MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	GCCC	2	8	169	176	0 %	0 %	25 %	75 %	169786810
2	NC_010394	CCGG	2	8	358	365	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
3	NC_010394	GACG	2	8	713	720	25 %	0 %	50 %	25 %	169786810
4	NC_010394	CGGT	2	8	1037	1044	0 %	25 %	50 %	25 %	169786811
5	NC_010394	GATC	2	8	1577	1584	25 %	25 %	25 %	25 %	169786812
6	NC_010394	CGAC	2	8	1774	1781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010394	CGGC	2	8	2247	2254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010394	GCCT	3	12	2392	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	169786813
9	NC_010394	GCTC	2	8	2612	2619	0 %	25 %	25 %	50 %	169786813
10	NC_010394	GAGC	2	8	2752	2759	25 %	0 %	50 %	25 %	169786813
11	NC_010394	TCGG	2	8	3156	3163	0 %	25 %	50 %	25 %	452857699
12	NC_010394	ACGG	2	8	3370	3377	25 %	0 %	50 %	25 %	452857699
13	NC_010394	AACG	2	8	3474	3481	50 %	0 %	25 %	25 %	169786814
14	NC_010394	CGCC	2	8	4504	4511	0 %	0 %	25 %	75 %	169786815
15	NC_010394	CGGT	2	8	5137	5144	0 %	25 %	50 %	25 %	169786815
16	NC_010394	GCTG	2	8	5432	5439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010394	ACTC	2	8	5970	5977	25 %	25 %	0 %	50 %	169786817
18	NC_010394	GACG	2	8	6203	6210	25 %	0 %	50 %	25 %	169786817
19	NC_010394	TGGC	2	8	6461	6468	0 %	25 %	50 %	25 %	169786817
20	NC_010394	CGAG	2	8	7425	7432	25 %	0 %	50 %	25 %	169786818
21	NC_010394	ATCG	2	8	8335	8342	25 %	25 %	25 %	25 %	169786819
22	NC_010394	GCTG	2	8	8478	8485	0 %	25 %	50 %	25 %	169786819
23	NC_010394	GACT	2	8	9266	9273	25 %	25 %	25 %	25 %	169786820
24	NC_010394	TGTC	2	8	9505	9512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010394	CGGG	2	8	10267	10274	0 %	0 %	75 %	25 %	169786822
26	NC_010394	AGGC	2	8	10487	10494	25 %	0 %	50 %	25 %	169786822
27	NC_010394	CGGC	2	8	10852	10859	0 %	0 %	50 %	50 %	169786822
28	NC_010394	GCCG	2	8	11247	11254	0 %	0 %	50 %	50 %	169786822
29	NC_010394	CGGT	2	8	11414	11421	0 %	25 %	50 %	25 %	169786822
30	NC_010394	GTTC	2	8	11712	11719	0 %	50 %	25 %	25 %	169786822
31	NC_010394	TGCA	2	8	11916	11923	25 %	25 %	25 %	25 %	169786822
32	NC_010394	GGCC	2	8	12282	12289	0 %	0 %	50 %	50 %	169786822
33	NC_010394	CTGG	2	8	12333	12340	0 %	25 %	50 %	25 %	169786822
34	NC_010394	AGCG	2	8	13104	13111	25 %	0 %	50 %	25 %	169786823
35	NC_010394	GTTC	2	8	13308	13315	0 %	50 %	25 %	25 %	452857701
36	NC_010394	GGGC	2	8	13425	13432	0 %	0 %	75 %	25 %	452857701
37	NC_010394	GCCG	2	8	13510	13517	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
38	NC_010394	CGGG	2	8	13518	13525	0 %	0 %	75 %	25 %	452857701
39	NC_010394	CCTC	2	8	13594	13601	0 %	25 %	0 %	75 %	452857701
40	NC_010394	CGGT	2	8	13695	13702	0 %	25 %	50 %	25 %	452857701
41	NC_010394	GGTG	2	8	13846	13853	0 %	25 %	75 %	0 %	452857701
42	NC_010394	GCCG	2	8	14188	14195	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
43	NC_010394	GCCG	2	8	14507	14514	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
44	NC_010394	CGGC	2	8	14634	14641	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
45	NC_010394	CGCC	2	8	15076	15083	0 %	0 %	25 %	75 %	452857701
46	NC_010394	AGTG	2	8	15177	15184	25 %	25 %	50 %	0 %	452857701
47	NC_010394	CCAA	2	8	16360	16367	50 %	0 %	0 %	50 %	452857701
48	NC_010394	CGGC	2	8	16404	16411	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
49	NC_010394	CGGC	2	8	16443	16450	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
50	NC_010394	GGGT	2	8	16744	16751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010394	GTGA	2	8	16838	16845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010394	GGCG	2	8	17535	17542	0 %	0 %	75 %	25 %	169786825
53	NC_010394	CAAC	2	8	17587	17594	50 %	0 %	0 %	50 %	169786825
54	NC_010394	CACC	2	8	17952	17959	25 %	0 %	0 %	75 %	169786825
55	NC_010394	AGCC	2	8	17974	17981	25 %	0 %	25 %	50 %	169786825
56	NC_010394	GCTG	2	8	18520	18527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010394	GCGG	2	8	18807	18814	0 %	0 %	75 %	25 %	169786826
58	NC_010394	AGCC	2	8	19108	19115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010394	CCGC	2	8	19165	19172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_010394	TGCC	2	8	19394	19401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010394	ACCG	2	8	19550	19557	25 %	0 %	25 %	50 %	169786827
62	NC_010394	GCGT	2	8	19753	19760	0 %	25 %	50 %	25 %	169786827
63	NC_010394	GCAA	2	8	19769	19776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010394	ATGC	3	12	19812	19823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010394	CCCG	2	8	20077	20084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_010394	GGTG	2	8	20111	20118	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010394	GGAT	2	8	20441	20448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010394	GCTG	2	8	20498	20505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010394	GGGC	2	8	20838	20845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010394	CGGC	2	8	21211	21218	0 %	0 %	50 %	50 %	169786828
71	NC_010394	GGCC	2	8	21651	21658	0 %	0 %	50 %	50 %	169786829
72	NC_010394	TGCA	2	8	22148	22155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010394	ATGT	2	8	22191	22198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010394	CGGC	2	8	22614	22621	0 %	0 %	50 %	50 %	169786830
75	NC_010394	TCGA	2	8	22967	22974	25 %	25 %	25 %	25 %	169786830
76	NC_010394	TGCT	2	8	22997	23004	0 %	50 %	25 %	25 %	169786830

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.