MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	C	6	6	26703	26708	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_010407	G	6	6	32058	32063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010407	C	6	6	32677	32682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_010407	C	6	6	36051	36056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_010407	G	6	6	48722	48727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010407	C	6	6	83853	83858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_010407	G	6	6	87891	87896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010407	G	6	6	87969	87974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010407	G	6	6	88029	88034	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010407	C	6	6	138495	138500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_010407	G	6	6	141606	141611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010407	G	6	6	153595	153600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010407	G	6	6	162752	162757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010407	G	6	6	166582	166587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010407	G	6	6	172992	172997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010407	C	6	6	183533	183538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_010407	G	7	7	200604	200610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010407	C	7	7	206107	206113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_010407	G	6	6	257771	257776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010407	C	6	6	259585	259590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_010407	G	6	6	263091	263096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010407	G	6	6	347650	347655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010407	G	6	6	358147	358152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010407	G	9	9	358281	358289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010407	G	6	6	359407	359412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010407	G	6	6	360495	360500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010407	C	6	6	363501	363506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_010407	T	6	6	368821	368826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010407	C	6	6	373651	373656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_010407	G	6	6	379618	379623	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010407	G	8	8	382591	382598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010407	C	6	6	429769	429774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_010407	G	6	6	433378	433383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010407	C	6	6	464173	464178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_010407	G	6	6	468142	468147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010407	C	6	6	468222	468227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_010407	G	6	6	483468	483473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010407	C	7	7	487206	487212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_010407	G	6	6	504025	504030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010407	C	6	6	516487	516492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_010407	C	6	6	589435	589440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_010407	C	6	6	633861	633866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_010407	G	7	7	656760	656766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010407	G	6	6	674256	674261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010407	C	6	6	723754	723759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_010407	G	6	6	748669	748674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010407	C	7	7	767795	767801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_010407	G	6	6	812705	812710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010407	C	6	6	833905	833910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_010407	G	6	6	858182	858187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010407	G	6	6	863413	863418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010407	C	6	6	867375	867380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_010407	G	6	6	906774	906779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010407	C	6	6	908691	908696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_010407	C	6	6	914448	914453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_010407	G	7	7	914484	914490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010407	G	6	6	916258	916263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010407	G	6	6	924941	924946	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010407	G	7	7	943142	943148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010407	G	6	6	943569	943574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010407	C	6	6	962451	962456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_010407	G	6	6	997483	997488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010407	C	6	6	998468	998473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_010407	G	6	6	1002790	1002795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010407	C	6	6	1005240	1005245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_010407	C	6	6	1008650	1008655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_010407	C	7	7	1019735	1019741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_010407	C	6	6	1040938	1040943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_010407	A	6	6	1080889	1080894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010407	G	10	10	1092354	1092363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010407	C	6	6	1146263	1146268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_010407	T	6	6	1158508	1158513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010407	G	6	6	1168855	1168860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010407	G	9	9	1176207	1176215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010407	C	6	6	1178446	1178451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_010407	C	6	6	1223725	1223730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_010407	C	6	6	1228373	1228378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_010407	C	6	6	1275519	1275524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_010407	G	7	7	1301050	1301056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010407	G	6	6	1302451	1302456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010407	C	6	6	1376235	1376240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_010407	G	6	6	1382770	1382775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010407	G	6	6	1404642	1404647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010407	C	6	6	1413155	1413160	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_010407	C	10	10	1433389	1433398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_010407	C	7	7	1490375	1490381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_010407	A	6	6	1503922	1503927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010407	G	9	9	1543403	1543411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010407	C	7	7	1547678	1547684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_010407	C	6	6	1576134	1576139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_010407	G	7	7	1614326	1614332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010407	G	8	8	1620202	1620209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010407	C	6	6	1620840	1620845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_010407	G	6	6	1620906	1620911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010407	C	6	6	1665657	1665662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_010407	C	6	6	1672157	1672162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_010407	G	6	6	1674564	1674569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010407	C	6	6	1691605	1691610	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_010407	C	7	7	1728225	1728231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_010407	C	6	6	1744929	1744934	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_010407	C	6	6	1768082	1768087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_010407	C	6	6	1785728	1785733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_010407	C	6	6	1789878	1789883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_010407	T	6	6	1791987	1791992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010407	C	6	6	1818922	1818927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_010407	C	11	11	1840357	1840367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_010407	C	8	8	1867323	1867330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_010407	C	6	6	1867371	1867376	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_010407	G	6	6	1949178	1949183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010407	C	6	6	1972183	1972188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_010407	C	6	6	1980685	1980690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_010407	C	6	6	1980940	1980945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_010407	G	8	8	1982120	1982127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010407	C	6	6	2020080	2020085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_010407	C	6	6	2029822	2029827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_010407	C	8	8	2035280	2035287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_010407	G	6	6	2047731	2047736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010407	T	7	7	2049686	2049692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010407	C	6	6	2057063	2057068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_010407	C	6	6	2057777	2057782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_010407	C	6	6	2073329	2073334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_010407	C	6	6	2087252	2087257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_010407	C	6	6	2089828	2089833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_010407	G	6	6	2112706	2112711	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010407	G	6	6	2112723	2112728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010407	C	7	7	2119353	2119359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_010407	G	6	6	2161988	2161993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010407	C	7	7	2210249	2210255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_010407	G	6	6	2249174	2249179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010407	C	6	6	2272420	2272425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_010407	G	6	6	2282699	2282704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010407	G	8	8	2309432	2309439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010407	G	6	6	2329056	2329061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010407	C	6	6	2341258	2341263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_010407	G	7	7	2349387	2349393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010407	C	7	7	2352965	2352971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010407	C	6	6	2391964	2391969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_010407	C	6	6	2392197	2392202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_010407	C	6	6	2394003	2394008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_010407	G	6	6	2412482	2412487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010407	C	6	6	2418782	2418787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_010407	C	6	6	2419699	2419704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_010407	G	7	7	2425088	2425094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010407	G	8	8	2444801	2444808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010407	C	6	6	2459853	2459858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_010407	C	6	6	2498623	2498628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_010407	C	6	6	2521196	2521201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_010407	C	6	6	2521205	2521210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_010407	G	6	6	2524101	2524106	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.