MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCS1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010399	CAGA	2	8	1556	1563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010399	AGAT	2	8	1642	1649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010399	AAGA	2	8	1668	1675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010399	GGCT	2	8	1923	1930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010399	CAGC	2	8	2823	2830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010399	CGGC	2	8	2840	2847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010399	GTAC	2	8	3942	3949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010399	GGAA	2	8	17658	17665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010399	AGTT	2	8	20259	20266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010399	CGAG	2	8	21606	21613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010399	CCGA	2	8	22346	22353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010399	GTCG	2	8	23920	23927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010399	CATG	2	8	23959	23966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010399	GGGA	2	8	24066	24073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010399	CAGT	2	8	24098	24105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010399	GATA	2	8	24595	24602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010399	CCGC	2	8	27740	27747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_010399	GTCG	2	8	27781	27788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010399	CGAT	2	8	27867	27874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010399	CGTG	2	8	29330	29337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010399	GCCC	2	8	29480	29487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_010399	CCGC	5	20	29494	29513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_010399	GCCG	2	8	34963	34970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010399	CGGC	2	8	38044	38051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010399	CCGG	2	8	39144	39151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010399	CCGG	2	8	39163	39170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010399	GGCA	2	8	39254	39261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010399	TCGA	2	8	42826	42833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010399	TGGG	2	8	42914	42921	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010399	TGCG	2	8	42961	42968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010399	GCCT	2	8	43302	43309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010399	CCCG	2	8	46916	46923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_010399	GGCT	2	8	48879	48886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010399	CTGC	2	8	49312	49319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010399	CGAG	2	8	50214	50221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.