834949
74	NC_010418	TTC	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
75	NC_010418	ATC	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
76	NC_010418	CCT	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010418	TTA	2	6	4763	4768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834994
78	NC_010418	TAT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834994
79	NC_010418	ATA	3	9	4824	4832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834994
80	NC_010418	TAA	2	6	4849	4854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834994
81	NC_010418	AGA	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834994
82	NC_010418	TCT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834994
83	NC_010418	ATA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834994
84	NC_010418	AAT	2	6	5012	5017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834994
85	NC_010418	ATT	3	9	5029	5037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834994
86	NC_010418	CAT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010418	ATT	3	9	5223	5231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834845
88	NC_010418	TAT	2	6	5356	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834845
89	NC_010418	TAA	2	6	5404	5409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834845
90	NC_010418	TTA	2	6	5427	5432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834845
91	NC_010418	TCA	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834845
92	NC_010418	TAC	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834845
93	NC_010418	TTA	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834845
94	NC_010418	TCT	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834845
95	NC_010418	TAA	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834845
96	NC_010418	TAT	2	6	5819	5824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010418	AAT	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010418	TAA	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010418	TTA	2	6	5990	5995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
100	NC_010418	ATT	2	6	6031	6036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
101	NC_010418	AGA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834839
102	NC_010418	AGA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834839
103	NC_010418	ATT	2	6	6171	6176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
104	NC_010418	TAA	2	6	6237	6242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
105	NC_010418	ATA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
106	NC_010418	GAA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834839
107	NC_010418	TAA	2	6	6483	6488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
108	NC_010418	ATT	2	6	6598	6603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
109	NC_010418	CAT	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834839
110	NC_010418	ATT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
111	NC_010418	ATG	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834839
112	NC_010418	TAT	2	6	6779	6784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
113	NC_010418	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
114	NC_010418	ATA	2	6	6950	6955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
115	NC_010418	TAT	2	6	6967	6972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
116	NC_010418	TTA	2	6	6982	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834839
117	NC_010418	AAT	2	6	7014	7019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834839
118	NC_010418	TTA	2	6	7061	7066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010418	TCT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835029
120	NC_010418	ATA	2	6	7195	7200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835029
121	NC_010418	TTA	2	6	7210	7215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835029
122	NC_010418	ATA	2	6	7297	7302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835029
123	NC_010418	CAT	3	9	7327	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835029
124	NC_010418	CAT	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835029
125	NC_010418	TTG	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169835029
126	NC_010418	TAT	2	6	7450	7455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835029
127	NC_010418	TCC	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169835029
128	NC_010418	TGA	2	6	7509	7514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169835029
129	NC_010418	TAT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835029
130	NC_010418	CTT	2	6	7710	7715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835029
131	NC_010418	TAC	2	6	7751	7756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835029
132	NC_010418	CTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835029
133	NC_010418	TAT	2	6	7792	7797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835029
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264	NC_010418	TAA	2	6	13972	13977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834933
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266	NC_010418	TCT	2	6	14081	14086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834933
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393	NC_010418	TCT	2	6	22153	22158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
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500	NC_010418	CAT	2	6	27334	27339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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