MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p3ABAYE

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010404	TATT	2	8	955	962	25 %	75 %	0 %	0 %	169786890
2	NC_010404	ATTT	2	8	1257	1264	25 %	75 %	0 %	0 %	169786890
3	NC_010404	AAGA	2	8	1823	1830	75 %	0 %	25 %	0 %	169786890
4	NC_010404	TGAA	2	8	1887	1894	50 %	25 %	25 %	0 %	169786890
5	NC_010404	ATCA	2	8	3282	3289	50 %	25 %	0 %	25 %	169786891
6	NC_010404	GATG	2	8	3394	3401	25 %	25 %	50 %	0 %	169786891
7	NC_010404	CCAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	25 %	50 %	169786891
8	NC_010404	TAAA	2	8	4250	4257	75 %	25 %	0 %	0 %	169786891
9	NC_010404	TGAC	2	8	4452	4459	25 %	25 %	25 %	25 %	169786891
10	NC_010404	ACGT	2	8	4694	4701	25 %	25 %	25 %	25 %	169786891
11	NC_010404	AAAG	2	8	4855	4862	75 %	0 %	25 %	0 %	169786891
12	NC_010404	TTCC	2	8	4952	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	169786891
13	NC_010404	TAAA	2	8	5141	5148	75 %	25 %	0 %	0 %	169786891
14	NC_010404	TTTG	2	8	7277	7284	0 %	75 %	25 %	0 %	169786892
15	NC_010404	ATCA	2	8	7495	7502	50 %	25 %	0 %	25 %	169786892
16	NC_010404	TCTT	2	8	7909	7916	0 %	75 %	0 %	25 %	169786892
17	NC_010404	CATC	2	8	8527	8534	25 %	25 %	0 %	50 %	169786893
18	NC_010404	CAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	0 %	50 %	169786893
19	NC_010404	AGCA	2	8	8916	8923	50 %	0 %	25 %	25 %	169786893
20	NC_010404	TAAA	2	8	9171	9178	75 %	25 %	0 %	0 %	169786893
21	NC_010404	CAAA	2	8	9797	9804	75 %	0 %	0 %	25 %	169786894
22	NC_010404	TCAT	2	8	9805	9812	25 %	50 %	0 %	25 %	169786894
23	NC_010404	CAGC	2	8	10204	10211	25 %	0 %	25 %	50 %	169786895
24	NC_010404	AATT	2	8	10233	10240	50 %	50 %	0 %	0 %	169786895
25	NC_010404	TTTA	2	8	11594	11601	25 %	75 %	0 %	0 %	169786896
26	NC_010404	ACTT	2	8	12709	12716	25 %	50 %	0 %	25 %	169786897
27	NC_010404	TAAA	2	8	12888	12895	75 %	25 %	0 %	0 %	169786897
28	NC_010404	TAGG	2	8	13679	13686	25 %	25 %	50 %	0 %	169786898
29	NC_010404	GGAT	2	8	13802	13809	25 %	25 %	50 %	0 %	169786898
30	NC_010404	TGAT	2	8	13918	13925	25 %	50 %	25 %	0 %	169786898
31	NC_010404	TGCT	2	8	14212	14219	0 %	50 %	25 %	25 %	169786899
32	NC_010404	GATG	2	8	14618	14625	25 %	25 %	50 %	0 %	169786899
33	NC_010404	AGAA	2	8	14695	14702	75 %	0 %	25 %	0 %	169786899
34	NC_010404	TGAC	2	8	14747	14754	25 %	25 %	25 %	25 %	169786899
35	NC_010404	ATCT	2	8	15485	15492	25 %	50 %	0 %	25 %	169786900
36	NC_010404	TTGA	2	8	15969	15976	25 %	50 %	25 %	0 %	169786901
37	NC_010404	TTTC	2	8	16009	16016	0 %	75 %	0 %	25 %	169786901
38	NC_010404	CATA	2	8	16201	16208	50 %	25 %	0 %	25 %	169786902
39	NC_010404	GCCA	2	8	16234	16241	25 %	0 %	25 %	50 %	169786902
40	NC_010404	ATAA	2	8	16358	16365	75 %	25 %	0 %	0 %	169786902
41	NC_010404	CAAC	2	8	16519	16526	50 %	0 %	0 %	50 %	169786902
42	NC_010404	ACCA	2	8	16595	16602	50 %	0 %	0 %	50 %	169786902
43	NC_010404	ATGT	2	8	16948	16955	25 %	50 %	25 %	0 %	169786902
44	NC_010404	CTAA	2	8	17708	17715	50 %	25 %	0 %	25 %	169786903
45	NC_010404	ATCT	2	8	19145	19152	25 %	50 %	0 %	25 %	169786904
46	NC_010404	CAAA	2	8	20759	20766	75 %	0 %	0 %	25 %	169786906
