MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCS1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010399	CT	3	6	1518	1523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010399	AG	3	6	1618	1623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010399	GA	4	8	1631	1638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010399	TG	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010399	GC	3	6	9006	9011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010399	GC	3	6	20249	20254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010399	GA	3	6	21599	21604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010399	CG	3	6	24024	24029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010399	CG	3	6	25859	25864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010399	GC	3	6	29361	29366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010399	GC	3	6	29488	29493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010399	GC	3	6	31473	31478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010399	CT	3	6	31491	31496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010399	CT	3	6	33744	33749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010399	CG	3	6	34969	34974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010399	TC	3	6	35550	35555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010399	GC	4	8	37931	37938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010399	CT	3	6	38132	38137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010399	GA	3	6	38223	38228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010399	TA	3	6	39605	39610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010399	CG	4	8	42026	42033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010399	GC	3	6	42744	42749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010399	TC	3	6	43040	43045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010399	CG	3	6	45458	45463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010399	CG	3	6	46868	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010399	GC	3	6	48847	48852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010399	CG	3	6	49123	49128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010399	GC	3	6	50250	50255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.