MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 66135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010382	TTA	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010382	TGT	2	6	86	91	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010382	TGC	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825619
4	NC_010382	TTC	2	6	292	297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825619
5	NC_010382	GGT	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825619
6	NC_010382	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825619
7	NC_010382	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825619
8	NC_010382	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825619
9	NC_010382	AAG	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825619
10	NC_010382	CCT	2	6	601	606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825619
11	NC_010382	TAA	2	6	660	665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010382	CCT	2	6	677	682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010382	CGT	2	6	816	821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825620
14	NC_010382	TGC	2	6	864	869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010382	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825621
16	NC_010382	GAA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825622
17	NC_010382	TGG	2	6	1081	1086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825622
18	NC_010382	TCT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825622
19	NC_010382	TTG	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825622
20	NC_010382	CAA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825622
21	NC_010382	CTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010382	TTA	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
23	NC_010382	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825623
24	NC_010382	AAC	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
25	NC_010382	GAA	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
26	NC_010382	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
27	NC_010382	TTG	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825623
28	NC_010382	CAA	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
29	NC_010382	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825623
30	NC_010382	ATT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
31	NC_010382	CTG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825623
32	NC_010382	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
33	NC_010382	TTA	2	6	2042	2047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
34	NC_010382	CAG	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825623
35	NC_010382	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
36	NC_010382	TCT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825623
37	NC_010382	AGA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
38	NC_010382	TTA	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
39	NC_010382	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825623
40	NC_010382	TGT	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825623
41	NC_010382	TCA	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825623
42	NC_010382	TCT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825623
43	NC_010382	AAG	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
44	NC_010382	GAG	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825624
45	NC_010382	TCA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825624
46	NC_010382	GAT	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825624
47	NC_010382	ATG	2	6	2885	2890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
48	NC_010382	AAC	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825625
49	NC_010382	CGT	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825625
50	NC_010382	AGA	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825625
51	NC_010382	TTA	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
52	NC_010382	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825625
53	NC_010382	ATG	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
54	NC_010382	ATT	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
55	NC_010382	TTC	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825625
56	NC_010382	TGA	2	6	3645	3650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
57	NC_010382	ATG	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
58	NC_010382	CAG	2	6	3703	3708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825625
59	NC_010382	TAC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825625
60	NC_010382	GAT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
61	NC_010382	GAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
62	NC_010382	TTA	2	6	3832	3837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
63	NC_010382	TCA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825625
64	NC_010382	ATG	2	6	4033	4038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010382	CAA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
66	NC_010382	ATA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825626
67	NC_010382	AGA	2	6	4295	4300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825626
68	NC_010382	CTG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
69	NC_010382	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
70	NC_010382	TGG	3	9	4394	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
71	NC_010382	GGT	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
72	NC_010382	ATT	2	6	4548	4553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
73	NC_010382	AAC	3	9	4574	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
74	NC_010382	ACT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825626
75	NC_010382	TGA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
76	NC_010382	GAG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825626
77	NC_010382	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
78	NC_010382	TCT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
79	NC_010382	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825626
80	NC_010382	GGT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
81	NC_010382	TTG	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
82	NC_010382	AAG	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825626
83	NC_010382	GTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
84	NC_010382	CGT	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
85	NC_010382	TTC	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
86	NC_010382	TTG	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
87	NC_010382	GGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825626
88	NC_010382	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
89	NC_010382	TTC	3	9	5619	5627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
90	NC_010382	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825626
91	NC_010382	ATG	3	9	5722	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
92	NC_010382	AAC	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
93	NC_010382	TAC	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825626
94	NC_010382	ATT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
95	NC_010382	GAT	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
96	NC_010382	TCG	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
97	NC_010382	GAG	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010382	AGA	2	6	6057	6062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825627
99	NC_010382	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
100	NC_010382	CAG	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825627
101	NC_010382	TTG	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825627
102	NC_010382	ATG	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
103	NC_010382	TGC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
104	NC_010382	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825627
105	NC_010382	ATC	2	6	6646	6651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825627
106	NC_010382	CAT	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825627
107	NC_010382	TGA	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
108	NC_010382	CGT	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
109	NC_010382	AGT	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
110	NC_010382	ATT	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
111	NC_010382	TTA	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
112	NC_010382	TCG	3	9	7098	7106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
113	NC_010382	TGA	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
114	NC_010382	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825627
115	NC_010382	ATT	2	6	7198	7203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
116	NC_010382	GTG	2	6	7217	7222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
117	NC_010382	AAG	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825627
118	NC_010382	TTG	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825627
119	NC_010382	GGT	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
120	NC_010382	GTG	2	6	7607	7612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
121	NC_010382	GAT	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
122	NC_010382	TGA	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
123	NC_010382	GAT	3	9	7948	7956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
124	NC_010382	ATC	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825627
125	NC_010382	GAT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
126	NC_010382	TGG	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
127	NC_010382	AGT	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
128	NC_010382	TTG	2	6	8123	8128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825627
129	NC_010382	TAG	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
130	NC_010382	GAT	2	6	8188	8193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
131	NC_010382	GTG	2	6	8210	8215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
132	NC_010382	TGG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
133	NC_010382	TTA	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
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153	NC_010382	GGC	2	6	10131	10136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_010382	CCA	2	6	18615	18620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
266	NC_010382	TAT	2	6	18690	18695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010382	TAA	2	6	18701	18706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_010382	GCA	2	6	18740	18745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_010382	TTA	2	6	18842	18847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_010382	GTA	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_010382	GGA	2	6	19047	19052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010382	GCG	2	6	19081	19086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_010382	CGG	2	6	19255	19260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_010382	AGG	2	6	21019	21024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_010382	GAG	2	6	21504	21509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010382	GTG	2	6	21714	21719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_010382	GAA	2	6	21915	21920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_010382	ATT	2	6	22101	22106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_010382	CTT	2	6	28597	28602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825634
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