MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 1737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010408	CCA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010408	ACG	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010408	AGC	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010408	ACG	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010408	CGA	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010408	ACC	2	6	232	237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010408	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010408	ACG	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010408	ACG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010408	AGC	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010408	CGG	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010408	CGG	2	6	444	449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010408	CAC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010408	CAC	2	6	544	549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010408	ACG	2	6	608	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010408	AGC	2	6	687	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010408	CGG	2	6	702	707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010408	ACG	3	9	721	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010408	CGA	2	6	761	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010408	CGA	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010408	CCA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010408	GAG	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010408	AGC	2	6	986	991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010408	ACG	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010408	CGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010408	GCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010408	ACG	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010408	ACG	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010408	ACC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010408	ACG	2	6	1368	1373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010408	ACC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010408	CGA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010408	ACC	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010408	CGC	2	6	1517	1522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010408	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010408	CGC	2	6	1651	1656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010408	CCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010408	GCA	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010408	AGC	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010408	ACG	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010408	GCA	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010408	ACG	2	6	1910	1915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010408	CGG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010408	CGG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010408	GGC	2	6	1985	1990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010408	TCG	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010408	ACG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010408	CGG	2	6	2034	2039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010408	CCG	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010408	CCT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010408	TCA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010408	AGC	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010408	ACG	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010408	GCA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010408	ACG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010408	CGG	2	6	2297	2302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010408	CGA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010408	CGG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010408	TCG	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010408	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010408	CGG	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010408	AGC	2	6	2469	2474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010408	GCC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010408	ACC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010408	ACC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010408	CGC	2	6	2701	2706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010408	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010408	GCC	2	6	2821	2826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010408	ACC	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010408	TCG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010408	CGA	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010408	GAC	3	9	3012	3020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010408	CAC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010408	GAC	3	9	3264	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010408	GAC	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010408	CGC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010408	CAC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010408	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010408	CAC	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010408	TCC	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010408	CGA	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010408	CGC	2	6	3561	3566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010408	CGC	2	6	3720	3725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
84	NC_010408	GCG	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016699
85	NC_010408	CGC	2	6	3771	3776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
86	NC_010408	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016699
87	NC_010408	ACG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016699
88	NC_010408	GCC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
89	NC_010408	CGA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010408	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010408	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
92	NC_010408	CGG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016700
93	NC_010408	CCA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016700
94	NC_010408	TCC	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016700
95	NC_010408	CGC	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
96	NC_010408	GAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016700
97	NC_010408	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
98	NC_010408	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
99	NC_010408	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016701
100	NC_010408	TCC	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016701
101	NC_010408	CGC	2	6	4520	4525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016701
102	NC_010408	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016701
103	NC_010408	GGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010408	GCG	2	6	4624	4629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010408	CCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010408	TGG	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010408	CGA	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016702
108	NC_010408	CAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189016702
109	NC_010408	CGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016702
110	NC_010408	ACT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016702
111	NC_010408	CAT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016702
112	NC_010408	CCG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016702
113	NC_010408	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010408	GCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016703
115	NC_010408	TGC	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016703
116	NC_010408	CAG	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016703
117	NC_010408	GAT	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016703
118	NC_010408	CGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016703
119	NC_010408	TCA	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016703
120	NC_010408	CTT	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016703
121	NC_010408	CCT	2	6	5823	5828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016703
122	NC_010408	CGG	2	6	5891	5896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016703
123	NC_010408	ATG	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016703
124	NC_010408	CCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016703
125	NC_010408	GGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016703
126	NC_010408	GAG	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016703
127	NC_010408	CGG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010408	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010408	CCG	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010408	CCA	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010408	ACT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010408	CGA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
133	NC_010408	CGT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
134	NC_010408	GTC	2	6	6632	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
135	NC_010408	ACC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016704
136	NC_010408	CGT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
137	NC_010408	GGA	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016704
138	NC_010408	GAC	2	6	6845	6850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
139	NC_010408	GAT	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016704
140	NC_010408	GCC	2	6	7031	7036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016704
141	NC_010408	TGC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
142	NC_010408	GCA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
143	NC_010408	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016704
144	NC_010408	GTC	2	6	7256	7261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
145	NC_010408	GGT	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016704
146	NC_010408	GCT	2	6	7525	7530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
147	NC_010408	GCC	2	6	7531	7536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016704
148	NC_010408	CGG	2	6	7555	7560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010408	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_010408	GCG	2	6	7598	7603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010408	TGC	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016705
152	NC_010408	CAG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016705
153	NC_010408	TCG	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016705
154	NC_010408	GCA	2	6	7984	7989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016705
155	NC_010408	AGT	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016706
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157	NC_010408	GAC	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016706
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160	NC_010408	CGC	2	6	8380	8385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016706
161	NC_010408	TCG	2	6	8386	8391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016706
162	NC_010408	GAG	2	6	8491	8496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016706
163	NC_010408	AAC	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189016706
164	NC_010408	TCG	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_010408	CGG	2	6	8581	8586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
166	NC_010408	CGC	2	6	8591	8596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
167	NC_010408	CCG	2	6	8631	8636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
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169	NC_010408	GGC	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
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172	NC_010408	CGG	2	6	8782	8787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
173	NC_010408	GGC	2	6	8798	8803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
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180	NC_010408	CGG	2	6	9412	9417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
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265	NC_010408	CAG	2	6	14367	14372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_010408	CGG	2	6	14384	14389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_010408	GAG	2	6	14472	14477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_010408	GGC	2	6	14487	14492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_010408	TCG	2	6	14571	14576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_010408	CTC	2	6	14587	14592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_010408	CCT	2	6	14621	14626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_010408	CGG	2	6	14681	14686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_010408	CGG	2	6	14735	14740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_010408	CGG	2	6	15011	15016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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394	NC_010408	CAG	2	6	21645	21650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016721
395	NC_010408	TGA	2	6	21695	21700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016721
396	NC_010408	GGC	2	6	21771	21776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016721
397	NC_010408	CCA	2	6	21794	21799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016721
398	NC_010408	TCA	2	6	21900	21905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_010408	ATC	2	6	21975	21980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016722
400	NC_010408	GCG	2	6	22005	22010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016722
401	NC_010408	GCG	2	6	22136	22141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016722
402	NC_010408	ATC	2	6	22143	22148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016722
403	NC_010408	ACC	2	6	22192	22197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016722
404	NC_010408	TCC	2	6	22228	22233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016722
405	NC_010408	CTC	2	6	22319	22324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016722
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411	NC_010408	TTC	2	6	22554	22559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016722
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433	NC_010408	GGT	2	6	23788	23793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_010408	CCG	2	6	24332	24337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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