47	NC_010404	ATGA	2	8	22033	22040	50 %	25 %	25 %	0 %	169786907
48	NC_010404	CCAG	2	8	22049	22056	25 %	0 %	25 %	50 %	169786907
49	NC_010404	GATT	2	8	22345	22352	25 %	50 %	25 %	0 %	169786907
50	NC_010404	TCAT	2	8	22947	22954	25 %	50 %	0 %	25 %	169786908
51	NC_010404	GCAA	2	8	24104	24111	50 %	0 %	25 %	25 %	169786909
52	NC_010404	GATT	2	8	24439	24446	25 %	50 %	25 %	0 %	169786909
53	NC_010404	TTTA	2	8	25218	25225	25 %	75 %	0 %	0 %	169786910
54	NC_010404	ACTG	2	8	25347	25354	25 %	25 %	25 %	25 %	169786910
55	NC_010404	GCAT	2	8	25500	25507	25 %	25 %	25 %	25 %	169786910
56	NC_010404	ATTT	2	8	26509	26516	25 %	75 %	0 %	0 %	169786911
57	NC_010404	GTAT	2	8	26615	26622	25 %	50 %	25 %	0 %	169786911
58	NC_010404	TAAA	2	8	27132	27139	75 %	25 %	0 %	0 %	169786911
59	NC_010404	ACTG	2	8	27268	27275	25 %	25 %	25 %	25 %	169786911
60	NC_010404	TACT	2	8	27287	27294	25 %	50 %	0 %	25 %	169786911
61	NC_010404	TGGT	2	8	27795	27802	0 %	50 %	50 %	0 %	169786912
62	NC_010404	ATTA	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	169786912
63	NC_010404	TTTG	2	8	28414	28421	0 %	75 %	25 %	0 %	169786912
64	NC_010404	GAAA	2	8	28515	28522	75 %	0 %	25 %	0 %	169786912
65	NC_010404	TCAC	2	8	30144	30151	25 %	25 %	0 %	50 %	169786913
66	NC_010404	CATG	2	8	31835	31842	25 %	25 %	25 %	25 %	169786914
67	NC_010404	TGCT	2	8	32648	32655	0 %	50 %	25 %	25 %	169786915
68	NC_010404	AAAG	2	8	33587	33594	75 %	0 %	25 %	0 %	169786916
69	NC_010404	ACAA	2	8	33618	33625	75 %	0 %	0 %	25 %	169786916
70	NC_010404	AATG	2	8	36562	36569	50 %	25 %	25 %	0 %	169786921
71	NC_010404	ATAA	2	8	37312	37319	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
72	NC_010404	TAAA	2	8	37472	37479	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
73	NC_010404	AATA	2	8	38077	38084	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
74	NC_010404	AGAC	3	12	38097	38108	50 %	0 %	25 %	25 %	169786922
75	NC_010404	ATGA	2	8	38600	38607	50 %	25 %	25 %	0 %	169786923
76	NC_010404	TCAA	2	8	41356	41363	50 %	25 %	0 %	25 %	169786928
77	NC_010404	TATT	2	8	41374	41381	25 %	75 %	0 %	0 %	169786928
78	NC_010404	AATT	2	8	41403	41410	50 %	50 %	0 %	0 %	169786928
79	NC_010404	TAAA	2	8	41826	41833	75 %	25 %	0 %	0 %	169786929
80	NC_010404	CATT	2	8	42822	42829	25 %	50 %	0 %	25 %	169786931
81	NC_010404	TACT	2	8	43571	43578	25 %	50 %	0 %	25 %	169786933
82	NC_010404	TTAG	2	8	44065	44072	25 %	50 %	25 %	0 %	169786933
83	NC_010404	AAAT	3	12	46248	46259	75 %	25 %	0 %	0 %	169786935
84	NC_010404	GTGA	2	8	46407	46414	25 %	25 %	50 %	0 %	169786935
85	NC_010404	TGCA	2	8	46483	46490	25 %	25 %	25 %	25 %	169786935
86	NC_010404	TTCA	2	8	46864	46871	25 %	50 %	0 %	25 %	169786935
87	NC_010404	TAAA	2	8	46994	47001	75 %	25 %	0 %	0 %	169786935
88	NC_010404	ATTC	3	12	47517	47528	25 %	50 %	0 %	25 %	169786935
89	NC_010404	ATTG	2	8	47561	47568	25 %	50 %	25 %	0 %	169786935
90	NC_010404	CATA	2	8	48757	48764	50 %	25 %	0 %	25 %	169786936
91	NC_010404	ATTC	2	8	49776	49783	25 %	50 %	0 %	25 %	169786937
92	NC_010404	TGAA	2	8	49796	49803	50 %	25 %	25 %	0 %	169786937
