MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 8327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	GGAC	2	8	2094	2101	25 %	0 %	50 %	25 %	170780464
2	NC_010407	ACCG	2	8	2482	2489	25 %	0 %	25 %	50 %	170780464
3	NC_010407	GTTG	2	8	3244	3251	0 %	50 %	50 %	0 %	170780465
4	NC_010407	GCGG	2	8	3334	3341	0 %	0 %	75 %	25 %	170780465
5	NC_010407	GGAT	2	8	3513	3520	25 %	25 %	50 %	0 %	170780465
6	NC_010407	TCCG	2	8	3629	3636	0 %	25 %	25 %	50 %	170780465
7	NC_010407	CCCG	2	8	3840	3847	0 %	0 %	25 %	75 %	170780465
8	NC_010407	CGGC	2	8	4399	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
9	NC_010407	CGTC	2	8	5124	5131	0 %	25 %	25 %	50 %	170780467
10	NC_010407	GCCA	2	8	6022	6029	25 %	0 %	25 %	50 %	170780467
11	NC_010407	CGGG	2	8	6497	6504	0 %	0 %	75 %	25 %	170780468
12	NC_010407	GCAC	2	8	8002	8009	25 %	0 %	25 %	50 %	170780469
13	NC_010407	ACGC	2	8	10416	10423	25 %	0 %	25 %	50 %	170780470
14	NC_010407	CAGC	2	8	10899	10906	25 %	0 %	25 %	50 %	170780470
15	NC_010407	TGCT	2	8	12976	12983	0 %	50 %	25 %	25 %	170780472
16	NC_010407	CGGC	2	8	13034	13041	0 %	0 %	50 %	50 %	170780472
17	NC_010407	GCGG	2	8	13179	13186	0 %	0 %	75 %	25 %	170780472
18	NC_010407	ACCC	2	8	13561	13568	25 %	0 %	0 %	75 %	170780473
19	NC_010407	CGAC	2	8	13586	13593	25 %	0 %	25 %	50 %	170780473
20	NC_010407	CGAC	2	8	13904	13911	25 %	0 %	25 %	50 %	170780473
21	NC_010407	GCGG	2	8	14050	14057	0 %	0 %	75 %	25 %	170780474
22	NC_010407	GCCG	2	8	14081	14088	0 %	0 %	50 %	50 %	170780474
23	NC_010407	CGCC	2	8	14744	14751	0 %	0 %	25 %	75 %	170780474
24	NC_010407	CGGC	2	8	15680	15687	0 %	0 %	50 %	50 %	170780476
25	NC_010407	CGCC	2	8	16331	16338	0 %	0 %	25 %	75 %	170780476
26	NC_010407	TGGC	2	8	16653	16660	0 %	25 %	50 %	25 %	170780478
27	NC_010407	CACG	2	8	16867	16874	25 %	0 %	25 %	50 %	170780478
28	NC_010407	CGCC	2	8	18199	18206	0 %	0 %	25 %	75 %	170780479
29	NC_010407	CCGT	2	8	18678	18685	0 %	25 %	25 %	50 %	170780479
30	NC_010407	CGAG	2	8	19173	19180	25 %	0 %	50 %	25 %	170780480
31	NC_010407	TCGT	2	8	19337	19344	0 %	50 %	25 %	25 %	170780480
32	NC_010407	CGTC	2	8	19566	19573	0 %	25 %	25 %	50 %	170780480
33	NC_010407	GGCC	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
34	NC_010407	GCGG	2	8	20277	20284	0 %	0 %	75 %	25 %	170780480
35	NC_010407	CGGC	2	8	20286	20293	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
36	NC_010407	GCTC	2	8	21374	21381	0 %	25 %	25 %	50 %	170780481
37	NC_010407	TCGA	2	8	21571	21578	25 %	25 %	25 %	25 %	170780481
38	NC_010407	CGGG	2	8	21848	21855	0 %	0 %	75 %	25 %	170780481
39	NC_010407	CGAC	2	8	22091	22098	25 %	0 %	25 %	50 %	170780481
40	NC_010407	GACG	2	8	22296	22303	25 %	0 %	50 %	25 %	170780481
41	NC_010407	CCGC	2	8	22584	22591	0 %	0 %	25 %	75 %	170780482
42	NC_010407	ACGA	2	8	22674	22681	50 %	0 %	25 %	25 %	170780482
43	NC_010407	CGAG	2	8	23930	23937	25 %	0 %	50 %	25 %	170780483
44	NC_010407	CCAG	2	8	24170	24177	25 %	0 %	25 %	50 %	170780483
45	NC_010407	CGGG	2	8	24390	24397	0 %	0 %	75 %	25 %	170780483
46	NC_010407	GCCC	2	8	25025	25032	0 %	0 %	25 %	75 %	170780483
