MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	CGA	2	6	227	232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
2	NC_010394	GCC	2	6	270	275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786810
3	NC_010394	CGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
4	NC_010394	CTG	3	9	327	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
5	NC_010394	TGC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
6	NC_010394	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
7	NC_010394	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
8	NC_010394	CGC	2	6	542	547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786810
9	NC_010394	CTT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786810
10	NC_010394	CCA	2	6	703	708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
11	NC_010394	TCA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786810
12	NC_010394	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786810
13	NC_010394	TCG	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
14	NC_010394	GCT	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
15	NC_010394	ACC	2	6	810	815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
16	NC_010394	CCT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786810
17	NC_010394	CCA	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
18	NC_010394	CGT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
19	NC_010394	ACC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
20	NC_010394	TCA	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786811
21	NC_010394	CCG	3	9	1047	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
22	NC_010394	CGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
23	NC_010394	GCC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
24	NC_010394	ACG	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
25	NC_010394	CGA	2	6	1132	1137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
26	NC_010394	ACC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786811
27	NC_010394	GCA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
28	NC_010394	ACC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786812
29	NC_010394	CGG	2	6	1517	1522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786812
30	NC_010394	ACC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786812
31	NC_010394	GGC	2	6	1599	1604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786812
32	NC_010394	CGT	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786812
33	NC_010394	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
34	NC_010394	CGC	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
35	NC_010394	AGC	2	6	1669	1674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786812
36	NC_010394	CGA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786812
37	NC_010394	CCG	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
38	NC_010394	TCG	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786813
39	NC_010394	GGC	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
40	NC_010394	GCG	2	6	2588	2593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
41	NC_010394	CGG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
42	NC_010394	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
43	NC_010394	CGC	2	6	2709	2714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
44	NC_010394	GCC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
45	NC_010394	CGG	2	6	2801	2806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
46	NC_010394	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786813
47	NC_010394	ATC	3	9	2839	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786813
48	NC_010394	CAG	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786813
49	NC_010394	TCT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857699
50	NC_010394	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857699
51	NC_010394	GGC	2	6	3194	3199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857699
52	NC_010394	CGG	2	6	3215	3220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857699
53	NC_010394	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452857699
54	NC_010394	CCG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857699
55	NC_010394	GCA	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
56	NC_010394	CAG	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
57	NC_010394	GCA	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
58	NC_010394	CCA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452857699
59	NC_010394	CGG	3	9	3421	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
60	NC_010394	GCG	3	9	3453	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
61	NC_010394	CGG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
62	NC_010394	CGG	2	6	3546	3551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
63	NC_010394	GAA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786814
64	NC_010394	CCA	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786814
65	NC_010394	ATC	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786815
66	NC_010394	CGG	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
67	NC_010394	GCG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
68	NC_010394	CGC	3	9	3964	3972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
69	NC_010394	CGC	2	6	3976	3981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
70	NC_010394	CAC	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
71	NC_010394	GTG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786815
72	NC_010394	CCA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
73	NC_010394	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
74	NC_010394	GCT	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
75	NC_010394	CGC	3	9	4075	4083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
76	NC_010394	CGC	2	6	4129	4134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
77	NC_010394	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786815
78	NC_010394	GCG	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
79	NC_010394	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
80	NC_010394	CGT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
81	NC_010394	TCG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
82	NC_010394	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
83	NC_010394	CGG	2	6	4309	4314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
84	NC_010394	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786815
85	NC_010394	ACC	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
86	NC_010394	CGG	3	9	4465	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
87	NC_010394	GTG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786815
88	NC_010394	GCT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
89	NC_010394	CCG	2	6	4554	4559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
90	NC_010394	CGA	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786815
91	NC_010394	CCG	2	6	4674	4679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
92	NC_010394	GCT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
93	NC_010394	GCC	2	6	4737	4742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
94	NC_010394	CCG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
95	NC_010394	TCG	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
96	NC_010394	CCA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
97	NC_010394	GGA	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786815
98	NC_010394	CGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
99	NC_010394	GCC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
100	NC_010394	CCG	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
101	NC_010394	CCG	3	9	5025	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
102	NC_010394	TCG	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
103	NC_010394	CCG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
104	NC_010394	CGT	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
105	NC_010394	TCA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786815
106	NC_010394	CCG	2	6	5190	5195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
107	NC_010394	AGC	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786815
108	NC_010394	CGC	2	6	5284	5289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
109	NC_010394	ACC	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
110	NC_010394	CTG	2	6	5323	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
111	NC_010394	GCT	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786816
112	NC_010394	CGC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786816
113	NC_010394	GCT	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786816
114	NC_010394	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786816
115	NC_010394	ATC	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786816
116	NC_010394	CGG	2	6	5721	5726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786816
117	NC_010394	CCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786816
118	NC_010394	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786816
119	NC_010394	CTG	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786816
120	NC_010394	ATC	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786816
121	NC_010394	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786816
122	NC_010394	GGC	2	6	5978	5983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786817
123	NC_010394	GCT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786817
124	NC_010394	CCT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786817
125	NC_010394	ACG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786817
126	NC_010394	CAT	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786817
127	NC_010394	CCG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786817
128	NC_010394	CCA	2	6	6418	6423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786817
129	NC_010394	CTT	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786817
130	NC_010394	CGT	2	6	6487	6492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786817
131	NC_010394	GCC	2	6	6519	6524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786817
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382	NC_010394	GTC	2	6	21760	21765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786829
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.