MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010397	CGGTTC	2	12	12922	12933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010397	GCAAAT	2	12	119910	119921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010397	GCCGAC	2	12	176343	176354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010397	GGCGCG	2	12	203435	203446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010397	CCGCCA	2	12	270406	270417	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010397	TCGGCA	2	12	339029	339040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010397	CAGCGC	2	12	448931	448942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010397	CGGCTC	2	12	652074	652085	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010397	CTGATT	2	12	671673	671684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010397	CCGTCG	2	12	751832	751843	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010397	TATCTG	2	12	756576	756587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010397	GGAATC	2	12	771214	771225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010397	GCACAC	2	12	790331	790342	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010397	GCTCCG	2	12	792195	792206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010397	TAATGA	2	12	801209	801220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010397	ATATCA	2	12	826543	826554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010397	CGTGTC	2	12	868060	868071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010397	CTGTCG	2	12	880562	880573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010397	GAACCA	2	12	914455	914466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010397	CCTCAC	2	12	933303	933314	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010397	TATCGA	2	12	979009	979020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010397	CTGGGT	2	12	1003179	1003190	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010397	CAGCGC	2	12	1040073	1040084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010397	AAACGT	2	12	1046148	1046159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010397	ATGATA	2	12	1055654	1055665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010397	TAGACG	2	12	1101570	1101581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010397	GAGGTG	2	12	1127753	1127764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010397	CGCGAC	2	12	1155383	1155394	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010397	ATGGTT	2	12	1230132	1230143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010397	GTAACT	2	12	1327255	1327266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010397	CCACCC	2	12	1362974	1362985	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_010397	CAGAAC	2	12	1446650	1446661	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010397	AGTGCA	2	12	1466741	1466752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010397	GTGTCG	2	12	1586361	1586372	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010397	TGACGT	2	12	1626158	1626169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010397	TCACAT	2	12	1628203	1628214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010397	GCTTGG	2	12	1763295	1763306	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010397	TGTGAT	2	12	1772497	1772508	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010397	AAGCGG	2	12	1774534	1774545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010397	GTTGAG	2	12	1776271	1776282	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010397	GTTCGG	2	12	1809225	1809236	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010397	GGGGTG	2	12	1883990	1884001	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010397	GAGTGT	2	12	1913150	1913161	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010397	CCTACA	2	12	2076152	2076163	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010397	GCCCGG	2	12	2084411	2084422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010397	GCCGCG	2	12	2338314	2338325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010397	GATGTC	2	12	2340917	2340928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010397	CTCGTT	2	12	2390855	2390866	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010397	CTTAGG	2	12	2471537	2471548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010397	GGGGAC	2	12	2492357	2492368	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010397	ATGGCG	2	12	2623878	2623889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010397	TGGTCG	3	18	2640496	2640513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010397	TGCTGA	2	12	2680585	2680596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010397	ACCCGA	2	12	2766717	2766728	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010397	CCCGCC	2	12	2817456	2817467	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_010397	GACCGT	2	12	2904742	2904753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010397	CGGTGG	2	12	2974248	2974259	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010397	GCTGAC	2	12	3042472	3042483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010397	AGGACG	2	12	3085486	3085497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010397	CCGACA	2	12	3089659	3089670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010397	CATGCG	2	12	3195301	3195312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010397	CTGCAC	2	12	3281102	3281113	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010397	CACTGA	2	12	3395320	3395331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010397	CCGAGG	2	12	3423314	3423325	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010397	AGATCC	2	12	3462611	3462622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010397	CACGGG	2	12	3537003	3537014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010397	GCGATG	2	12	3618762	3618773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010397	GCCCTA	2	12	3665851	3665862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010397	CAGACA	2	12	3669903	3669914	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010397	AGTGCT	2	12	3787748	3787759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010397	GTTCCC	2	12	3852715	3852726	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010397	GGTTTG	2	12	3928176	3928187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010397	AGATAT	2	12	4198734	4198745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010397	AAACGT	2	12	4406479	4406490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010397	ACCCCG	2	12	4485113	4485124	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010397	AGCGCG	2	12	4834809	4834820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010397	CGCGGC	2	12	4845372	4845383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010397	CTCGAA	2	12	4850250	4850261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010397	CATATC	2	12	4898838	4898849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010397	CATCGC	2	12	4911064	4911075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010397	GCGGCA	2	12	4932567	4932578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010397	CAAAGC	2	12	4935728	4935739	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010397	ACCGCG	2	12	4948458	4948469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010397	TCACCG	2	12	5058557	5058568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010397	GCCGAT	2	12	5066965	5066976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.