47	NC_010407	CTCG	2	8	25345	25352	0 %	25 %	25 %	50 %	170780484
48	NC_010407	GGCG	2	8	25428	25435	0 %	0 %	75 %	25 %	170780484
49	NC_010407	CGCC	2	8	25774	25781	0 %	0 %	25 %	75 %	170780485
50	NC_010407	CGGG	2	8	25850	25857	0 %	0 %	75 %	25 %	170780485
51	NC_010407	GGCG	2	8	26042	26049	0 %	0 %	75 %	25 %	170780485
52	NC_010407	GTTG	2	8	29168	29175	0 %	50 %	50 %	0 %	170780486
53	NC_010407	GCGG	2	8	29258	29265	0 %	0 %	75 %	25 %	170780486
54	NC_010407	GGAT	2	8	29437	29444	25 %	25 %	50 %	0 %	170780486
55	NC_010407	TCCG	2	8	29553	29560	0 %	25 %	25 %	50 %	170780486
56	NC_010407	CCCG	2	8	29764	29771	0 %	0 %	25 %	75 %	170780486
57	NC_010407	CGCC	2	8	30461	30468	0 %	0 %	25 %	75 %	170780487
58	NC_010407	GTCG	2	8	32130	32137	0 %	25 %	50 %	25 %	170780489
59	NC_010407	GCCG	2	8	32207	32214	0 %	0 %	50 %	50 %	170780489
60	NC_010407	GCGG	2	8	32238	32245	0 %	0 %	75 %	25 %	170780489
61	NC_010407	GCAC	2	8	32549	32556	25 %	0 %	25 %	50 %	170780489
62	NC_010407	GGCC	2	8	35057	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
63	NC_010407	GCCG	2	8	35279	35286	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
64	NC_010407	GGCG	2	8	35393	35400	0 %	0 %	75 %	25 %	170780492
65	NC_010407	CGGC	2	8	35415	35422	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
66	NC_010407	GACG	2	8	35762	35769	25 %	0 %	50 %	25 %	170780492
67	NC_010407	GTCG	2	8	36083	36090	0 %	25 %	50 %	25 %	170780493
68	NC_010407	CGCC	2	8	36205	36212	0 %	0 %	25 %	75 %	170780493
69	NC_010407	CTCG	2	8	36431	36438	0 %	25 %	25 %	50 %	170780493
70	NC_010407	GCCG	2	8	36584	36591	0 %	0 %	50 %	50 %	170780493
71	NC_010407	GACG	2	8	36758	36765	25 %	0 %	50 %	25 %	170780493
72	NC_010407	CGTC	2	8	36919	36926	0 %	25 %	25 %	50 %	170780493
73	NC_010407	GACC	2	8	38242	38249	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
74	NC_010407	ACCG	2	8	38412	38419	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
75	NC_010407	CGGC	2	8	39655	39662	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
76	NC_010407	CCAG	2	8	39730	39737	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
77	NC_010407	CGGC	2	8	40015	40022	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
78	NC_010407	TCGA	2	8	40182	40189	25 %	25 %	25 %	25 %	170780494
79	NC_010407	TGCA	2	8	40787	40794	25 %	25 %	25 %	25 %	170780494
80	NC_010407	GTTG	2	8	42849	42856	0 %	50 %	50 %	0 %	170780498
81	NC_010407	GCGG	2	8	42939	42946	0 %	0 %	75 %	25 %	170780498
82	NC_010407	GGAT	2	8	43118	43125	25 %	25 %	50 %	0 %	170780498
83	NC_010407	TCCG	2	8	43234	43241	0 %	25 %	25 %	50 %	170780498
84	NC_010407	CCCG	2	8	43445	43452	0 %	0 %	25 %	75 %	170780498
85	NC_010407	CGGC	3	12	43877	43888	0 %	0 %	50 %	50 %	170780499
86	NC_010407	TTCC	2	8	45412	45419	0 %	50 %	0 %	50 %	170780502
87	NC_010407	TCCG	2	8	46357	46364	0 %	25 %	25 %	50 %	170780503
88	NC_010407	CGAC	2	8	46676	46683	25 %	0 %	25 %	50 %	170780503
89	NC_010407	TCGC	2	8	47541	47548	0 %	25 %	25 %	50 %	170780504
90	NC_010407	CGCC	2	8	47929	47936	0 %	0 %	25 %	75 %	170780504
91	NC_010407	CCGT	2	8	50032	50039	0 %	25 %	25 %	50 %	170780505
