MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 1390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010408	CGC	2	6	3720	3725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
2	NC_010408	GCG	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016699
3	NC_010408	CGC	2	6	3771	3776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
4	NC_010408	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016699
5	NC_010408	ACG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016699
6	NC_010408	GCC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016699
7	NC_010408	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
8	NC_010408	CGG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016700
9	NC_010408	CCA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016700
10	NC_010408	TCC	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016700
11	NC_010408	CGC	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
12	NC_010408	GAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016700
13	NC_010408	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
14	NC_010408	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016700
15	NC_010408	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016701
16	NC_010408	TCC	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016701
17	NC_010408	CGC	2	6	4520	4525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016701
18	NC_010408	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016701
19	NC_010408	CGA	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016702
20	NC_010408	CAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189016702
21	NC_010408	CGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016702
22	NC_010408	ACT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016702
23	NC_010408	CAT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016702
24	NC_010408	CCG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016702
25	NC_010408	GCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016703
26	NC_010408	TGC	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016703
27	NC_010408	CAG	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016703
28	NC_010408	GAT	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016703
29	NC_010408	CGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016703
30	NC_010408	TCA	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016703
31	NC_010408	CTT	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016703
32	NC_010408	CCT	2	6	5823	5828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016703
33	NC_010408	CGG	2	6	5891	5896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016703
34	NC_010408	ATG	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016703
35	NC_010408	CCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016703
36	NC_010408	GGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016703
37	NC_010408	GAG	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016703
38	NC_010408	CGA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
39	NC_010408	CGT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
40	NC_010408	GTC	2	6	6632	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
41	NC_010408	ACC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016704
42	NC_010408	CGT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
43	NC_010408	GGA	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016704
44	NC_010408	GAC	2	6	6845	6850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
45	NC_010408	GAT	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016704
46	NC_010408	GCC	2	6	7031	7036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016704
47	NC_010408	TGC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
48	NC_010408	GCA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016704
49	NC_010408	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016704
50	NC_010408	GTC	2	6	7256	7261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
51	NC_010408	GGT	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016704
52	NC_010408	GCT	2	6	7525	7530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016704
53	NC_010408	GCC	2	6	7531	7536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016704
54	NC_010408	TGC	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016705
55	NC_010408	CAG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016705
56	NC_010408	TCG	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016705
57	NC_010408	GCA	2	6	7984	7989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016705
58	NC_010408	AGT	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016706
59	NC_010408	CAC	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016706
60	NC_010408	GAC	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016706
61	NC_010408	CGA	2	6	8286	8291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016706
62	NC_010408	CGC	2	6	8341	8346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016706
63	NC_010408	CGC	2	6	8380	8385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016706
64	NC_010408	TCG	2	6	8386	8391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016706
65	NC_010408	GAG	2	6	8491	8496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016706
66	NC_010408	AAC	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189016706
67	NC_010408	CGG	2	6	8581	8586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
68	NC_010408	CGC	2	6	8591	8596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
69	NC_010408	CCG	2	6	8631	8636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
70	NC_010408	CGT	2	6	8686	8691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016707
71	NC_010408	GGC	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
72	NC_010408	GAG	2	6	8729	8734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016707
73	NC_010408	GTG	2	6	8736	8741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016707
74	NC_010408	CGG	2	6	8782	8787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
75	NC_010408	GGC	2	6	8798	8803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
76	NC_010408	GCA	2	6	9061	9066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
77	NC_010408	AGC	2	6	9072	9077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
78	NC_010408	CAC	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016707
79	NC_010408	GAG	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016707
80	NC_010408	GAC	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
81	NC_010408	CTC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016707
82	NC_010408	CGG	2	6	9412	9417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
83	NC_010408	CCG	2	6	9447	9452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
84	NC_010408	GAC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
85	NC_010408	CGA	2	6	9505	9510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
86	NC_010408	CGC	2	6	9583	9588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016707
87	NC_010408	ACG	2	6	9607	9612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016707
88	NC_010408	GAG	2	6	9629	9634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016707
89	NC_010408	CGG	2	6	9763	9768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016707
90	NC_010408	GTC	2	6	9789	9794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016707
91	NC_010408	AAG	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016708
92	NC_010408	GGA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016708
93	NC_010408	CCA	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016708
94	NC_010408	ACG	2	6	10101	10106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016708
95	NC_010408	GAA	2	6	10170	10175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016709
