MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010381	CAATTA	2	12	5817	5828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169825418
2	NC_010381	AAAGTA	2	12	6522	6533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169825418
3	NC_010381	TATCGA	2	12	6671	6682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169825418
4	NC_010381	TCAGAT	2	12	8053	8064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169825420
5	NC_010381	TGATAT	2	12	9187	9198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825422
6	NC_010381	ACTCAA	2	12	9841	9852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169825423
7	NC_010381	TGAAAA	2	12	10183	10194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169825424
8	NC_010381	TGGAGG	2	12	12541	12552	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	169825427
9	NC_010381	TGAAAA	2	12	19398	19409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169825434
10	NC_010381	GTAAAG	2	12	20028	20039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169825434
11	NC_010381	AATTTA	2	12	22936	22947	50 %	50 %	0 %	0 %	169825437
12	NC_010381	GAGCAA	2	12	24491	24502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	169825439
13	NC_010381	GCTGAA	2	12	26213	26224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169825441
14	NC_010381	TAAATA	2	12	27454	27465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825443
15	NC_010381	AAATGA	2	12	29488	29499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169825445
16	NC_010381	ATTGAT	2	12	30608	30619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825447
17	NC_010381	ATACAT	2	12	32870	32881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169825450
18	NC_010381	AAATTA	2	12	41832	41843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825456
19	NC_010381	AATCAA	2	12	44666	44677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169825458
20	NC_010381	TCTATA	2	12	48672	48683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010381	TGTGCA	2	12	49656	49667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169825463
22	NC_010381	AAAAGG	2	12	50862	50873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825465
23	NC_010381	TTAATT	2	12	58124	58135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825469
24	NC_010381	TATTTA	2	12	60830	60841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825471
25	NC_010381	TTATGT	2	12	60905	60916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169825471
26	NC_010381	CTATTA	2	12	61886	61897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169825473
27	NC_010381	CCAAAT	2	12	67131	67142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169825481
28	NC_010381	TGTTAG	2	12	71896	71907	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169825485
29	NC_010381	TAAAAT	2	12	73485	73496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825486
30	NC_010381	ATCAGA	2	12	77640	77651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169825497
31	NC_010381	ATTTTT	2	12	77736	77747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010381	ACATTT	2	12	80176	80187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169825499
33	NC_010381	CCAAAA	2	12	80539	80550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825500
34	NC_010381	TTTGTT	2	12	81920	81931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	169825501
35	NC_010381	AAAATT	2	12	89616	89627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825511
36	NC_010381	CCTTTT	2	12	91057	91068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010381	ATATCA	2	12	92833	92844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169825515
38	NC_010381	GGTGCT	2	12	99399	99410	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	169825524
39	NC_010381	TCAAAT	2	12	99651	99662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169825524
40	NC_010381	GTTTCT	2	12	101485	101496	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825529
41	NC_010381	ATACCT	2	12	102550	102561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825529
42	NC_010381	TTTGGT	2	12	102886	102897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825529
43	NC_010381	ATCAAA	2	12	103991	104002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169825530
44	NC_010381	GCATTG	2	12	107245	107256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169825532
45	NC_010381	AGATGG	2	12	116158	116169	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169825544
46	NC_010381	CAAAAG	2	12	117587	117598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169825545
47	NC_010381	TTAATT	2	12	118479	118490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825546
48	NC_010381	ATTTTC	2	12	121325	121336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169825552
49	NC_010381	ATATTA	2	12	128076	128087	50 %	50 %	0 %	0 %	169825559
50	NC_010381	AACCAT	2	12	139973	139984	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169825569
51	NC_010381	TGTAAT	2	12	147915	147926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825572
52	NC_010381	ACTTTG	2	12	149687	149698	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169825572
53	NC_010381	TATAAA	2	12	150914	150925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010381	TTGCTT	2	12	159102	159113	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825585
55	NC_010381	CTGTCA	2	12	169503	169514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169825593
56	NC_010381	ACTAAA	2	12	169855	169866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169825594
57	NC_010381	AAGTCA	2	12	170672	170683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169825595
58	NC_010381	ATTTGA	2	12	171011	171022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825595
59	NC_010381	TGCTTT	2	12	171180	171191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825596
60	NC_010381	TCTTGT	2	12	172817	172828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825597
61	NC_010381	GTATCT	2	12	172838	172849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169825597
62	NC_010381	TTTTCA	2	12	174090	174101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169825598

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.