MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	C	6	6	4372	4377	0 %	0 %	0 %	100 %	170780466
2	NC_010407	G	6	6	18151	18156	0 %	0 %	100 %	0 %	170780479
3	NC_010407	C	6	6	19249	19254	0 %	0 %	0 %	100 %	170780480
4	NC_010407	C	6	6	47776	47781	0 %	0 %	0 %	100 %	170780504
5	NC_010407	G	6	6	56357	56362	0 %	0 %	100 %	0 %	170780511
6	NC_010407	G	9	9	60157	60165	0 %	0 %	100 %	0 %	170780514
7	NC_010407	G	6	6	66204	66209	0 %	0 %	100 %	0 %	170780516
8	NC_010407	G	6	6	95703	95708	0 %	0 %	100 %	0 %	170780539
9	NC_010407	G	6	6	166758	166763	0 %	0 %	100 %	0 %	170780598
10	NC_010407	C	6	6	171659	171664	0 %	0 %	0 %	100 %	170780603
11	NC_010407	G	6	6	204108	204113	0 %	0 %	100 %	0 %	170780623
12	NC_010407	C	6	6	205079	205084	0 %	0 %	0 %	100 %	170780623
13	NC_010407	C	6	6	227181	227186	0 %	0 %	0 %	100 %	170780643
14	NC_010407	G	6	6	253035	253040	0 %	0 %	100 %	0 %	170780671
15	NC_010407	C	6	6	259747	259752	0 %	0 %	0 %	100 %	170780678
16	NC_010407	C	6	6	259856	259861	0 %	0 %	0 %	100 %	170780678
17	NC_010407	C	6	6	259938	259943	0 %	0 %	0 %	100 %	170780678
18	NC_010407	C	6	6	260010	260015	0 %	0 %	0 %	100 %	170780678
19	NC_010407	C	6	6	263657	263662	0 %	0 %	0 %	100 %	170780683
20	NC_010407	C	6	6	268518	268523	0 %	0 %	0 %	100 %	170780688
21	NC_010407	C	6	6	315094	315099	0 %	0 %	0 %	100 %	170780721
22	NC_010407	C	6	6	325529	325534	0 %	0 %	0 %	100 %	170780732
23	NC_010407	C	6	6	326589	326594	0 %	0 %	0 %	100 %	170780734
24	NC_010407	C	6	6	328516	328521	0 %	0 %	0 %	100 %	170780738
25	NC_010407	C	6	6	349002	349007	0 %	0 %	0 %	100 %	170780767
26	NC_010407	C	6	6	351793	351798	0 %	0 %	0 %	100 %	170780770
27	NC_010407	C	6	6	352233	352238	0 %	0 %	0 %	100 %	170780771
28	NC_010407	C	6	6	357274	357279	0 %	0 %	0 %	100 %	170780777
29	NC_010407	G	6	6	359009	359014	0 %	0 %	100 %	0 %	170780779
30	NC_010407	C	6	6	363787	363792	0 %	0 %	0 %	100 %	170780783
31	NC_010407	C	6	6	404112	404117	0 %	0 %	0 %	100 %	170780818
32	NC_010407	G	9	9	408631	408639	0 %	0 %	100 %	0 %	170780820
33	NC_010407	C	6	6	422056	422061	0 %	0 %	0 %	100 %	170780833
34	NC_010407	G	6	6	434037	434042	0 %	0 %	100 %	0 %	170780846
35	NC_010407	G	6	6	448856	448861	0 %	0 %	100 %	0 %	170780855
36	NC_010407	C	6	6	458621	458626	0 %	0 %	0 %	100 %	170780869
37	NC_010407	C	6	6	461803	461808	0 %	0 %	0 %	100 %	170780872
38	NC_010407	G	6	6	470352	470357	0 %	0 %	100 %	0 %	170780879
39	NC_010407	G	6	6	474169	474174	0 %	0 %	100 %	0 %	170780883
40	NC_010407	G	6	6	496174	496179	0 %	0 %	100 %	0 %	170780903
41	NC_010407	G	6	6	527851	527856	0 %	0 %	100 %	0 %	170780936
42	NC_010407	C	6	6	533752	533757	0 %	0 %	0 %	100 %	170780943
43	NC_010407	G	6	6	546614	546619	0 %	0 %	100 %	0 %	170780957
44	NC_010407	C	6	6	589129	589134	0 %	0 %	0 %	100 %	170780995
45	NC_010407	G	6	6	614620	614625	0 %	0 %	100 %	0 %	170781021
46	NC_010407	G	6	6	616464	616469	0 %	0 %	100 %	0 %	170781022
47	NC_010407	C	6	6	618188	618193	0 %	0 %	0 %	100 %	170781025
48	NC_010407	G	6	6	640545	640550	0 %	0 %	100 %	0 %	170781041
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50	NC_010407	C	6	6	673683	673688	0 %	0 %	0 %	100 %	170781071
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53	NC_010407	G	6	6	682593	682598	0 %	0 %	100 %	0 %	170781078
54	NC_010407	G	6	6	685224	685229	0 %	0 %	100 %	0 %	170781079
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61	NC_010407	C	6	6	818491	818496	0 %	0 %	0 %	100 %	170781201
62	NC_010407	G	6	6	818552	818557	0 %	0 %	100 %	0 %	170781201
63	NC_010407	C	6	6	828169	828174	0 %	0 %	0 %	100 %	170781211
64	NC_010407	G	6	6	837513	837518	0 %	0 %	100 %	0 %	170781216
65	NC_010407	C	6	6	874571	874576	0 %	0 %	0 %	100 %	170781249
66	NC_010407	G	6	6	884320	884325	0 %	0 %	100 %	0 %	170781262
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70	NC_010407	C	6	6	982804	982809	0 %	0 %	0 %	100 %	170781356
71	NC_010407	C	6	6	999601	999606	0 %	0 %	0 %	100 %	170781372
72	NC_010407	G	6	6	999747	999752	0 %	0 %	100 %	0 %	170781372
73	NC_010407	C	6	6	1026812	1026817	0 %	0 %	0 %	100 %	170781401
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81	NC_010407	G	6	6	1125256	1125261	0 %	0 %	100 %	0 %	170781481
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91	NC_010407	G	6	6	1257291	1257296	0 %	0 %	100 %	0 %	170781608
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107	NC_010407	C	6	6	1510649	1510654	0 %	0 %	0 %	100 %	170781833
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.