96	NC_010408	CGT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016709
97	NC_010408	AGC	2	6	10198	10203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
98	NC_010408	CGA	2	6	10244	10249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
99	NC_010408	CGA	2	6	10292	10297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
100	NC_010408	GGA	2	6	10337	10342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016709
101	NC_010408	TCG	2	6	10381	10386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016709
102	NC_010408	ACG	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
103	NC_010408	CGC	3	9	10422	10430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016709
104	NC_010408	GCG	2	6	10487	10492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016709
105	NC_010408	TTC	2	6	10504	10509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016709
106	NC_010408	TGT	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016709
107	NC_010408	GGT	2	6	10758	10763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016709
108	NC_010408	TTG	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016709
109	NC_010408	CGC	2	6	10916	10921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016709
110	NC_010408	TCC	2	6	11004	11009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016709
111	NC_010408	CCG	2	6	11092	11097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016709
112	NC_010408	GAC	2	6	11109	11114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
113	NC_010408	CGT	2	6	11326	11331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016709
114	NC_010408	GGC	2	6	11379	11384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016709
115	NC_010408	GAG	2	6	11515	11520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016709
116	NC_010408	CAG	2	6	11646	11651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016709
117	NC_010408	CGC	2	6	11766	11771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016709
118	NC_010408	CGG	2	6	11834	11839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016709
119	NC_010408	AGC	2	6	15236	15241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016710
120	NC_010408	CGT	2	6	15243	15248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
121	NC_010408	GGC	2	6	15250	15255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016710
122	NC_010408	CGT	2	6	15274	15279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
123	NC_010408	GCC	2	6	15280	15285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016710
124	NC_010408	TGA	2	6	15357	15362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016710
125	NC_010408	TCG	3	9	15413	15421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
126	NC_010408	GGA	2	6	15438	15443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016710
127	NC_010408	GCT	2	6	15460	15465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
128	NC_010408	CGG	2	6	15596	15601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016710
129	NC_010408	GAC	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016710
130	NC_010408	CGA	2	6	15696	15701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016710
131	NC_010408	GCA	2	6	15792	15797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016710
132	NC_010408	GTC	2	6	15838	15843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
133	NC_010408	CGT	2	6	15909	15914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016710
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142	NC_010408	GAT	2	6	16449	16454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016711
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251	NC_010408	CGC	2	6	23362	23367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016723
252	NC_010408	GGC	2	6	23440	23445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016723
253	NC_010408	GGA	2	6	23446	23451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016723
254	NC_010408	TCG	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016723
255	NC_010408	ACG	2	6	23466	23471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016723
256	NC_010408	CGA	2	6	23575	23580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016723
257	NC_010408	GCA	2	6	23641	23646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016723
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259	NC_010408	CTC	2	6	23916	23921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016724
260	NC_010408	GAC	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016724
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262	NC_010408	CCG	2	6	24010	24015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016724
263	NC_010408	GAG	2	6	24120	24125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016724
264	NC_010408	TCA	2	6	24205	24210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016724
265	NC_010408	AGG	2	6	24402	24407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016725
266	NC_010408	AGC	2	6	24416	24421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016725
267	NC_010408	CGA	2	6	24430	24435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016725
268	NC_010408	ATC	2	6	24443	24448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016725
269	NC_010408	GCC	2	6	24449	24454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016725
270	NC_010408	CGA	3	9	24457	24465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016725
271	NC_010408	TCC	2	6	24489	24494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016725
272	NC_010408	ACC	2	6	24530	24535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016725
273	NC_010408	CGC	3	9	24589	24597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016725
274	NC_010408	GAC	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016725
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276	NC_010408	CGC	2	6	24649	24654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016725
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284	NC_010408	GGC	2	6	25115	25120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016726
285	NC_010408	ACG	2	6	25159	25164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016726
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289	NC_010408	CGA	2	6	25285	25290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016726
290	NC_010408	CGA	2	6	25400	25405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016726
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292	NC_010408	CCT	2	6	25418	25423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016726
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313	NC_010408	CGA	2	6	26454	26459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016728
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369	NC_010408	TCG	2	6	29175	29180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016733
370	NC_010408	CGA	3	9	29209	29217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016733
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372	NC_010408	GCG	2	6	29241	29246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016733
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374	NC_010408	ACC	2	6	29500	29505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016734
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497	NC_010408	GAG	2	6	35957	35962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016742
498	NC_010408	CGC	2	6	36002	36007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016742
499	NC_010408	CGA	2	6	36010	36015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016742
500	NC_010408	GGT	2	6	36043	36048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016742

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