MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF chromosome

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010400	AATTTA	2	12	210	221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010400	CAAAAA	2	12	12715	12726	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010400	GAAATC	2	12	25706	25717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010400	AGAAAA	2	12	40903	40914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010400	ATAAAA	2	12	44169	44180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010400	AAAAAG	2	12	48663	48674	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010400	TATTTT	2	12	51799	51810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010400	TGGCTC	2	12	89342	89353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010400	CGATTG	2	12	89558	89569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010400	TCCTGT	2	12	101571	101582	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010400	TCCTGT	2	12	102750	102761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010400	TCCTGT	2	12	103667	103678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010400	AATTTA	2	12	108830	108841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010400	TAAAGC	2	12	127902	127913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010400	ATAAAT	2	12	139892	139903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010400	ATTGAC	2	12	154544	154555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010400	AATTTT	2	12	177452	177463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010400	GAAATC	2	12	182013	182024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010400	TTTTTA	2	12	186975	186986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010400	TAAATA	2	12	212831	212842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010400	TGGTCT	2	12	231237	231248	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010400	AGGGGC	2	12	239185	239196	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010400	ATTTTT	2	12	239215	239226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010400	TAAAAA	2	12	239390	239401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010400	TAAATG	2	12	279711	279722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010400	GTAAAA	2	12	304641	304652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010400	TATTTT	2	12	309482	309493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010400	TATAAA	2	12	312505	312516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010400	AGAAAT	2	12	316594	316605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010400	TTTGCA	2	12	339420	339431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010400	ATGGCT	2	12	344450	344461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010400	TATCGG	2	12	352388	352399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010400	CTTGTT	2	12	354197	354208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010400	TAATTT	2	12	354464	354475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010400	GTTTAT	2	12	362250	362261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010400	TGTAGC	2	12	363316	363327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010400	CCATAC	2	12	367387	367398	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010400	AGCTCT	2	12	389834	389845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010400	AAAGAT	2	12	390242	390253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010400	GTTCTT	2	12	393872	393883	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010400	CACCAA	2	12	394166	394177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010400	GCAAGA	2	12	394672	394683	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010400	GAAATT	2	12	415006	415017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010400	TAGTTT	2	12	425489	425500	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010400	TATAAA	2	12	427319	427330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010400	AAAATG	2	12	435038	435049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010400	AGCTGA	2	12	437024	437035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010400	CGCCTT	2	12	445340	445351	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010400	GAAATC	2	12	454564	454575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010400	TATTTT	2	12	468370	468381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010400	AAAATT	2	12	491915	491926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010400	AACTTC	2	12	515796	515807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010400	TCTTTA	2	12	517193	517204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010400	ATTGAT	2	12	521389	521400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010400	AAAATT	2	12	564661	564672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010400	GTCAAT	2	12	566129	566140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010400	CAAGTA	2	12	573710	573721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010400	CGTATG	2	12	573931	573942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010400	TGCCAA	2	12	575277	575288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010400	TTAATT	2	12	580637	580648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010400	TGAAAT	2	12	592435	592446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010400	TAAAAA	2	12	599100	599111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010400	AGGTTT	2	12	619535	619546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010400	CTTGTT	2	12	686555	686566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010400	TTATTT	2	12	692671	692682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010400	TCTAAT	2	12	694188	694199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010400	CAATAT	2	12	722337	722348	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010400	GGTTAT	2	12	758581	758592	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010400	TCGTGG	2	12	768512	768523	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010400	GGGCAA	2	12	769330	769341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010400	CCAATG	2	12	777562	777573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010400	TATTTA	2	12	821627	821638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010400	GGGCAG	2	12	822287	822298	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010400	TTTTTA	2	12	836468	836479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010400	AAAAAT	2	12	839846	839857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010400	