MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p2ABSDF

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010396	ACT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010396	ACT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010396	ACT	2	6	415	420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010396	ACT	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010396	GAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
6	NC_010396	TGA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
7	NC_010396	AAG	2	6	773	778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786834
8	NC_010396	TAT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786834
9	NC_010396	TCA	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786834
10	NC_010396	ATG	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
11	NC_010396	TGC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786835
12	NC_010396	ATG	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786835
13	NC_010396	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786835
14	NC_010396	ATA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786835
15	NC_010396	GTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786835
16	NC_010396	AGA	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786835
17	NC_010396	CCA	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786835
18	NC_010396	AGC	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786835
19	NC_010396	ACT	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786835
20	NC_010396	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
21	NC_010396	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
22	NC_010396	TTC	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
23	NC_010396	TTC	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
24	NC_010396	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786836
25	NC_010396	TCT	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
26	NC_010396	CTC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786836
27	NC_010396	GGT	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786836
28	NC_010396	AAG	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786836
29	NC_010396	AAT	2	6	3069	3074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786836
30	NC_010396	CAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
31	NC_010396	AAT	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
32	NC_010396	CTG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
33	NC_010396	GTT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
34	NC_010396	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786837
35	NC_010396	AAC	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786837
36	NC_010396	CTT	2	6	3673	3678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
37	NC_010396	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
38	NC_010396	CTG	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
39	NC_010396	AAT	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
40	NC_010396	TTC	2	6	4018	4023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
41	NC_010396	ATC	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786837
42	NC_010396	TGT	3	9	4107	4115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
43	NC_010396	TGT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
44	NC_010396	ATC	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786838
45	NC_010396	TCT	2	6	4268	4273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786838
46	NC_010396	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
47	NC_010396	TTA	2	6	4526	4531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
48	NC_010396	ATG	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786838
49	NC_010396	ACC	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786838
50	NC_010396	TCT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010396	CAT	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
52	NC_010396	TGC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786839
53	NC_010396	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
54	NC_010396	AAG	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
55	NC_010396	ATT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786839
56	NC_010396	GAG	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786839
57	NC_010396	ATC	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
58	NC_010396	TGA	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786839
59	NC_010396	GTC	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010396	ATT	2	6	5703	5708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010396	ATC	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010396	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010396	TAA	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010396	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010396	ATT	2	6	6080	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010396	CTT	2	6	6088	6093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010396	TTA	2	6	6109	6114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010396	AAT	2	6	6172	6177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010396	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010396	TAA	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010396	TGC	2	6	6250	6255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010396	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786841
73	NC_010396	CAC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786841
74	NC_010396	AAG	2	6	6904	6909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
75	NC_010396	AAG	2	6	6915	6920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
76	NC_010396	TGC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786841
77	NC_010396	AGA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
78	NC_010396	GAA	2	6	7029	7034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
79	NC_010396	ATC	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786842
80	NC_010396	AAT	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786842
81	NC_010396	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786842
82	NC_010396	TCT	2	6	7642	7647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
83	NC_010396	TTC	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
84	NC_010396	GAT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786842
85	NC_010396	AAT	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010396	ATA	2	6	7916	7921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010396	AGG	2	6	8017	8022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786843
88	NC_010396	TCC	2	6	8044	8049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786843
89	NC_010396	CAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786843
90	NC_010396	ATA	2	6	8160	8165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
91	NC_010396	TAA	2	6	8221	8226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
92	NC_010396	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
93	NC_010396	GAT	3	9	8279	8287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
94	NC_010396	GAA	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786843
95	NC_010396	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
96	NC_010396	ATG	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
97	NC_010396	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786844
98	NC_010396	TTA	2	6	8620	8625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786844
99	NC_010396	TTG	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786844
100	NC_010396	GAT	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
101	NC_010396	AAT	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
102	NC_010396	TAA	2	6	8760	8765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
103	NC_010396	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786844
104	NC_010396	TGA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
105	NC_010396	AGT	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
106	NC_010396	GAA	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786844
107	NC_010396	ACC	2	6	9111	9116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786844
108	NC_010396	TTA	2	6	9202	9207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786844
109	NC_010396	TGG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786844
110	NC_010396	CTG	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786844
111	NC_010396	TGG	2	6	9384	9389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786844
112	NC_010396	GTA	2	6	9445	9450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
113	NC_010396	TTA	2	6	9728	9733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786845
114	NC_010396	AGT	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786845
115	NC_010396	GAT	2	6	10010	10015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786845
116	NC_010396	TAA	2	6	10120	10125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786845
117	NC_010396	TTG	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010396	TTC	2	6	10186	10191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010396	GAA	2	6	10211	10216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786846
120	NC_010396	TGT	2	6	10380	10385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786846
121	NC_010396	GAC	2	6	10501	10506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786846
122	NC_010396	TCG	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786846
123	NC_010396	TCG	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786846
124	NC_010396	CAA	2	6	10705	10710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786846
125	NC_010396	GAA	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786846
126	NC_010396	ATC	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786846
127	NC_010396	CAA	2	6	11184	11189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010396	TGT	2	6	11230	11235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010396	CAA	2	6	11241	11246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010396	CAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010396	ATA	2	6	11431	11436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010396	CTT	2	6	11466	11471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010396	CAT	2	6	12018	12023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010396	AGC	2	6	12200	12205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786847
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137	NC_010396	TCT	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786847
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254	NC_010396	TAA	2	6	22356	22361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_010396	AGA	2	6	22762	22767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786860
261	NC_010396	GAT	2	6	22784	22789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786860
262	NC_010396	ACT	2	6	22808	22813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786860
263	NC_010396	AAT	2	6	22907	22912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786860
264	NC_010396	ATT	2	6	22958	22963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786860
265	NC_010396	CAG	4	12	22994	23005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786861
266	NC_010396	TGG	2	6	23106	23111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786861
267	NC_010396	TGG	2	6	23193	23198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786861
268	NC_010396	CTA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786861
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270	NC_010396	ATT	3	9	23377	23385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786861
271	NC_010396	CTT	2	6	23563	23568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786862
272	NC_010396	CTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786862
273	NC_010396	GAA	2	6	23724	23729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786862
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276	NC_010396	GTA	2	6	23914	23919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_010396	TTG	2	6	23967	23972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786863
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281	NC_010396	ATT	2	6	24225	24230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010396	ATT	2	6	24250	24255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010396	ACA	2	6	24303	24308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_010396	GTT	2	6	24474	24479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010396	AAC	2	6	24561	24566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_010396	ATC	2	6	24658	24663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_010396	GTG	2	6	24673	24678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.