93	NC_010404	ATAG	2	8	50107	50114	50 %	25 %	25 %	0 %	169786937
94	NC_010404	GCCA	2	8	50549	50556	25 %	0 %	25 %	50 %	169786937
95	NC_010404	AATC	2	8	50907	50914	50 %	25 %	0 %	25 %	169786937
96	NC_010404	ATAA	2	8	50964	50971	75 %	25 %	0 %	0 %	169786937
97	NC_010404	ATTT	2	8	51138	51145	25 %	75 %	0 %	0 %	169786937
98	NC_010404	TATG	2	8	51844	51851	25 %	50 %	25 %	0 %	169786937
99	NC_010404	ATCA	2	8	52072	52079	50 %	25 %	0 %	25 %	169786937
100	NC_010404	CATT	2	8	52149	52156	25 %	50 %	0 %	25 %	169786937
101	NC_010404	CTTT	2	8	52208	52215	0 %	75 %	0 %	25 %	169786937
102	NC_010404	GACT	2	8	52230	52237	25 %	25 %	25 %	25 %	169786937
103	NC_010404	AACG	2	8	55225	55232	50 %	0 %	25 %	25 %	169786938
104	NC_010404	TGCC	2	8	55503	55510	0 %	25 %	25 %	50 %	169786938
105	NC_010404	TTCA	2	8	55834	55841	25 %	50 %	0 %	25 %	169786938
106	NC_010404	TCTT	2	8	56002	56009	0 %	75 %	0 %	25 %	169786939
107	NC_010404	CTGC	2	8	57422	57429	0 %	25 %	25 %	50 %	169786939
108	NC_010404	TTTG	2	8	58633	58640	0 %	75 %	25 %	0 %	169786940
109	NC_010404	ATAG	2	8	58891	58898	50 %	25 %	25 %	0 %	169786940
110	NC_010404	ATTT	2	8	59255	59262	25 %	75 %	0 %	0 %	169786940
111	NC_010404	ATTC	2	8	59894	59901	25 %	50 %	0 %	25 %	169786940
112	NC_010404	CTTT	2	8	60110	60117	0 %	75 %	0 %	25 %	169786941
113	NC_010404	AAAT	2	8	61483	61490	75 %	25 %	0 %	0 %	169786941
114	NC_010404	CTTT	2	8	61838	61845	0 %	75 %	0 %	25 %	169786941
115	NC_010404	TAAA	2	8	62289	62296	75 %	25 %	0 %	0 %	169786941
116	NC_010404	TAAA	2	8	62431	62438	75 %	25 %	0 %	0 %	169786941
117	NC_010404	ATCA	2	8	62551	62558	50 %	25 %	0 %	25 %	169786941
118	NC_010404	TCTT	2	8	62768	62775	0 %	75 %	0 %	25 %	169786941
119	NC_010404	CAGC	2	8	62797	62804	25 %	0 %	25 %	50 %	169786941
120	NC_010404	TCAC	2	8	63501	63508	25 %	25 %	0 %	50 %	169786942
121	NC_010404	TTTA	2	8	64064	64071	25 %	75 %	0 %	0 %	169786942
122	NC_010404	TGTT	2	8	64155	64162	0 %	75 %	25 %	0 %	169786942
123	NC_010404	GCCA	2	8	64690	64697	25 %	0 %	25 %	50 %	169786942
124	NC_010404	CGTT	2	8	66852	66859	0 %	50 %	25 %	25 %	169786942
125	NC_010404	TCAA	2	8	67158	67165	50 %	25 %	0 %	25 %	169786942
126	NC_010404	CAGC	2	8	68500	68507	25 %	0 %	25 %	50 %	169786945
127	NC_010404	TTCA	2	8	68621	68628	25 %	50 %	0 %	25 %	169786945
128	NC_010404	TGCT	2	8	68757	68764	0 %	50 %	25 %	25 %	169786945
129	NC_010404	GGCA	2	8	68893	68900	25 %	0 %	50 %	25 %	169786945
130	NC_010404	TCGC	2	8	69235	69242	0 %	25 %	25 %	50 %	169786945
131	NC_010404	AATA	2	8	69291	69298	75 %	25 %	0 %	0 %	169786945
132	NC_010404	GTCT	2	8	71139	71146	0 %	50 %	25 %	25 %	169786947
133	NC_010404	ATTT	2	8	72001	72008	25 %	75 %	0 %	0 %	169786948
134	NC_010404	ATTG	2	8	72080	72087	25 %	50 %	25 %	0 %	169786948
135	NC_010404	AGCA	2	8	72135	72142	50 %	0 %	25 %	25 %	169786948
136	NC_010404	AAAT	2	8	72354	72361	75 %	25 %	0 %	0 %	169786949
137	NC_010404	TACC	2	8	72828	72835	25 %	25 %	0 %	50 %	169786950
138	NC_010404	TTAT	2	8	73533	73540	25 %	75 %	0 %	0 %	169786951
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.