MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010408	CCGCA	2	10	153	162	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_010408	GCACC	2	10	364	373	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_010408	CCACG	2	10	377	386	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_010408	CCGCG	2	10	450	459	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_010408	CCCGC	2	10	973	982	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_010408	GCGCG	2	10	996	1005	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010408	CGTCG	2	10	1126	1135	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010408	GCACC	2	10	1290	1299	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_010408	CCCGC	2	10	2207	2216	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_010408	CCGCA	2	10	3109	3118	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010408	CGCGC	2	10	13491	13500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010408	GGCGA	2	10	13891	13900	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010408	AGGCG	2	10	14877	14886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010408	GTTCA	2	10	42927	42936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010408	CGCAG	2	10	44032	44041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010408	CGCGA	2	10	46088	46097	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010408	GACGG	2	10	83354	83363	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010408	GCGGT	2	10	90192	90201	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010408	GTGCG	2	10	91674	91683	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010408	GCGGG	2	10	92577	92586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010408	GGTGC	2	10	93493	93502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010408	CGCGA	2	10	93655	93664	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010408	GCGGG	2	10	93810	93819	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010408	CGTGG	2	10	94406	94415	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010408	GGTGC	2	10	94419	94428	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010408	TGCGG	2	10	94630	94639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.