MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	CG	3	6	73	78	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010394	CG	3	6	185	190	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
3	NC_010394	GC	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
4	NC_010394	GC	3	6	822	827	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
5	NC_010394	GC	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	169786811
6	NC_010394	AC	3	6	2021	2026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010394	GC	3	6	2466	2471	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
8	NC_010394	CG	3	6	2566	2571	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
9	NC_010394	GA	3	6	2692	2697	50 %	0 %	50 %	0 %	169786813
10	NC_010394	CG	3	6	2945	2950	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
11	NC_010394	GC	3	6	3697	3702	0 %	0 %	50 %	50 %	169786814
12	NC_010394	CT	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	169786815
13	NC_010394	CG	3	6	4791	4796	0 %	0 %	50 %	50 %	169786815
14	NC_010394	GC	3	6	6228	6233	0 %	0 %	50 %	50 %	169786817
15	NC_010394	CA	3	6	6970	6975	50 %	0 %	0 %	50 %	169786818
16	NC_010394	CG	3	6	7141	7146	0 %	0 %	50 %	50 %	169786818
17	NC_010394	GC	3	6	7254	7259	0 %	0 %	50 %	50 %	169786818
18	NC_010394	CG	3	6	7282	7287	0 %	0 %	50 %	50 %	169786818
19	NC_010394	CG	3	6	8154	8159	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
20	NC_010394	GC	3	6	8409	8414	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
21	NC_010394	CG	3	6	8525	8530	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
22	NC_010394	AC	4	8	9404	9411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010394	CG	3	6	10367	10372	0 %	0 %	50 %	50 %	169786822
24	NC_010394	GT	3	6	11240	11245	0 %	50 %	50 %	0 %	169786822
25	NC_010394	GC	3	6	11829	11834	0 %	0 %	50 %	50 %	169786822
26	NC_010394	CG	3	6	12765	12770	0 %	0 %	50 %	50 %	169786823
27	NC_010394	GA	3	6	13130	13135	50 %	0 %	50 %	0 %	169786823
28	NC_010394	GC	3	6	13215	13220	0 %	0 %	50 %	50 %	169786823
29	NC_010394	GC	3	6	13891	13896	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
30	NC_010394	CG	3	6	13944	13949	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
31	NC_010394	CG	4	8	14527	14534	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
32	NC_010394	CG	3	6	14735	14740	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
33	NC_010394	CG	3	6	15498	15503	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
34	NC_010394	CG	3	6	15524	15529	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
35	NC_010394	CG	3	6	15563	15568	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
36	NC_010394	TG	3	6	15804	15809	0 %	50 %	50 %	0 %	452857701
37	NC_010394	CG	3	6	16007	16012	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
38	NC_010394	CG	3	6	16548	16553	0 %	0 %	50 %	50 %	452857701
39	NC_010394	GC	3	6	16655	16660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010394	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010394	CA	3	6	16687	16692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010394	GA	3	6	16810	16815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010394	GC	3	6	16904	16909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010394	GC	3	6	16957	16962	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
45	NC_010394	GC	3	6	17107	17112	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
46	NC_010394	GC	3	6	17317	17322	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
47	NC_010394	CG	3	6	17353	17358	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
48	NC_010394	CG	3	6	17482	17487	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
49	NC_010394	GC	3	6	17491	17496	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
50	NC_010394	CG	3	6	17547	17552	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
51	NC_010394	CG	3	6	17817	17822	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
52	NC_010394	GC	3	6	17930	17935	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
53	NC_010394	CG	3	6	17982	17987	0 %	0 %	50 %	50 %	169786825
54	NC_010394	CG	4	8	18024	18031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010394	CG	3	6	18182	18187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010394	CG	3	6	19066	19071	0 %	0 %	50 %	50 %	169786826
57	NC_010394	GC	3	6	19659	19664	0 %	0 %	50 %	50 %	169786827
58	NC_010394	GC	3	6	19875	19880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010394	CT	3	6	20514	20519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010394	CG	3	6	20831	20836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010394	GA	3	6	20876	20881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010394	GC	4	8	20919	20926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010394	CG	3	6	21051	21056	0 %	0 %	50 %	50 %	169786828
64	NC_010394	TG	3	6	21075	21080	0 %	50 %	50 %	0 %	169786828
65	NC_010394	GC	3	6	21264	21269	0 %	0 %	50 %	50 %	169786828
66	NC_010394	GC	3	6	21772	21777	0 %	0 %	50 %	50 %	169786829
67	NC_010394	CT	3	6	23077	23082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.