MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p2ABSDF

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010396	GAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
2	NC_010396	TGA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
3	NC_010396	AAG	2	6	773	778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786834
4	NC_010396	TAT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786834
5	NC_010396	TCA	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786834
6	NC_010396	ATG	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786834
7	NC_010396	TGC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786835
8	NC_010396	ATG	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786835
9	NC_010396	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786835
10	NC_010396	ATA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786835
11	NC_010396	GTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786835
12	NC_010396	AGA	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786835
13	NC_010396	CCA	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786835
14	NC_010396	AGC	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786835
15	NC_010396	ACT	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786835
16	NC_010396	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
17	NC_010396	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
18	NC_010396	TTC	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
19	NC_010396	TTC	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
20	NC_010396	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786836
21	NC_010396	TCT	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786836
22	NC_010396	CTC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786836
23	NC_010396	GGT	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786836
24	NC_010396	AAG	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786836
25	NC_010396	AAT	2	6	3069	3074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786836
26	NC_010396	CAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786836
27	NC_010396	AAT	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
28	NC_010396	CTG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
29	NC_010396	GTT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
30	NC_010396	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786837
31	NC_010396	AAC	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786837
32	NC_010396	CTT	2	6	3673	3678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
33	NC_010396	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
34	NC_010396	CTG	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786837
35	NC_010396	AAT	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786837
36	NC_010396	TTC	2	6	4018	4023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786837
37	NC_010396	ATC	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786837
38	NC_010396	TGT	3	9	4107	4115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
39	NC_010396	TGT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786837
40	NC_010396	ATC	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786838
41	NC_010396	TCT	2	6	4268	4273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786838
42	NC_010396	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
43	NC_010396	TTA	2	6	4526	4531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786838
44	NC_010396	ATG	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786838
45	NC_010396	ACC	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786838
46	NC_010396	CAT	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
47	NC_010396	TGC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786839
48	NC_010396	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
49	NC_010396	AAG	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786839
50	NC_010396	ATT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786839
51	NC_010396	GAG	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786839
52	NC_010396	ATC	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786839
53	NC_010396	TGA	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786839
54	NC_010396	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786841
55	NC_010396	CAC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786841
56	NC_010396	AAG	2	6	6904	6909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
57	NC_010396	AAG	2	6	6915	6920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
58	NC_010396	TGC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786841
59	NC_010396	AGA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
60	NC_010396	GAA	2	6	7029	7034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786841
61	NC_010396	ATC	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786842
62	NC_010396	AAT	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786842
63	NC_010396	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786842
64	NC_010396	TCT	2	6	7642	7647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
65	NC_010396	TTC	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786842
66	NC_010396	GAT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786842
67	NC_010396	AGG	2	6	8017	8022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786843
68	NC_010396	TCC	2	6	8044	8049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786843
69	NC_010396	CAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786843
70	NC_010396	ATA	2	6	8160	8165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
71	NC_010396	TAA	2	6	8221	8226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786843
72	NC_010396	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
73	NC_010396	GAT	3	9	8279	8287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
74	NC_010396	GAA	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786843
75	NC_010396	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
76	NC_010396	ATG	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786843
77	NC_010396	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786844
78	NC_010396	TTA	2	6	8620	8625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786844
79	NC_010396	TTG	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786844
80	NC_010396	GAT	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
81	NC_010396	AAT	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
82	NC_010396	TAA	2	6	8760	8765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786844
83	NC_010396	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786844
84	NC_010396	TGA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
85	NC_010396	AGT	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
86	NC_010396	GAA	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786844
87	NC_010396	ACC	2	6	9111	9116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786844
88	NC_010396	TTA	2	6	9202	9207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786844
89	NC_010396	TGG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786844
90	NC_010396	CTG	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786844
91	NC_010396	TGG	2	6	9384	9389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786844
92	NC_010396	GTA	2	6	9445	9450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786844
93	NC_010396	TTA	2	6	9728	9733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786845
94	NC_010396	AGT	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786845
95	NC_010396	GAT	2	6	10010	10015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786845
96	NC_010396	TAA	2	6	10120	10125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786845
97	NC_010396	GAA	2	6	10211	10216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786846
98	NC_010396	TGT	2	6	10380	10385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786846
99	NC_010396	GAC	2	6	10501	10506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786846
100	NC_010396	TCG	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786846
101	NC_010396	TCG	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786846
102	NC_010396	CAA	2	6	10705	10710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786846
103	NC_010396	GAA	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786846
104	NC_010396	ATC	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786846
105	NC_010396	AGC	2	6	12200	12205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786847
106	NC_010396	TGT	2	6	12217	12222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786847
107	NC_010396	TTC	2	6	12233	12238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786847
108	NC_010396	TCT	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786847
109	NC_010396	ACC	2	6	12302	12307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786847
110	NC_010396	ATT	2	6	12320	12325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786847
111	NC_010396	CAT	2	6	12347	12352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786847
112	NC_010396	TGT	2	6	12411	12416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786847
113	NC_010396	TTA	3	9	12549	12557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786847
114	NC_010396	CAT	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786847
115	NC_010396	ATG	2	6	12630	12635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786847
116	NC_010396	TCA	2	6	12663	12668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786847
117	NC_010396	TGG	2	6	12715	12720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786847
118	NC_010396	GTT	2	6	12789	12794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169786847
119	NC_010396	AAG	2	6	12944	12949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786847
120	NC_010396	TAC	2	6	13013	13018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786847
121	NC_010396	AAG	2	6	13046	13051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786847
122	NC_010396	TAA	2	6	13078	13083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786847
123	NC_010396	ATT	2	6	13203	13208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786847
124	NC_010396	AAT	2	6	13306	13311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169786848
125	NC_010396	GAT	2	6	13428	13433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786848
126	NC_010396	GAT	2	6	13501	13506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786848
127	NC_010396	ATG	2	6	13537	13542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786848
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129	NC_010396	AAC	2	6	13600	13605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169786848
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.