CACTTG	2	12	845468	845479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010400	TAAAAA	2	12	864379	864390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010400	CAATAT	2	12	887087	887098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010400	GCATAA	2	12	889437	889448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010400	TAAAAA	2	12	892755	892766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010400	ACAATA	2	12	914995	915006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010400	GTTTTT	2	12	919373	919384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010400	TTTTTA	2	12	922015	922026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010400	TTGAAT	2	12	935801	935812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010400	AAAGAA	2	12	946171	946182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010400	TGGTAT	2	12	967432	967443	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010400	TGCTGT	2	12	980331	980342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010400	CGTAAG	2	12	980625	980636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010400	TAAAAA	2	12	996850	996861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010400	TTCCAG	2	12	1006336	1006347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010400	AAAAGA	2	12	1012019	1012030	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010400	TTAAAT	2	12	1028476	1028487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010400	GAGATA	2	12	1030088	1030099	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010400	TTTTAT	2	12	1060502	1060513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010400	TGAAAT	2	12	1062087	1062098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010400	TTGAAA	2	12	1064649	1064660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010400	TTTTTG	2	12	1066642	1066653	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010400	ACTTTA	2	12	1076821	1076832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010400	CAGATG	2	12	1077785	1077796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010400	TGTAGG	2	12	1090350	1090361	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010400	TAAAAA	2	12	1092417	1092428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010400	GACATT	2	12	1113406	1113417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010400	CTTTTT	2	12	1116665	1116676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010400	AATATT	2	12	1117769	1117780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010400	CCAATA	2	12	1135936	1135947	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010400	AAAAGC	2	12	1138400	1138411	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010400	CCAGCA	2	12	1146784	1146795	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010400	AGGGTT	2	12	1146905	1146916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010400	AGATAA	2	12	1156721	1156732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010400	AGCAAA	2	12	1160500	1160511	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010400	GATTTG	2	12	1166492	1166503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010400	AACAAA	2	12	1166541	1166552	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010400	TGAACA	2	12	1181142	1181153	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010400	GAAGTA	2	12	1199012	1199023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010400	TTGCTG	2	12	1199760	1199771	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010400	TACGCT	2	12	1200715	1200726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010400	AAATAT	2	12	1202200	1202211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010400	AAATAG	2	12	1205191	1205202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010400	GATCTG	2	12	1205841	1205852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010400	ACTACG	2	12	1206408	1206419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010400	AAGTCG	2	12	1209093	1209104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010400	AATATT	2	12	1210121	1210132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010400	GATAAA	2	12	1211117	1211128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010400	ATAAAA	2	12	1225924	1225935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010400	GAAAAT	2	12	1228374	1228385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010400	GGTAAC	2	12	1257768	1257779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010400	TTGGCT	2	12	1265954	1265965	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010400	CCAATA	2	12	1287973	1287984	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010400	GATTAA	2	12	1302244	1302255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010400	TAAGAT	2	12	1318078	1318089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010400	CAATAT	2	12	1320972	1320983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010400	GTGATT	2	12	1332471	1332482	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010400	TAAATA	2	12	1374892	1374903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_010400	CAAAAA	2	12	3188227	3188238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_010400	ATGCAA	2	12	3194203	3194214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_010400	AACTTA	2	12	3216179	3216190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_010400	AATGGA	2	12	3231184	3231195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_010400	ATATTG	2	12	3242474	3242485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_010400	CAACTT	2	12	3250536	3250547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_010400	CATCTT	2	12	3337258	3337269	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_010400	AAAGGT	2	12	3337271	3337282	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010400	ATAAAT	2	12	3355587	3355598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010400	TTTTAT	2	12	3359040	3359051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010400	TCTGTA	2	12	3367470	3367481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_010400	AAAATA	2	12	3373040	3373051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010400	TAAATT	2	12	3399909	3399920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010400	TTTAAA	2	12	3400120	3400131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010400	TTTAAA	2	12	3400275	3400286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010400	TTTATT	2	12	3421824	3421835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.