MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p3ABSDF

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010398	AAT	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010398	ATA	2	6	147	152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010398	CAT	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010398	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010398	AAT	3	9	539	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010398	GAA	2	6	562	567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
7	NC_010398	CAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786865
8	NC_010398	GTT	2	6	727	732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786865
9	NC_010398	AAG	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
10	NC_010398	TGA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786865
11	NC_010398	TGT	2	6	919	924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786865
12	NC_010398	AGA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786865
13	NC_010398	CTA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786865
14	NC_010398	CTT	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786865
15	NC_010398	CAA	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786865
16	NC_010398	AAG	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786866
17	NC_010398	TGG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786866
18	NC_010398	AAC	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786866
19	NC_010398	ACA	2	6	1954	1959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786866
20	NC_010398	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786866
21	NC_010398	AAT	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786866
22	NC_010398	ACA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010398	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010398	TCT	2	6	2284	2289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786867
25	NC_010398	CAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786867
26	NC_010398	CAA	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786867
27	NC_010398	TCA	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
28	NC_010398	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786867
29	NC_010398	ATC	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
30	NC_010398	ATT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
31	NC_010398	GTA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786867
32	NC_010398	AAT	2	6	2643	2648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
33	NC_010398	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
34	NC_010398	ATC	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786867
35	NC_010398	AAT	2	6	2837	2842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
36	NC_010398	AAG	2	6	2927	2932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786867
37	NC_010398	TAA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
38	NC_010398	TAA	2	6	2955	2960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786867
39	NC_010398	TAT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786867
40	NC_010398	CAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010398	CCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786868
42	NC_010398	ACA	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786868
43	NC_010398	ATA	2	6	3406	3411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
44	NC_010398	TCA	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786868
45	NC_010398	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
46	NC_010398	CCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786868
47	NC_010398	ATC	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786868
48	NC_010398	TAA	2	6	3511	3516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786868
49	NC_010398	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786869
50	NC_010398	ATC	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
51	NC_010398	CCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786869
52	NC_010398	TGT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786869
53	NC_010398	CAT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
54	NC_010398	CTT	2	6	4205	4210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786869
55	NC_010398	TTA	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
56	NC_010398	TCA	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786869
57	NC_010398	AGT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786869
58	NC_010398	TTA	2	6	4447	4452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
59	NC_010398	GAG	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786869
60	NC_010398	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
61	NC_010398	CTT	2	6	4607	4612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786869
62	NC_010398	TAG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786869
63	NC_010398	TTA	2	6	4963	4968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
64	NC_010398	ATT	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786869
65	NC_010398	CAA	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786869
66	NC_010398	TCA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
67	NC_010398	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786870
68	NC_010398	CTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786870
69	NC_010398	TCT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786870
70	NC_010398	ATT	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786870
71	NC_010398	TCA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
72	NC_010398	AAC	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786870
73	NC_010398	GCC	2	6	5430	5435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786870
74	NC_010398	CAT	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786870
75	NC_010398	TGA	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786870
76	NC_010398	TAT	2	6	5535	5540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010398	GAT	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786871
78	NC_010398	CAT	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786871
79	NC_010398	AGA	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786871
80	NC_010398	TTA	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786871
81	NC_010398	TCA	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786871
82	NC_010398	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786871
83	NC_010398	AGT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786871
84	NC_010398	CAA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786871
85	NC_010398	CAC	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786871
86	NC_010398	AAT	2	6	6651	6656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010398	GTT	2	6	6678	6683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010398	AAT	2	6	6890	6895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786872
89	NC_010398	AAT	2	6	6968	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786872
90	NC_010398	CAA	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786872
91	NC_010398	CCA	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786872
92	NC_010398	GTT	2	6	7243	7248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786872
93	NC_010398	TAC	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786872
94	NC_010398	AAC	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786872
95	NC_010398	AGA	2	6	7614	7619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786872
96	NC_010398	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786872
97	NC_010398	ATC	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786873
98	NC_010398	AGA	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786874
99	NC_010398	TGA	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786874
100	NC_010398	CAC	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786874
101	NC_010398	ACC	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786874
102	NC_010398	ACC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786874
103	NC_010398	CCA	2	6	8965	8970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786874
104	NC_010398	CAG	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786874
105	NC_010398	CAG	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786874
106	NC_010398	AGA	2	6	9148	9153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786874
107	NC_010398	AAG	2	6	9368	9373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786875
108	NC_010398	AAG	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786875
109	NC_010398	ACA	2	6	9471	9476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786875
110	NC_010398	ATT	2	6	9527	9532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786875
111	NC_010398	TTG	2	6	9546	9551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786875
112	NC_010398	TGA	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786875
113	NC_010398	TGA	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786875
114	NC_010398	AAT	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786875
115	NC_010398	AGT	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786875
116	NC_010398	ATT	2	6	9937	9942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010398	TGA	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010398	TCC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010398	AAT	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786876
120	NC_010398	TAA	2	6	10186	10191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786876
121	NC_010398	TAA	2	6	10199	10204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786876
122	NC_010398	ACT	2	6	10242	10247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786876
123	NC_010398	GAT	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786876
124	NC_010398	AAG	2	6	10453	10458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786876
125	NC_010398	TTG	2	6	10462	10467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786876
126	NC_010398	AGA	2	6	10475	10480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786876
127	NC_010398	GAT	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786876
128	NC_010398	ATT	2	6	10508	10513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786876
129	NC_010398	ATC	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786876
130	NC_010398	TGC	2	6	10583	10588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786876
131	NC_010398	CAC	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786876
132	NC_010398	TGG	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786876
133	NC_010398	TTC	2	6	10881	10886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786876
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260	NC_010398	ATA	2	6	21111	21116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010398	CTA	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
262	NC_010398	TTC	2	6	21248	21253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786886
263	NC_010398	TAC	2	6	21262	21267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
264	NC_010398	TAC	2	6	21422	21427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
265	NC_010398	CAT	2	6	21595	21600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
266	NC_010398	GTT	2	6	21622	21627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786886
267	NC_010398	TCA	2	6	21756	21761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
268	NC_010398	TTC	2	6	21800	21805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786886
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271	NC_010398	CTT	3	9	22372	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786886
272	NC_010398	TCT	2	6	22734	22739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786886
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279	NC_010398	ACT	2	6	23028	23033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786886
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282	NC_010398	TAT	2	6	23317	23322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010398	TGA	2	6	23325	23330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_010398	ACT	2	6	23526	23531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_010398	TAA	2	6	23708	23713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010398	AAT	2	6	23752	23757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_010398	AAT	2	6	23876	23881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010398	GAC	2	6	23911	23916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_010398	ATC	2	6	24426	24431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786888
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293	NC_010398	AAT	2	6	24522	24527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786888
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295	NC_010398	TCA	2	6	24697	24702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786888
296	NC_010398	ATA	2	6	24892	24897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.