MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	TGCG	2	8	1515	1522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010407	CACC	2	8	1542	1549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010407	CCGG	2	8	17190	17197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010407	CGGA	2	8	19040	19047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010407	GCCG	2	8	19124	19131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010407	GGGC	2	8	26808	26815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010407	CCGC	2	8	26904	26911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_010407	CGCC	2	8	27014	27021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_010407	GGCC	2	8	27074	27081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010407	CCGT	2	8	27300	27307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010407	CGCC	2	8	27349	27356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_010407	CCGC	2	8	27493	27500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010407	CGGC	2	8	27701	27708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010407	CGCC	2	8	27896	27903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_010407	GCTG	2	8	28561	28568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010407	GCGG	2	8	28979	28986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010407	GCCG	2	8	32746	32753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010407	TGTC	2	8	41800	41807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010407	GTTC	2	8	41866	41873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010407	GGCA	2	8	42525	42532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010407	CCCG	2	8	47052	47059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_010407	GTCC	2	8	48055	48062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010407	ACGG	2	8	48513	48520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010407	GGCC	2	8	49694	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010407	GGGC	2	8	49889	49896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010407	CCCG	2	8	49974	49981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_010407	CGGC	2	8	49983	49990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010407	CGGG	2	8	52533	52540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010407	CCGG	2	8	53650	53657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010407	CCCG	2	8	57074	57081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010407	ACGC	2	8	57084	57091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010407	GCCC	2	8	58679	58686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_010407	GCCG	2	8	62134	62141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010407	CGGC	2	8	62172	62179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010407	CGTC	2	8	64629	64636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010407	GCCG	2	8	74999	75006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010407	CGGG	2	8	87839	87846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010407	TGGG	2	8	87886	87893	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010407	CGGC	2	8	87939	87946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010407	CGAG	2	8	88116	88123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010407	CCCG	2	8	88126	88133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010407	CGCA	2	8	90785	90792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010407	GGGC	2	8	91038	91045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010407	CACC	2	8	91090	91097	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_010407	CCCA	2	8	93891	93898	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_010407	CACC	2	8	93961	93968	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_010407	CCCT	2	8	98955	98962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_010407	CAAG	2	8	98981	98988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010407	ACCG	2	8	100606	100613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010407	CCCG	2	8	101343	101350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_010407	GGCG	2	8	101499	101506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010407	CTCG	2	8	101592	101599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010407	GACG	2	8	102237	102244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010407	CGCA	2	8	102262	102269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010407	CGAC	2	8	102593	102600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010407	GACG	2	8	102753	102760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010407	CTCG	2	8	102867	102874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010407	CGAC	2	8	102887	102894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010407	GGCC	2	8	103458	103465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010407	ACCT	2	8	103621	103628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010407	GACG	2	8	103794	103801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010407	AGGA	2	8	103945	103952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010407	CCGC	2	8	103987	103994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_010407	GTCG	2	8	104352	104359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010407	GACG	2	8	104604	104611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010407	GTCC	2	8	107042	107049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010407	CGGA	2	8	110560	110567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010407	CCCG	2	8	112622	112629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_010407	GACG	2	8	113216	113223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010407	GCGG	2	8	113335	113342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010407	CCCG	2	8	116724	116731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_010407	CCGC	2	8	128929	128936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_010407	CCGC	2	8	135528	135535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010407	GCGG	2	8	135550	135557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010407	GGGC	2	8	138517	138524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010407	CATC	2	8	139153	139160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010407	CCCG	2	8	140468	140475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_010407	ACGC	2	8	141752	141759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010407	GCGG	2	8	145307	145314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010407	TCCG	2	8	145511	145518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010407	CCGC	4	16	147280	147295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_010407	GCGG	2	8	147312	147319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010407	GCCC	2	8	152412	152419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_010407	CCGG	2	8	158872	158879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010407	GCCG	2	8	158915	158922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010407	GGCC	2	8	158931	158938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010407	AGGC	2	8	159012	159019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010407	AAGG	2	8	162809	162816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010407	TCGC	2	8	163455	163462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010407	TCCA	2	8	163526	163533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010407	GCTA	2	8	166529	166536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010407	CCCG	2	8	172967	172974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_010407	GCGG	2	8	175679	175686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010407	TGCG	2	8	178942	178949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010407	GGGC	2	8	179799	179806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010407	CGTC	2	8	182118	182125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010407	CGGC	2	8	183619	183626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010407	GGCG	2	8	187993	188000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010407	ACCC	2	8	188156	188163	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_010407	CCCG	2	8	194824	194831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_010407	TCCC	2	8	195980	195987	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_010407	GCAC	2	8	197824	197831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010407	CCGC	2	8	198650	198657	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_010407	GCCG	2	8	198770	198777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010407	GGGC	2	8	198900	198907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010407	GGGC	2	8	200427	200434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010407	GACC	2	8	200482	200489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010407	CCCG	2	8	205968	205975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_010407	CGTC	2	8	206117	206124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010407	CCGG	2	8	207289	207296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010407	CCCG	2	8	207313	207320	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_010407	CGAA	2	8	212723	212730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010407	GCCG	2	8	216355	216362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010407	CCGG	2	8	223102	223109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010407	CGGC	2	8	223162	223169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010407	CCGG	2	8	223226	223233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010407	CGGT	2	8	223287	223294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010407	CGGG	2	8	229820	229827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010407	GCTC	2	8	230016	230023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010407	CGGG	2	8	234680	234687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010407	CGGG	2	8	237177	237184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010407	GCCC	2	8	241237	241244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_010407	ACGG	2	8	241254	241261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010407	CGGC	2	8	241313	241320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010407	CGGG	2	8	246682	246689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010407	GCCG	2	8	246794	246801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010407	GGGC	2	8	250122	250129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010407	GCCG	2	8	252796	252803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010407	GGGA	2	8	252837	252844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010407	GGGC	2	8	253606	253613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010407	CGCA	2	8	259619	259626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010407	CGGC	2	8	262206	262213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010407	CGGG	2	8	263086	263093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010407	CCCG	3	12	266355	266366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_010407	CCCG	2	8	266388	266395	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_010407	ACGC	2	8	269136	269143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010407	CCGT	2	8	269149	269156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010407	CGGC	2	8	274392	274399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010407	CGGG	2	8	276176	276183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010407	CTCC	2	8	276186	276193	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_010407	GCGA	2	8	278439	278446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010407	CGAC	2	8	292567	292574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010407	CTCG	2	8	292607	292614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010407	GCTG	2	8	292759	292766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010407	CGGG	2	8	294272	294279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010407	GTCG	2	8	294311	294318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010407	CGCC	2	8	294912	294919	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_010407	CCCG	2	8	295129	295136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_010407	CCGC	2	8	295192	295199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_010407	GCGG	2	8	295897	295904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010407	GTCG	2	8	296310	296317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010407	GGAC	2	8	296779	296786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_010407	CGGG	2	8	363436	363443	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_010407	CGCC	2	8	439346	439353	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
234	NC_010407	CGTG	2	8	439379	439386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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296	NC_010407	GCAT	2	8	537737	537744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_010407	GTCA	2	8	904803	904810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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