MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p2ABSDF

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010396	AAGG	2	8	694	701	50 %	0 %	50 %	0 %	169786834
2	NC_010396	AATA	2	8	894	901	75 %	25 %	0 %	0 %	169786834
3	NC_010396	GATT	2	8	1704	1711	25 %	50 %	25 %	0 %	169786835
4	NC_010396	TAAT	2	8	2181	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	169786836
5	NC_010396	TTTA	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	169786836
6	NC_010396	ATAA	2	8	3777	3784	75 %	25 %	0 %	0 %	169786837
7	NC_010396	AGAC	2	8	4085	4092	50 %	0 %	25 %	25 %	169786837
8	NC_010396	AATG	2	8	4507	4514	50 %	25 %	25 %	0 %	169786838
9	NC_010396	ATCC	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	169786839
10	NC_010396	ATTA	2	8	5161	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	169786839
11	NC_010396	ATTC	2	8	5625	5632	25 %	50 %	0 %	25 %	169786840
12	NC_010396	GAAT	2	8	6521	6528	50 %	25 %	25 %	0 %	169786841
13	NC_010396	AATT	2	8	6581	6588	50 %	50 %	0 %	0 %	169786841
14	NC_010396	TCAT	2	8	7432	7439	25 %	50 %	0 %	25 %	169786842
15	NC_010396	GGAT	2	8	7444	7451	25 %	25 %	50 %	0 %	169786842
16	NC_010396	GAAT	2	8	8208	8215	50 %	25 %	25 %	0 %	169786843
17	NC_010396	GAAT	2	8	8742	8749	50 %	25 %	25 %	0 %	169786844
18	NC_010396	CAGC	2	8	8866	8873	25 %	0 %	25 %	50 %	169786844
19	NC_010396	ACTG	2	8	8946	8953	25 %	25 %	25 %	25 %	169786844
20	NC_010396	CAAT	2	8	9809	9816	50 %	25 %	0 %	25 %	169786845
21	NC_010396	TCTT	2	8	10409	10416	0 %	75 %	0 %	25 %	169786846
22	NC_010396	GAAT	2	8	10913	10920	50 %	25 %	25 %	0 %	169786846
23	NC_010396	TAGG	2	8	10942	10949	25 %	25 %	50 %	0 %	169786846
24	NC_010396	CTTA	2	8	12112	12119	25 %	50 %	0 %	25 %	169786847
25	NC_010396	ATTG	2	8	12652	12659	25 %	50 %	25 %	0 %	169786847
26	NC_010396	GTTG	2	8	12915	12922	0 %	50 %	50 %	0 %	169786847
27	NC_010396	TTTA	2	8	13106	13113	25 %	75 %	0 %	0 %	169786847
28	NC_010396	CTAA	2	8	13832	13839	50 %	25 %	0 %	25 %	169786848
29	NC_010396	ATTA	2	8	14236	14243	50 %	50 %	0 %	0 %	169786848
30	NC_010396	ATTT	2	8	15287	15294	25 %	75 %	0 %	0 %	169786849
31	NC_010396	ACTA	2	8	16284	16291	50 %	25 %	0 %	25 %	169786851
32	NC_010396	AACC	2	8	16552	16559	50 %	0 %	0 %	50 %	169786851
33	NC_010396	GCCA	2	8	17042	17049	25 %	0 %	25 %	50 %	169786852
34	NC_010396	TTTA	2	8	17748	17755	25 %	75 %	0 %	0 %	169786853
35	NC_010396	TGAA	2	8	18453	18460	50 %	25 %	25 %	0 %	169786854
36	NC_010396	AGCA	2	8	18577	18584	50 %	0 %	25 %	25 %	169786854
37	NC_010396	AGTA	2	8	18859	18866	50 %	25 %	25 %	0 %	169786854
38	NC_010396	TCCG	2	8	19307	19314	0 %	25 %	25 %	50 %	169786854
39	NC_010396	TTAA	2	8	19462	19469	50 %	50 %	0 %	0 %	169786855
40	NC_010396	TTCT	2	8	19532	19539	0 %	75 %	0 %	25 %	169786855
41	NC_010396	CCAT	2	8	20373	20380	25 %	25 %	0 %	50 %	169786856
42	NC_010396	ACTC	2	8	20467	20474	25 %	25 %	0 %	50 %	169786856
43	NC_010396	TAAT	2	8	22716	22723	50 %	50 %	0 %	0 %	169786860
44	NC_010396	GTTT	2	8	22923	22930	0 %	75 %	25 %	0 %	169786860
45	NC_010396	TATT	2	8	23257	23264	25 %	75 %	0 %	0 %	169786861
46	NC_010396	AGAA	2	8	23662	23669	75 %	0 %	25 %	0 %	169786862
47	NC_010396	GTAT	2	8	23833	23840	25 %	50 %	25 %	0 %	169786862
48	NC_010396	TAAA	2	8	23891	23898	75 %	25 %	0 %	0 %	169786862

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.