MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010382	ATAAA	2	10	8565	8574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010382	AAGAG	2	10	9755	9764	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010382	GTAAA	2	10	9777	9786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010382	AATAT	2	10	9820	9829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010382	TCGTG	2	10	11172	11181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010382	AAGGT	2	10	12867	12876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010382	AAATT	2	10	15419	15428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010382	TCGTG	2	10	17891	17900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010382	AAGGT	2	10	19585	19594	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010382	ATGGG	2	10	30495	30504	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010382	TATAT	2	10	43736	43745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010382	GCAAT	2	10	43921	43930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010382	AGATC	2	10	44268	44277	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010382	TTGCT	2	10	45074	45083	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010382	CTATT	2	10	45610	45619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010382	TCGTG	2	10	50317	50326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010382	AAGGT	2	10	52011	52020	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010382	TCTTT	2	10	60898	60907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010382	TAGAA	2	10	63571	63580	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010382	ATATT	2	10	69684	69693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010382	AAAGG	2	10	75876	75885	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010382	TTTTA	2	10	106499	106508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010382	TCGTG	2	10	110314	110323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010382	AAGGT	2	10	112007	112016	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010382	TAAAA	2	10	134993	135002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010382	TACAA	2	10	145947	145956	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010382	ATTAT	2	10	154696	154705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010382	AATGT	2	10	154768	154777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010382	ATTTA	2	10	155045	155054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010382	ATTGG	2	10	171899	171908	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010382	TAAAC	2	10	183996	184005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010382	TTTGG	2	10	185446	185455	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010382	TATTT	2	10	199062	199071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010382	ATGAA	2	10	203305	203314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010382	GCAGA	2	10	203909	203918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010382	ATCAA	2	10	205949	205958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010382	ACTTT	2	10	217434	217443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010382	TATTT	2	10	220125	220134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010382	TAAAT	2	10	220194	220203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010382	TTTAT	2	10	221938	221947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010382	TCGTG	2	10	223283	223292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010382	AAGGT	2	10	224814	224823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010382	TAAAA	2	10	227336	227345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010382	GAATG	2	10	227426	227435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010382	TAGAT	2	10	255286	255295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010382	TTTTA	2	10	278975	278984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010382	ACTAT	2	10	287069	287078	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010382	AAAAT	2	10	294080	294089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010382	TGAGT	2	10	296887	296896	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010382	GAATG	2	10	307139	307148	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010382	CGAAA	2	10	307170	307179	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010382	AATCA	2	10	307564	307573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010382	GTTAT	2	10	308314	308323	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010382	ACTAG	2	10	312679	312688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010382	TCATT	2	10	316008	316017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010382	TAAAG	2	10	322554	322563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010382	TAAAT	2	10	331106	331115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010382	TCGTG	2	10	358832	358841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010382	AAGGT	2	10	360363	360372	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010382	TATAA	2	10	363820	363829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010382	TAATT	2	10	371846	371855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010382	AGGAA	2	10	373504	373513	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010382	ATAAC	2	10	374312	374321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010382	AATGT	2	10	376834	376843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010382	AATTA	2	10	388576	388585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010382	AAGAA	2	10	398650	398659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010382	TGTCC	2	10	405486	405495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010382	AGAAA	2	10	420583	420592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010382	GCTTT	2	10	420645	420654	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010382	AATTG	2	10	421735	421744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010382	ATGAT	2	10	478952	478961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010382	TCTTT	2	10	479434	479443	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010382	ATATA	2	10	482143	482152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010382	ACAAA	2	10	487969	487978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010382	CCTTA	2	10	493671	493680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010382	GTATA	2	10	497563	497572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010382	ATTTT	2	10	507957	507966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010382	TGGTT	2	10	515808	515817	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010382	TATAT	2	10	525693	525702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010382	TAATA	2	10	535772	535781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010382	CTTAT	2	10	537030	537039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010382	TATTC	2	10	543470	543479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010382	AGTAT	2	10	551733	551742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010382	CTTTT	2	10	563371	563380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010382	AAACA	2	10	571560	571569	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010382	TATAG	2	10	572892	572901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010382	TTTTG	2	10	578506	578515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010382	AATGA	2	10	581452	581461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010382	CTTTT	2	10	586488	586497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010382	CTTTA	2	10	587028	587037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010382	TGATG	2	10	587106	587115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010382	AAGGA	2	10	591759	591768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010382	TGATA	2	10	592908	592917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010382	TTTTA	2	10	594135	594144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010382	ATGGA	2	10	601116	601125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010382	TTATA	2	10	622554	622563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010382	TTTTA	2	10	630757	630766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010382	TTTTA	2	10	642930	642939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010382	TAATT	2	10	643067	643076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010382	TGTTT	2	10	643870	643879	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010382	TAATA	2	10	644024	644033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010382	TATAT	2	10	644310	644319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010382	TCGTG	2	10	645649	645658	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010382	AAGGT	2	10	647179	647188	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010382	ATTTA	2	10	682547	682556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010382	TGCCT	2	10	693475	693484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010382	TAAAA	2	10	693488	693497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010382	AAATG	2	10	708588	708597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010382	TAATT	2	10	732870	732879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010382	TCGTG	2	10	759790	759799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010382	AAGGT	2	10	761319	