MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010408	CCA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010408	ACG	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010408	AGC	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010408	ACG	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010408	CGA	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010408	ACC	2	6	232	237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010408	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010408	ACG	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010408	ACG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010408	AGC	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010408	CGG	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010408	CGG	2	6	444	449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010408	CAC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010408	CAC	2	6	544	549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010408	ACG	2	6	608	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010408	AGC	2	6	687	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010408	CGG	2	6	702	707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010408	ACG	3	9	721	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010408	CGA	2	6	761	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010408	CGA	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010408	CCA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010408	GAG	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010408	AGC	2	6	986	991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010408	ACG	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010408	CGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010408	GCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010408	ACG	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010408	ACG	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010408	ACC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010408	ACG	2	6	1368	1373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010408	ACC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010408	CGA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010408	ACC	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010408	CGC	2	6	1517	1522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010408	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010408	CGC	2	6	1651	1656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010408	CCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010408	GCA	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010408	AGC	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010408	ACG	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010408	GCA	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010408	ACG	2	6	1910	1915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010408	CGG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010408	CGG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010408	GGC	2	6	1985	1990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010408	TCG	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010408	ACG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010408	CGG	2	6	2034	2039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010408	CCG	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010408	CCT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010408	TCA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010408	AGC	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010408	ACG	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010408	GCA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010408	ACG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010408	CGG	2	6	2297	2302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010408	CGA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010408	CGG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010408	TCG	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010408	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010408	CGG	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010408	AGC	2	6	2469	2474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010408	GCC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010408	ACC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010408	ACC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010408	CGC	2	6	2701	2706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010408	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010408	GCC	2	6	2821	2826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010408	ACC	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010408	TCG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010408	CGA	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010408	GAC	3	9	3012	3020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010408	CAC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010408	GAC	3	9	3264	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010408	GAC	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010408	CGC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010408	CAC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010408	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010408	CAC	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010408	TCC	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010408	CGA	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010408	CGC	2	6	3561	3566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010408	CGA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010408	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010408	GGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010408	GCG	2	6	4624	4629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010408	CCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010408	TGG	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010408	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010408	CGG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010408	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010408	CCG	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010408	CCA	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010408	ACT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010408	CGG	2	6	7555	7560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010408	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010408	GCG	2	6	7598	7603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010408	TCG	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010408	CCG	2	6	9812	9817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010408	CGT	2	6	9861	9866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010408	CGA	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010408	GCC	2	6	11857	11862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_010408	CTC	2	6	11967	11972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010408	GGA	2	6	12051	12056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010408	GTC	2	6	12082	12087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010408	GCA	2	6	12111	12116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010408	CGA	2	6	12196	12201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010408	GCA	2	6	12219	12224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010408	TGG	2	6	12249	12254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010408	CTC	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010408	TCG	2	6	12371	12376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010408	GAA	2	6	12427	12432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010408	CGC	2	6	12454	12459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010408	CCG	2	6	12461	12466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010408	CCA	2	6	12537	12542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010408	ACC	2	6	12635	12640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010408	TCG	2	6	12679	12684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010408	AGC	2	6	12691	12696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010408	TGC	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010408	TCG	3	9	12745	12753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010408	TCG	2	6	12766	12771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010408	GTG	2	6	12813	12818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010408	CGC	3	9	12845	12853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010408	CAC	2	6	12879	12884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010408	CCT	2	6	12950	12955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010408	AGG	2	6	13030	13035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010408	CGA	2	6	13097	13102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010408	GGT	2	6	13125	13130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010408	GCA	2	6	13169	13174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010408	GAC	2	6	13188	13193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010408	CCG	2	6	13237	13242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010408	AGC	2	6	13276	13281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010408	AGG	2	6	13363	13368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010408	CCG	2	6	13438	13443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010408	GAC	2	6	13446	13451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010408	GCC	2	6	13501	13506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010408	GCC	2	6	13537	13542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010408	TCC	2	6	13666	13671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010408	GTG	2	6	13683	13688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010408	CTC	2	6	13770	13775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010408	CGA	2	6	13793	13798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010408	CCT	2	6	13808	13813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_010408	CGC	2	6	13961	13966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.