MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010408	CA	4	8	39	46	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010408	GC	4	8	347	354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010408	CG	4	8	398	405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010408	AC	3	6	909	914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010408	GC	3	6	1159	1164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010408	AC	4	8	1625	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010408	AC	3	6	1726	1731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010408	CG	3	6	1865	1870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010408	GC	4	8	2593	2600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010408	CG	4	8	2904	2911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010408	GC	3	6	3082	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010408	CG	3	6	3206	3211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010408	AC	3	6	3254	3259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010408	GC	3	6	3393	3398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010408	CA	3	6	3457	3462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010408	CG	3	6	4832	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010408	CA	3	6	8034	8039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010408	CA	3	6	11975	11980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010408	CG	3	6	13282	13287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010408	CG	3	6	14394	14399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010408	GA	3	6	16763	16768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010408	GC	3	6	16805	16810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010408	GT	3	6	37759	37764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010408	CT	3	6	42810	42815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010408	GC	3	6	44066	44071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010408	CA	4	8	46010	46017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010408	CG	3	6	46174	46179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010408	GA	3	6	62277	62282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010408	GC	3	6	62379	62384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010408	GA	3	6	62520	62525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010408	GC	3	6	82462	82467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010408	GT	3	6	83737	83742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010408	CG	3	6	84958	84963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010408	GC	3	6	87557	87562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010408	CT	3	6	89135	89140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010408	TG	3	6	91331	91336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010408	GC	3	6	91395	91400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010408	GT	3	6	91534	91539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010408	GC	3	6	91581	91586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010408	GC	3	6	91706	91711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010408	GC	4	8	91881	91888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010408	GC	4	8	92193	92200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010408	CG	3	6	92922	92927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010408	GT	3	6	93061	93066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010408	TG	3	6	93161	93166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010408	GC	3	6	93628	93633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010408	GC	3	6	93786	93791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010408	GT	3	6	93878	93883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010408	CG	4	8	94387	94394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010408	GC	4	8	94438	94445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010408	GT	4	8	94745	94752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.