92	NC_010407	CGAC	2	8	50603	50610	25 %	0 %	25 %	50 %	170780505
93	NC_010407	CTCG	2	8	51246	51253	0 %	25 %	25 %	50 %	170780505
94	NC_010407	GCGG	2	8	52728	52735	0 %	0 %	75 %	25 %	170780508
95	NC_010407	CGGC	2	8	53183	53190	0 %	0 %	50 %	50 %	170780508
96	NC_010407	GGCG	2	8	53229	53236	0 %	0 %	75 %	25 %	170780508
97	NC_010407	CGGC	2	8	53868	53875	0 %	0 %	50 %	50 %	170780509
98	NC_010407	GGTG	2	8	54037	54044	0 %	25 %	75 %	0 %	170780509
99	NC_010407	GGCG	2	8	54271	54278	0 %	0 %	75 %	25 %	170780509
100	NC_010407	GCTC	2	8	55451	55458	0 %	25 %	25 %	50 %	170780510
101	NC_010407	ACGA	2	8	56853	56860	50 %	0 %	25 %	25 %	170780511
102	NC_010407	TCGT	2	8	57190	57197	0 %	50 %	25 %	25 %	170780512
103	NC_010407	CGCT	2	8	57526	57533	0 %	25 %	25 %	50 %	170780512
104	NC_010407	GGGC	2	8	58587	58594	0 %	0 %	75 %	25 %	170780512
105	NC_010407	CGGG	2	8	59207	59214	0 %	0 %	75 %	25 %	170780513
106	NC_010407	CGGC	2	8	59223	59230	0 %	0 %	50 %	50 %	170780513
107	NC_010407	GCTC	2	8	59339	59346	0 %	25 %	25 %	50 %	170780513
108	NC_010407	CGCA	2	8	59372	59379	25 %	0 %	25 %	50 %	170780513
109	NC_010407	CTGC	2	8	59811	59818	0 %	25 %	25 %	50 %	170780513
110	NC_010407	CACG	2	8	60812	60819	25 %	0 %	25 %	50 %	170780514
111	NC_010407	GACC	2	8	61595	61602	25 %	0 %	25 %	50 %	170780514
112	NC_010407	CGGC	2	8	63053	63060	0 %	0 %	50 %	50 %	170780515
113	NC_010407	TCCG	2	8	63399	63406	0 %	25 %	25 %	50 %	170780515
114	NC_010407	CGAG	2	8	63502	63509	25 %	0 %	50 %	25 %	170780515
115	NC_010407	GAGC	2	8	63791	63798	25 %	0 %	50 %	25 %	170780515
116	NC_010407	CGTG	2	8	63856	63863	0 %	25 %	50 %	25 %	170780515
117	NC_010407	CGAC	2	8	64956	64963	25 %	0 %	25 %	50 %	170780516
118	NC_010407	CCGC	2	8	65349	65356	0 %	0 %	25 %	75 %	170780516
119	NC_010407	CGGC	2	8	65358	65365	0 %	0 %	50 %	50 %	170780516
120	NC_010407	CGAC	2	8	65406	65413	25 %	0 %	25 %	50 %	170780516
121	NC_010407	TCGC	2	8	65693	65700	0 %	25 %	25 %	50 %	170780516
122	NC_010407	GGCG	2	8	65842	65849	0 %	0 %	75 %	25 %	170780516
123	NC_010407	TCGC	2	8	65927	65934	0 %	25 %	25 %	50 %	170780516
124	NC_010407	GACG	2	8	66083	66090	25 %	0 %	50 %	25 %	170780516
125	NC_010407	CCGC	2	8	66434	66441	0 %	0 %	25 %	75 %	170780517
126	NC_010407	CCGT	2	8	66485	66492	0 %	25 %	25 %	50 %	170780517
127	NC_010407	CCGG	2	8	66907	66914	0 %	0 %	50 %	50 %	170780517
128	NC_010407	CCTG	2	8	67598	67605	0 %	25 %	25 %	50 %	170780518
129	NC_010407	CCGC	4	16	68339	68354	0 %	0 %	25 %	75 %	170780519
130	NC_010407	CTCG	2	8	68513	68520	0 %	25 %	25 %	50 %	170780519
131	NC_010407	ACCG	2	8	68598	68605	25 %	0 %	25 %	50 %	170780519
132	NC_010407	ACGC	2	8	69111	69118	25 %	0 %	25 %	50 %	170780519
133	NC_010407	CGCC	2	8	69210	69217	0 %	0 %	25 %	75 %	170780520
134	NC_010407	ACGC	2	8	69479	69486	25 %	0 %	25 %	50 %	170780520
135	NC_010407	CGGG	2	8	69621	69628	0 %	0 %	75 %	25 %	170780520
136	NC_010407	CGGG	2	8	69708	69715	0 %	0 %	75 %	25 %	170780520
137	NC_010407	CGGC	2	8	70065	70072	0 %	0 %	50 %	50 %	170780520
138	NC_010407	CGGG	2	8	70301	70308	0 %	0 %	75 %	25 %	170780521
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