761328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010382	AAGTG	2	10	763557	763566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010382	TCGCT	2	10	763667	763676	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010382	TCCTT	2	10	765258	765267	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010382	ATTTT	2	10	802171	802180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010382	TTGTT	2	10	805620	805629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010382	CAAGA	2	10	812817	812826	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010382	AATTC	2	10	813465	813474	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010382	CTCTT	2	10	820060	820069	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010382	TATCA	2	10	823942	823951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010382	GTCAA	2	10	836798	836807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010382	TTTAT	2	10	842051	842060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010382	TGAAA	2	10	842158	842167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010382	TTGAT	2	10	850032	850041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010382	CTTTA	2	10	851810	851819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010382	TTCCA	2	10	854316	854325	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010382	TTTTA	2	10	868280	868289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010382	TTTAA	2	10	873779	873788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010382	TAAGT	2	10	880806	880815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010382	TGGGG	2	10	888795	888804	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010382	AGCTA	2	10	892344	892353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010382	GAAAG	2	10	912104	912113	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010382	AGATG	2	10	927710	927719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010382	ATAAA	2	10	930633	930642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010382	AGTTG	2	10	939771	939780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010382	TCGTG	2	10	940940	940949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010382	AAGGT	2	10	942635	942644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010382	GTCTT	2	10	945797	945806	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010382	AGAAA	2	10	945990	945999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010382	AATAG	2	10	957276	957285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010382	ATATT	2	10	966529	966538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010382	AAGAA	2	10	991292	991301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010382	TAGAA	2	10	992044	992053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010382	TAAAA	2	10	1000444	1000453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010382	ATCAC	2	10	1006523	1006532	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010382	AAAAG	2	10	1007667	1007676	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010382	TATAA	2	10	1018212	1018221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_010382	GTAAT	2	10	1879225	1879234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010382	GGTTC	2	10	1879480	1879489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_010382	GAAAT	2	10	2419169	2419178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_010382	GAAAT	2	10	2448743	2448752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_010382	CGAAG	2	10	2477544	2477553	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
412	NC_010382	AAATT	2	10	2488274	2488283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_010382	CCTCA	2	10	2491580	2491589	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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420	NC_010382	ATAAG	2	10	2517801	2517810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
421	NC_010382	TTTTC	2	10	2523632	2523641	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
422	NC_010382	AATCA	2	10	2523731	2523740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
423	NC_010382	TCTTT	2	10	2527777	2527786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_010382	GAAGG	2	10	2540480	2540489	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_010382	AATGG	2	10	2548397	2548406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
428	NC_010382	TCATT	2	10	2553878	2553887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_010382	AATCT	2	10	2553941	2553950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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438	NC_010382	TAAAA	2	10	2577601	2577610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010382	ATATC	2	10	2577751	2577760	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
440	NC_010382	AGAAA	2	10	2579044	2579053	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
441	NC_010382	TAAAA	2	10	2579136	2579145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_010382	GAACT	2	10	2579202	2579211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
443	NC_010382	TTATA	2	10	2582628	2582637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010382	GTAAT	2	10	2585394	2585403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
445	NC_010382	AACTT	2	10	2590203	2590212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
446	NC_010382	AACAT	2	10	2590508	2590517	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
447	NC_010382	GAACC	2	10	2590639	2590648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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449	NC_010382	AGTTT	2	10	2602531	2602540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
450	NC_010382	AGACC	2	10	2609618	2609627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
451	NC_010382	TTGAT	2	10	2609832	2609841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_010382	ATATT	2	10	2617846	2617855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010382	TTCAT	2	10	2620110	2620119	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_010382	TGATT	2	10	2621303	2621312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_010382	AGTTT	2	10	2628402	2628411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
459	NC_010382	TTGTA	2	10	2633824	2633833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010382	TTTTA	2	10	2636918	2636927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010382	TAAAA	2	10	2636970	2636979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_010382	TAGAG	2	10	2637007	2637016	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
464	NC_010382	TGAAA	2	10	2639573	2639582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
465	NC_010382	CATTA	2	10	2641140	2641149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
466	NC_010382	AAATT	2	10	2641156	2641165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_010382	TTACA	2	10	2654580	2654589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
471	NC_010382	AGCGA	2	10	2658042	2658051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
472	NC_010382	CTTTA	2	10	2658108	2658117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
473	NC_010382	GTAAT	2	10	2661919	2661928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
474	NC_010382	ATTTT	2	10	2672042	2672051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_010382	TAAAA	2	10	2684495	2684504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_010382	TTTTG	2	10	2685360	2685369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
477	NC_010382	TACTT	2	10	2686255	2686264	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_010382	TTCCT	2	10	2691303	2691312	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
480	NC_010382	GAATC	2	10	2692433	2692442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
481	NC_010382	TTATA	2	10	2694822	2694831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_010382	TTAAA	2	10	2707173	2707182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_010382	TGTAA	2	10	2707264	2707273	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
485	NC_010382	AAAAG	2	10	2709436	2709445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
486	NC_010382	AATTA	2	10	2711886	2711895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_010382	AGTTG	2	10	2719593	2719602	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
488	NC_010382	TCGCA	2	10	2724520	2724529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
489	NC_010382	GTTTA	2	10	2725898	2725907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
490	NC_010382	ATATT	2	10	2728445	2728454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_010382	ATATA	2	10	2742613	2742622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_010382	GAAAA	2	10	2752190	2752199	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_010382	TGAAA	2	10	2768366	2768375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
496	NC_010382	ATACA	2	10	2771672	2771681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
497	NC_010382	CAGGT	2	10	2772341	2772350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
498	NC_010382	TTTAA	2	10	2772430	2772439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010382	TTAAT	2	10	2773578	2773587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_010382	ATTTA	2	10	2774298	2774307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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